EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00103 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:4451477-4452861 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:4452276-4452293CGCACTAATTAGCTCAC+6.36
Alx4MA0853.1chr1:4452276-4452293CGCACTAATTAGCTCAC+6.28
BHLHE23MA0817.1chr1:4451511-4451523AAACATATGCTG+6.04
CTCFMA0139.1chr1:4452771-4452790CAGTGCCATCTAGTGGAGG-6.75
GBX1MA0889.1chr1:4452279-4452289ACTAATTAGC+6.02
HOXB3MA0903.1chr1:4452279-4452289ACTAATTAGC+6.02
LHX6MA0658.1chr1:4452279-4452289ACTAATTAGC+6.02
MNX1MA0707.1chr1:4452823-4452833GGTAATTAAA+6.02
NRF1MA0506.1chr1:4452065-4452076TGCGCATGCGC-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:4452825-4452836TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr1:4452825-4452836TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:4452825-4452836TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:4452825-4452836TAATTAAATTA-6.62
ZNF24MA1124.1chr1:4451587-4451600AAATGAATGAATA-6.42
ZNF24MA1124.1chr1:4451744-4451757AAATGAATGAATG-7.34
ZNF263MA0528.1chr1:4452730-4452751AGAGGAGGAGGGAGAAATGAG+6.18
ZNF263MA0528.1chr1:4452724-4452745AAAGGAAGAGGAGGAGGGAGA+7.45
Enhancer Sequence
ATGGGTTGTG GCTGGAAGGG CATACGCTTG GTAAAAACAT ATGCTGGATG AGTTGGCAGT 60
TCATTCCACT GTGGCGACCC CAGATTAATA AAGAGACTAA GCCAAAAAGA AAATGAATGA 120
ATAAATAACT TTAATATACT GTGAATCATT TCCCAGAGAT GGGTTGCGGC TGGAAGGGCA 180
TCCGCTGCGT AAAAAAATGT GCTGGATAAG TTGGCGGTTC ATTCCGCTGT GGCGACCCCG 240
GATTAATAAA GGAACTAAGC TGAAAGAAAA TGAATGAATG GATTCTTCTA ACACTTTATT 300
GGGTAGCTAT GCTGTGTAAA AACATAACAA TTTAATCCAA AACCAGCTGA GAACCAGTGG 360
TCTAAAACAC ACAGGGCACT CACTCATCCA ACAATGACTG TTTTTCAGAT GGTCGCCCAC 420
TTAGCATGGT TTGGTTTTTC GGAATACTCC CAATCATCAG AGGAAGACTT TTTAGGAAAC 480
AAGATGTGCA CTAAAAACTG GAAGAGATGT TGGGAGATCA CGGAGGTGAT GCTAAAAAAG 540
GGAGTGATGT GTTGGCAAAG CTCTCTGCAA CCCCTCTGTC TGGACGTGTG CGCATGCGCC 600
GGCGACCTTC CTACACACTC CTGCAAGTCT CTCGCTATCT TTTTTATCTT TCTCCCGCGC 660
GCGCGCGCTC TCGTTCTGTC TGAGCAGGGA CGCGCTCCTA CCAATCTGTC TCTCGCGCTC 720
ACATTTCCTC CCTCTCCATC ACAGTCTTTT CTCTTCTATC ATCGTTGTCT ATCTCAGCAT 780
CATGCGGCAA TGACAACCCC GCACTAATTA GCTCACAGCC AGAGTCTGTC AGTGGCGTGT 840
TTACGTGAGC GAGCACGAGT GACGGCAAAG TCAGCAAAGT TCCGAGATGG AGGCGCGCGC 900
TGCCCTCCGC GCCCCCGCCT CAAGCCCTTC GTTTCCCCTA CCGCGGAGAA CGTAAAAAGA 960
ATCGCAAACC CGTGGAATTT TTCTTCTTCC CGTCGTTAAC GGGTGGCTCG TGTGATGAAT 1020
GGCGCTTGGG AGATACTGAC AGCTCACCTG TAGCCCGCAT TAGGTTGCAT TTAAAGCACA 1080
GGACTGCACA AAAATATATA TACACACACG CGCGCGCGCG CGCGCGCACA CACACGGGCA 1140
GGCTCTTCTG ATGAATAATG ATTGACTGCC TCTGAAAGAT CTGCGTCAGT TGTAGCTGCA 1200
GCTTTCTGAA CTGTGCCGCA GGCAATTACT TTGTTTTATA TTAAAAAAAA GGAAGAGGAG 1260
GAGGGAGAAA TGAGATGGAG CTCGGGAAAG ATCACAGTGC CATCTAGTGG AGGCCGGCGG 1320
TGGAGGAGGT TGTTGTTTAC AGGAAAGGTA ATTAAATTAC CCCATTAACT CAGCTTGAGT 1380
TTTT 1384