EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00008 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:74455-75495 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Klf1MA0493.1chr1:75116-75127AGCCACACCCT+6.02
NR4A1MA1112.2chr1:74587-74597TAAAGGTCAC+6.02
RREB1MA0073.1chr1:74863-74883CCACAAACCACAAACACCAA+6.25
RREB1MA0073.1chr1:74877-74897CACCAAACCAACTCCAAACC+6.31
RUNX1MA0002.2chr1:74860-74871AAACCACAAAC-6.02
RUNX1MA0002.2chr1:74867-74878AAACCACAAAC-6.02
Enhancer Sequence
CAATCAGAGG AGCTGAGTGA ATGGGTGATG TTGTTCAGAT GTGTGTGCGT GACTGCGTCT 60
GTAATCGGCC GTCATGTGAC TCAGCTTCAG GCTCATGCGA TGCTCATTTC CTGCCGGCCT 120
TTAATAACCC GCTAAAGGTC ACTGTGCTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 180
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC GTGAGCTCTC CCTCAGTGTC TGGTCTGTCC 240
TGTACTGCTC CTGATGTGCT CCACTCCTGC TGTTATCCGT CATGAAGCAC CTGTAGAGTG 300
TGGGTGTGTT ATTATGAGGA CTCGAGAACA CCGACACACT CTTACAGCAC ACACACTCAT 360
CAATAATGAC ACTAATCTCT GTACGCATCT CCTGACCTCG ACCGCAAACC ACAAACCACA 420
AACACCAAAC CAACTCCAAA CCAGAACTCC AGACTCTACT GAGTGAAGCT GCTCTTTTCC 480
AACTGATCCG GCTTACGGTT TTCCCAAAAC TGACCCGGAA AATTGGGAAA AAGTCCCATT 540
GACTTAACAT TGGACCAAAC TCTGTGACCT CATCACTCTG CGCCGGACTG TCATACAGAC 600
TTAATGTTGG GCTCAAATAA CTCAGACTAC CAGCCAATCA ATGATGACCT TTCAACTTAC 660
TAGCCACACC CTAGCAACCA CTTATGCCAC CCTAGCAACT GTCCCATAGA CTTCCATTGT 720
AAAAACCTGC CATCGATTGG ACATGCTAAC AACACACCAA TCATACTAGC AGCATGCTAA 780
CAAAATACTA ATCATACTAG CAACATGCTA ACAACATACT AATCATATCA GCAACATGCT 840
AACAACATAC TAATCATACT AGCAACATGC TAACAACATA CTAATCATAC TAGAAACATG 900
CTAACAACAT ACTAATCATA TCAGCAACAT GCTAACAACA TACTAGTTTA TACTAAAACA 960
TACTAATTAT ACTACCAACA TGCTAATTCA TACTATAACA TACTAGCAAC ATACTAACTC 1020
ATACTAAATT CATGCTAACA 1040