EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE009-03478 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Young_adult 
Coordinate
chrII:12039520-12039834 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ceh-22MA0264.1chrII:12039521-12039531TTCAAGCGGC-3.01
dsc-1MA0919.1chrII:12039723-12039732ATAATTAGA+3.38
dsc-1MA0919.1chrII:12039723-12039732ATAATTAGA-3.38
dsc-1MA0919.1chrII:12039704-12039713ATAATTAAC+3.74
dsc-1MA0919.1chrII:12039704-12039713ATAATTAAC-3.74
elt-3MA0542.1chrII:12039765-12039772GACAAGA-3.45
fkh-2MA0920.1chrII:12039563-12039570TATACAA+3.45
lim-4MA0923.1chrII:12039705-12039713TAATTAAC-3.24
lim-4MA0923.1chrII:12039724-12039732TAATTAGA-3.33
lim-4MA0923.1chrII:12039723-12039731ATAATTAG+3.49
lim-4MA0923.1chrII:12039704-12039712ATAATTAA+3.71
mab-3MA0262.1chrII:12039695-12039707AAACGCAAGATA-3.76
mab-3MA0262.1chrII:12039632-12039644ATGTTACCAAAT+3.8
mab-3MA0262.1chrII:12039579-12039591TTGTTGCAGTTT+4.27
pal-1MA0924.1chrII:12039572-12039579TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrII:12039819-12039826CCATAAC+3.32
pal-1MA0924.1chrII:12039705-12039712TAATTAA+3.54
unc-62MA0918.1chrII:12039762-12039773CTTGACAAGAC-3.02
unc-62MA0918.1chrII:12039656-12039667GGTGACAAATC-3.08
vab-7MA0927.1chrII:12039724-12039731TAATTAG+3.06
vab-7MA0927.1chrII:12039724-12039731TAATTAG-3.75
vab-7MA0927.1chrII:12039705-12039712TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrII:12039792-12039802ACTAATTTCA+3.03
zfh-2MA0928.1chrII:12039570-12039580GTTAATTTCT+3.18
zfh-2MA0928.1chrII:12039703-12039713GATAATTAAC+3.48
zfh-2MA0928.1chrII:12039723-12039733ATAATTAGAC-3.53
zfh-2MA0928.1chrII:12039722-12039732CATAATTAGA+3.76
zfh-2MA0928.1chrII:12039704-12039714ATAATTAACT-3.93
Enhancer Sequence
TTTCAAGCGG CTAACTTTTT TGAAATAACC GTCTAATTTT GGGTATACAA GTTAATTTCT 60
TGTTGCAGTT TCAACTCGAT TTTGGTACAT TTAAGCTCGA TGTATCCCCC AGATGTTACC 120
AAATTTAACC AAATCTGGTG ACAAATCGAC CTCAAATATA CCTAAATCGA GTTGAAAACG 180
CAAGATAATT AACTTATATA CCCATAATTA GACGATGATT TCAAAAAGTT AGCATCCAGC 240
CGCTTGACAA GACGGTCAAA TTTCAAATTT TAACTAATTT CAGGTCATTT TTTGTACCGC 300
CATAACTTTT TTTG 314