EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00188 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:8449330-8450285 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CUX1MA0754.1chr1:8449955-8449965TAATCGATAA+6.02
CUX2MA0755.1chr1:8449955-8449965TAATCGATAA+6.02
FOXB1MA0845.1chr1:8449491-8449502TTATTTACATA-6.02
MNX1MA0707.1chr1:8449354-8449364GGTAATTAAA+6.02
SOX21MA0866.1chr1:8449464-8449479AACACTGTAATTGTA-6.22
Sox11MA0869.1chr1:8449464-8449479AACACTGTAATTGTA-6.7
Sox1MA0870.1chr1:8449464-8449479AACACTGTAATTGTA-6.36
Enhancer Sequence
CAAAATAAAA ACATTGAATA TTAAGGTAAT TAAAAAGGCT ACTGTGGTAC AGGTAGGATT 60
TCAGACGTTA ATACAACGAC ACTACATAGT ATTTACATCG CGTGCTTTAC AAAATACCAT 120
GGTACTTACA TGTCAACACT GTAATTGTAC AGGTAGTTTG GTTATTTACA TAAAGCAGTT 180
GTGGTTAGTT GTCTGGATAA TTAAAAGCAT TTTTTATCTA GGTCGTTCAC AAGTATATAT 240
ATAAAACATA AACAAGTACT TACAGTCTCT TTGTCCTCGT TATGGAGAAT CTCCTCCGAC 300
ATCCTGTAAA CTTATCTGCA CATATGTTTA TTCATATATT TACAGTTAAA ACTTACTTGT 360
CAAGTATAAA TCTGACACAA GAAAATGAAC ATATAGAGTA AACAACAAAC AACCACATAT 420
CATCTGACGC AATAAATTCA CAAATAAACA TATTTGGCAG GTCAGGCGAT CGTTTTTACA 480
AACCGAACAC CCATTCACAC ACACACAGGA GGAAAACAAT ACTCTTAAAA GTATTTTTAA 540
CGTTACTTCA GTTTCTAACC TGACAAGACT TGCGGAATAT TTTGCCACGC TCAACCGTCC 600
CGCGAGTTCT GACTGCAGAC TAAACTAATC GATAACAACT CACTTTTATC AAACTTCGCT 660
ATCGCGTGAA CAAAGACTGT ATATGAAGTT ACTCGGTTTT CCTACTAGTA TTACAGTGTA 720
ATGCATTAAA TTATCACATT AAATAGTCGC AGAAGAACAG TGTTTAGGTT AAAACGGACT 780
TGTGCATGAC CTGTCTGATC ATGTCATCGG GACTCGTCAC TAATGTCTGT CCACAGAGTT 840
TCTCATGTGC TTGGCAGCAG ATTTGAGGTC GTCTTCCCCA TCTGGCTGCT GTAAGGTTTG 900
CAGTTGTAGA TTAAATATTA GCTAAAGGTG AATATTTGCA TAAGAGAGAA TGGTG 955