EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00287 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:12799539-12800710 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr1:12799899-12799912TTTAAGTGGTTGT-6.57
Enhancer Sequence
TATAACAAGC TTATTGCTTT ACATGGCTAA ACATTTATTT TATGCCTGCA TGATTCACTG 60
CTATTACTGT AACCCATTAC ACTCTTAACC CAAACTAGTT GACTTTATTA GAAAACTGCA 120
TCGAAACATG TTGCCTTAAA CCCTTTATGT TTTTACACAA GGTGAAACTA AACAGCCTAC 180
TTTAAATTAA CCTAGAACCT TTACAATCTT CTTGAACTTA CAGTAATATT TTAATTCAAG 240
TATGGCTGTT AAGTTGTACC TTGTATAAAA TGTAATGGGT TTAAGCCACT GGGTTTCTAT 300
ACAATTTTCT AGTAAAGTCA ACTAGATTGG GTTAAAGGAA CAGTTCACTA TTTACTCTCC 360
TTTAAGTGGT TGTAAACCTT TTTTAAAAAC TTCCAAGTTA CTTTGTGTTG AACATGAAGG 420
AAGTTTTTTG AAGAAAGCTG GAAAGCTGAA AACATTGACA TACATAGTAG GAAAAAACAA 480
ATACTATGGA AGTTAATGTT TGCAGGTTTT CATCTTTCTT TAAAATATAA TTTTTTTTGT 540
GTTTAACTGA AGTAAGCAAG TCAGACATAT TTGGAACAAG TGAAGGATGA GTCAATAATG 600
ACAGAATTTT CATTTTTGGG TGAATCTCTT TAAGAGTATA CTGAAAGAAA TGTCCTACTC 660
AATGAAGCTA ACTTCAGCTG CATGTGTAGC CCCATGAGTA CTTATCTAGA AATCAAAACA 720
ATGATCACGT CAGTCCCATT TTAGGCCCTT TATATCATAT TGGCCACAGA ATGGACTACT 780
TAGTGTTGCA ATAAAATAAA AAAATTAATA AAACTATGAC TTACCACACA ATACAAGACA 840
AACAGTGAAT TTTCAGCTCT GCCTTTGCTG TACACAAGAT GAGGTTCCAG CTTCAACACT 900
GATCTGAGTG GGGCAGTTGT GCAGCTCTGT GAGGTTGTGA CTGTTCAGGT GCAGTGCTGT 960
GAAGAGTTCT TTATTAAAAG AAAGTACATT CTTTTAAAAT CTGTACATAA TAACAAAGAA 1020
AATACAATGA TTTTAAATAA TGATTAATTC TGAACAAAAA CATTACCCTT AGTCAAGATG 1080
AATTCATATG TCAAAAGTTT CTGCATCTGA AATGAATAAA AACAGATGTG ACATTAGTTA 1140
AACCCACTAA ACTAATAGAT ACATCAGTAC T 1171