EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00289 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:12916403-12917538 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HAND2MA1492.1chr1:12917028-12917038TGCAGGTGTT-6.02
PROX1MA0794.1chr1:12917117-12917129CAAGACGTCTTC+6.22
Sox6MA0515.1chr1:12916779-12916789AAAACAATGG-6.02
Enhancer Sequence
ATGACTGAAA TTTTCAGTTG ACCCACCAAT GGCGTGTGAA CCCAAATTAT GGGTATTATC 60
ACTTATAGTA TCATTTGAAG CAGCTCTATG CTTCCTGATC ATGTGAGTTG TAAAAGACGA 120
TTGATTGTAA AAGTATTACA ACCCGTTACT GGACAAGACA CAGGTCGGCC ATCTGCTAAA 180
TGCTCTTTTA AGTGGCTTAT TAAATCTTTA GCCGTGTTAA ACGTGCGGTC ACACAACAAA 240
ATGGAACATT TAAATCAGCA AAAACTGCTT TAGTACTAAC GGTTGAGGCA AACTCAATGT 300
GATCCCTATA GACATGTGCT TTTAATGCAG CGTAAGCGCA AAATGTTCGC ATACAGCCAG 360
CAATAACACA TTTGAAAAAA CAATGGGGTT CGTTTCTGTG AACTTTACAA TGCAACACAT 420
AACGTTAACG TCTCAGTGTG TCAAGTGTTT TGTTGCAAAA ATGACACGTA ACGTTAATCA 480
TCTTTAGACT TCTAACAAAA TCTTCAGTTT TTTCAGCTTT ACGTTAGTCG GACGATACGA 540
CAAGTGGCCG AGTTACCTTT GCATTGTAAC ACAGATTATT ATTCCGAAGA CCGTGCAACA 600
CCCCAAATAA TACCCTCTCC TTTTTTGCAG GTGTTTGTAT GGTAAAGCGT TTAAAGTACA 660
AAGTAAACCA ACTTTTTACT AAACTTACCA GTGCCTCGGT AGTTAGAAAT GCTGCAAGAC 720
GTCTTCCACA GCTTTTTCTC GCGGGCAGGA CAGATTGAGC GCGCGCTCTC ACAAACAATA 780
TCTGTAAAAT GGCTGCTCCC GCAAGAATCA GATTGGTGAT TGGACAAGGC AGAACAGAGT 840
TTGAAATTCA AACGCAGACG TTAATTTACG CAAAAGCATA CATTTTAAAT AGAAACACAT 900
CGCAAAAATA AAGGACCCTT GGGGACAAAT AACCCTTATC TTTCTATGTA AGCCTACATT 960
AAATATGATA ATTAGCAAAG CTAAAATAGC TTATAGACCA TAAGGACAAT TCTAAACAGA 1020
CACATTGCCT TAAAACCCCT CATTTAAAAC TTGTAAATAT GTCATGTAGG ATAACATTTG 1080
TGATAGTTCT ACTTGCTTAC ACTTGCTTTT TTATCTGTAA TAGCTGATTT TTGTT 1135