EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00053 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:1617255-1618478 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SP1MA0079.4chr1:1617993-1618008CAAACCACGCCCACA+6.89
SP4MA0685.1chr1:1617993-1618010CAAACCACGCCCACAGT+6.37
ZNF24MA1124.1chr1:1617566-1617579AGATGAATGAATG-6.25
ZNF24MA1124.1chr1:1617570-1617583GAATGAATGAATA-7.52
Enhancer Sequence
CTGTGATAGC AAGAAGGTTG CTGATTGAGT CCTAGCTGGG TCAGTTGGCA TTTCTGTGTG 60
GAGTTTGCAT GTTCTTTCCA TGTTGGCGTG GGTTTCCTCC GGGTGCTCTT GTTTCCTCCA 120
GTCACATGCG CTTCAGGGGA ATTGATGAAC TAAATTGGGC ATAGTGTATG AATGTGTGTG 180
AATGAGTGTG TATGGGTTTT TCTCAACACT TGGTTGTGGC TGAAAGGGCA TCTGCTGCAT 240
AAAACATCTG CTGGAATAGT TGGCGGTTCA TTCCACTGTG GCTAACCTTA ATAAATAAGG 300
GACTAAGCCA AAGATGAATG AATGAATAAT ATCAAATAGA ATCTAAATTA TAACAACAAT 360
TATCTAGTTT TTGGTTTACA AATAGGGGAA ATTACTAAGT CTGTTACTCA GAGGTCAGCT 420
GGAGGAGTAA TGTTTTGCCT GCCATTATGG GGCTGTTCCC ATAATGGTGT GACGACACAT 480
GAAAGATATC AAGGGATGGG TATCAACAAT TCTGTCCATG TCTGTATGTT GTCTATGATG 540
ATTATAGTTT TGTTTTTGTT TATCTAGAGC ACTATTAAAA AGGTTTAACA TACTTAAACA 600
CAAATGATTA AACAAGAAAC AGAAATTATG TGGATAAAGT GTCTGTTAGG TAGTAATAAC 660
TCTCCCCAAA CCCTTATCCC CATCATTCTG AATGAAACGT CTACTTTACT ACATCCAATC 720
AGCTCGCAGT AGAAAAAACA AACCACGCCC ACAGTTTTCT CATTAATATT CCGTTTCTCT 780
AGGAACTGCA TAACAATATA GAAAAAAAGT CATAGCTTCC GCTTCATGCA GACTTTAAAT 840
AAATAAATAA ATATGGATAT GATGTCGCCT TGAACGCTGT AATGCATCAT CTCAGTTATT 900
TAACTAAAAG CTTTTCAATG CTCAGAAAGA CTCAATCCTG CAGTGCAAAG AAATCCTGCT 960
GATTGCAGAT TAAGCTATAT ATCTGACAGA CTGTGCTGCA GTGTGCGAGG GGGGCGTTAG 1020
TGCTCGTCGA TGGACCGATG CAGTGCGAGA TCTGCCGTCC CCGGGGAGCC GTTTACTGTG 1080
AGAAGTGCAG CGTGCACTAG CTGTGATGTA CGAGCCAATA AAAGCAGCAA CAGCCTCGAC 1140
GGATCATCTG TAAGAAGCTA ATGGAGCCGC GGTCGCTCCA TCTGCAGGCT CACAGTTAGA 1200
AGAAAACCTT CAGGGTCTTC CAG 1223