EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00132 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:5966378-5967431 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:5966623-5966634ATATTAATTAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr1:5966702-5966719TAGTTTGTTTACACTTT-6.05
GRHL2MA1105.1chr1:5967220-5967235CAAAACTGGTTTGCT-6.55
POU6F1MA0628.1chr1:5966625-5966635ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:5966625-5966635ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TATTATGAGT CAATCATCTC GACGCATCAT CCACATTTCT TAGATATTTA ATACCTTCCG 60
TATTGGAGAA ACAGCAGCAG GATAATCCGC CATTTATGGG TCTTCATGCA GGGAAATCAT 120
GTTTTTTAGG TAATGATATG CATTGAGAAG TTAATGTCCA AACATATCTT GATATAAGTT 180
CACATTGTTG TTGTAGATTA AATATAACTA GGAAAACGCG ATTTAAACAT GTTCCAGTTG 240
GCTAAATATT AATTAATAGT CATTTAAATA ACTTTACTGA AGCCTCTCTA CTTGATGGTT 300
GGTCTCGCGC GTCTGCCATG TTGGTAGTTT GTTTACACTT TTTTTACCCC CGTTTGTAGT 360
TTTGTGGGCA ATATTAGAGT GTAGGCGCGT GTACACCTTA AGAGATTTTA CCGAAAATAG 420
TAAACCATCC AGAAACCTTT ATACCCTTTT CAACATACTA TAGTTTTGGA CATACTAATT 480
CTAGTTTCTA ATACTATTTA GGATGGGTAG ACTGCGAATT TGGACGCACC AACGCAGCTA 540
CAGTTCCAAC CCTAATTAAT CACACCTGTT CAAACTAATT AAGTCATATA GGCTCGTTTG 600
AAACCTACAG GTACGTGTGT TGAAGCAGTG TTGGAACTAA ACTGTGCAGG GCAGCTGTTT 660
GACCCCCCTG TCAGAATATT TACGTGTATT TATCAATGGC TTTGTCTCAA ATGGAGTGAG 720
TTGCATTTAA TTTGTTCTCA TAAGCTTTAA GCGTATTTTA TCAATGGTTT TGTCTCAAAA 780
ATTGAGTGAG TTTACTACCT AGACCGCATT TTCAAGCATT AATGTGAGTT TGTCTATAAT 840
GACAAAACTG GTTTGCTAAC ACTGTGATTG GAAATGTATA TGTAGACCTT CGTCCATTAG 900
CACTGGCAGT GTCTCGATTT AGCGAGCTTC CTAAAAAACA CATTTTTTGT GCACTAAAAA 960
AGCTAATTTG CAAATGATGC ACAAAAGTGC TAGGCAGCTC ATATGCCTAT GTTGGCAAGT 1020
AAATATCACA TAGTGAATAA TTAAAACAGG GGT 1053