EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00006 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:64197-65095 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr1:64338-64353TTTGTTTGTATAGGG-6.56
FOXK2MA1103.1chr1:64475-64486ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr1:64475-64486ATGTAAACAAA+6.14
RFX1MA0509.2chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT+6.3
RFX1MA0509.2chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT-6.3
RFX1MA0509.2chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT-6.61
RFX2MA0600.2chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT+6.66
RFX2MA0600.2chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT+6.25
RFX3MA0798.1chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT-6.26
RFX3MA0798.1chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT-6.23
RFX4MA0799.1chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT+6.64
RFX4MA0799.1chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT-6.88
RFX5MA0510.2chr1:64310-64326AGTTGCTATGGTAACT+6.94
RFX5MA0510.2chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr1:64256-64272AGTTGCTATGGTAACA+7.14
Enhancer Sequence
TTAACAGTTG CTATAGCAAA CCAACAACTA CAGTAGTTGA TCTATCCTGG TGATATTACA 60
GTTGCTATGG TAACACAACA GCTACAGAAA TGAATCTGTT GTGGTGATTC TACAGTTGCT 120
ATGGTAACTA GAGTAAGGCA GTTTGTTTGT ATAGGGTTGG GTTTGGCAAT TCAAAGTGTT 180
TTACATATGC AGGAACAAAT ATAACACATG ACAGAAAATT AACACAAATA ATAAAAGTGA 240
CTAAAACAGA CATCAGCAAC AGTACAGTAA CTACAGTGAT GTAAACAAAT GAGCCAATAC 300
TTTACTATTC TATAGAGAAC ATTACAGTCC AGTACAGCAC AGTTTACTGT AGTAAAAGCT 360
AGTGTACACT GCAGTATTTC ATCAGTTCAT ATTAACAGAC TGTTGTAAAA TATGTACATG 420
TTAATAGTTT AAAACACATT CGTGTCTAAT ATGTCTTCAT CTCAGCGGGA CTTGTTACCG 480
GCAGCCGGTG ATGGAGCTTG TAAACAAACC CCGGAGCCCA GAACTCCGCA AACTCTCCGG 540
ACGGGGGAAA GTGACGCACC TGTAAAGCCC AGCAGGGAGA TCCAGCATCT GAGCACCGAC 600
AGCACCAGAA ATCGGTGTGT TCTCTCGGCC ATGTCGCGTG TTTTCCTCCG GTTTTCCATT 660
CCTGCTCGCC CGTGTGTTCT GCTGTCGGGA ATAACGGGAC TGTGAGGCGC GCGCGTTACC 720
GACACACACC GAGGAGGAGC TCCGTCTCGG CACAGTAGGC TCTCTCTCTC TCTCGCACGC 780
ACACACACAC ACACACAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 840
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AGCTGCACGA TCACCTCTGA TAAATCAG 898