EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00226 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:9669201-9670648 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr1:9669941-9669951GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr1:9669941-9669951GTCACGTGAC-6.02
LMX1BMA0703.2chr1:9670385-9670396ATTTTAATTAA+6.62
MITFMA0620.2chr1:9669937-9669955GAAGGTCACGTGACATAC+7.31
MITFMA0620.2chr1:9669937-9669955GAAGGTCACGTGACATAC-7.31
STAT3MA0144.2chr1:9670116-9670127CTTCTGGGAAG+6.14
USF1MA0093.2chr1:9669940-9669951GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr1:9669937-9669953GAAGGTCACGTGACAT+6.02
Enhancer Sequence
TCAGCAGGAT AGCGCTTCTC CTCATACTTC AGCCTCCACA TTAAATTTCC TGAAAGCAAA 60
GAAGGTCAAG GTGCTCCAGG ATTGGGCAGC CCAGTCACTA GGCATGAACA TTATTGATCA 120
TGTTGGGGTA GGATGAAGGA GGAGGCATTG AAGATGAATC CATAGAATCT TGGTGAACTC 180
TTGGAGTCCT GCAAGAACGG TTTCTTTGCC ATTCTTTATT AATATTATTT GAGTCATTGC 240
AGAGATGTAT GGATGCAGTC CTCCAAGCTC ATGGGAGTCA TACACAATAT TAATTCTTGT 300
TCCTGTTATG TATTTGTGTT TTTTGTGCTC TGTTTTCTCT GTGTTTTTTC CCTCTCTCTC 360
TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCGCTC TGTTCTCCCG TATCTGCTCT CATGTATTCT 420
CAGGTTCTGT TCATTGGTCC ATTCAGCTGT CAGTCATTCC TCCCCGGTTA CGTCATTCTT 480
ACGTCACATC CAATGAGCAA AGACCACCCG TGTTAAAAGC GCGCGCCAGA CCACTCGCTC 540
GTTCTTGCTT TCTTGCTTGC ATTTTTCTCT TTCGCTGTTT CGTCGCTTTT TTGTATTTAC 600
CGCGTGCGTT TAGAAATTAC CCCGTCTAAC TGTGTTTTGT TGTTGCTTGT TTCTGTGTGC 660
ACGTTATCCG TCCGTTATTC GTACATTGTT CTTAGTTTAT CGTTGTTTAC GAGGCTTGGA 720
CGAAGCGGAC AGGTAAGAAG GTCACGTGAC ATACATTTCG CAACACTCAG GACTGCTCTG 780
CTGTCTAGTA CACTAGGTTA GGGGCGAGCG CCACTCCTTG TACTTTTTGG ATAGATAGAT 840
AGAGTAGATA GTTAGGACCC GGAAGATCTT CGTGTGTTAA TTATACTATT TTTCACATAG 900
TTAGTTAGCT AGATGCTTCT GGGAAGTTAG ATTTAGTTTG GGTTTTGTTC TTTTCATTTC 960
TTTAGCGCCG CCCGCGTCCC TTCTGCCAGC TCTCTTGTTT TTCCCGTCTT TATTTGTCTC 1020
AGTGTTTGTA CATATTGTAA ATAGAATATT TTTGCTTTAC TTACTTTTTC TTTAATTTTG 1080
ATTAATTCGT TGTTGTTGTT CACTTTGGGA TTGTAAATAA AAGCACACAT TTTTTGGCAT 1140
TACTTTGGTT GTCTTTCTCA CTCATTCACT ATTTATATAA ATATATTTTA ATTAAATAAA 1200
TGTCAAACCC CACACCCTAG ACTAACATCA GGGGTTTGTA ACATTCCACT GCACCATGAC 1260
CTTTTATTCT ATACTGTACA TTATTTCTGT TAAGTGACAA GACTTTTGCC TAAGCAAAGT 1320
CAGATCTTAC TGTCCTATAT AAATAATTGA AAATCAAGGC ATGATCATGT TTTATTTTGG 1380
TAAAATAAGC GTAATCTAGA GGCCTTTACT TTTCATATAA GCCACTTCTG ACACCAAATG 1440
ATCAACT 1447