EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE008-01212 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L4 
Coordinate
chrII:13298175-13298946 
TF binding sites/motifs
Number: 49             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:13298227-13298237TAATAGAGAA+3.14
blmp-1MA0537.1chrII:13298502-13298512TGAGAGAGAG+3.14
blmp-1MA0537.1chrII:13298347-13298357AGAGAGAAGC+3.38
blmp-1MA0537.1chrII:13298512-13298522AGAGAGAGTG+3.3
blmp-1MA0537.1chrII:13298811-13298821AAATCGAGGG+3.56
blmp-1MA0537.1chrII:13298395-13298405TTTCTATTTT-3.8
blmp-1MA0537.1chrII:13298504-13298514AGAGAGAGAG+4.43
blmp-1MA0537.1chrII:13298506-13298516AGAGAGAGAG+4.43
blmp-1MA0537.1chrII:13298508-13298518AGAGAGAGAG+4.43
blmp-1MA0537.1chrII:13298510-13298520AGAGAGAGAG+4.43
ceh-22MA0264.1chrII:13298631-13298641CTCGAGTGTA-3.68
ces-2MA0922.1chrII:13298621-13298629TATAGAAT-3.19
che-1MA0260.1chrII:13298430-13298435AAACG+3.06
efl-1MA0541.1chrII:13298585-13298599ACTGGCGGCATTTG+3.27
efl-1MA0541.1chrII:13298728-13298742TTTTTCCGTGTTGG-3.28
efl-1MA0541.1chrII:13298848-13298862AACCCCGGGAAATG+3.66
elt-3MA0542.1chrII:13298500-13298507GATGAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrII:13298643-13298650GATAAGG-4.05
elt-3MA0542.1chrII:13298655-13298662GTTATCA+4.15
elt-3MA0542.1chrII:13298479-13298486GATAAGA-4.66
eor-1MA0543.1chrII:13298509-13298523GAGAGAGAGAGTGC+3.48
eor-1MA0543.1chrII:13298499-13298513TGATGAGAGAGAGA+3.55
eor-1MA0543.1chrII:13298336-13298350AGAAGGCTCAGAGA+3.61
eor-1MA0543.1chrII:13298501-13298515ATGAGAGAGAGAGA+5.47
eor-1MA0543.1chrII:13298507-13298521GAGAGAGAGAGAGT+5.6
eor-1MA0543.1chrII:13298503-13298517GAGAGAGAGAGAGA+6.63
eor-1MA0543.1chrII:13298505-13298519GAGAGAGAGAGAGA+7.11
fkh-2MA0920.1chrII:13298559-13298566TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrII:13298680-13298687TGTTTAA-3.37
fkh-2MA0920.1chrII:13298381-13298388TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrII:13298449-13298456TATACAA+3.45
fkh-2MA0920.1chrII:13298871-13298878TGTTTAA-3.48
fkh-2MA0920.1chrII:13298204-13298211TGTTGAT-3.57
hlh-1MA0545.1chrII:13298862-13298872TCAGATGCTT-3.35
hlh-1MA0545.1chrII:13298194-13298204AACAAATGGG+3.37
hlh-1MA0545.1chrII:13298831-13298841TCGGCTGCTT-3.38
hlh-1MA0545.1chrII:13298549-13298559AGCAAATGGT+3.4
pal-1MA0924.1chrII:13298258-13298265TAACAAA+3
pha-4MA0546.1chrII:13298275-13298284GTTCAAACA+3.05
pha-4MA0546.1chrII:13298439-13298448GTATAAATA+3.65
pha-4MA0546.1chrII:13298205-13298214GTTGATATT-3.6
sma-4MA0925.1chrII:13298425-13298435TACAGAAACG-3.23
snpc-4MA0544.1chrII:13298860-13298871TGTCAGATGCT+4.18
snpc-4MA0544.1chrII:13298890-13298901TGTCGACTGCA+4.69
snpc-4MA0544.1chrII:13298829-13298840TGTCGGCTGCT+7.02
unc-62MA0918.1chrII:13298857-13298868AAATGTCAGAT+3.8
unc-86MA0926.1chrII:13298220-13298227TGAATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrII:13298218-13298225TATGAAT+3.87
vab-7MA0927.1chrII:13298474-13298481TAATTGA+3.15
Enhancer Sequence
TGTGGGCACA ATAATAAGGA ACAAATGGGT GTTGATATTT TAATATGAAT AATAATAGAG 60
AAGGTCAGCA GCAAATAGAG GAGTAACAAA AGGTTCAACA GTTCAAACAT CAAGCAATTT 120
TCCGACCAAA AGTTTAAAAA TTGGGGGAGT TCAGGGAGTT CAGAAGGCTC AGAGAGAGAA 180
GCTTCAGATT TTTAAAAGCC AAAAAATAAA AAAAATCGTA TTTCTATTTT TAGAAAATTT 240
AGTAATCCCG TACAGAAACG ACGTGTATAA ATAGTATACA AAAGGACATT GTCAAAACAT 300
AATTGATAAG AAGAGCACAA AATATGATGA GAGAGAGAGA GAGAGTGCAG AGAGAAGTTA 360
GAGGAAAAAG TAGGAGCAAA TGGTTCAACA ATTCCCCCCA CCAGCTCCCC ACTGGCGGCA 420
TTTGAAGATG ACTTTGGGTG GCTTTTTATA GAATTTCTCG AGTGTACTGA TAAGGCACGT 480
GTTATCAGTA TCGCAACGGC GATGGTGTTT AAAAGGAGAC TCCGAGCACC GCGGAGCTAG 540
GCACATTCTT AAATTTTTCC GTGTTGGGTT GGGAGAGAGG TCATGTGATA TTGACGCGGT 600
TTTTTTTTTT GAAAAATTGT GTGCCACGTC ACTTTAAAAT CGAGGGTAGG GAGGTGTCGG 660
CTGCTTTCTT TACAACCCCG GGAAATGTCA GATGCTTGTT TAAAGTCCCG GGAAGTGTCG 720
ACTGCAATTT CCCAAAATTT GCAATCCTGG GAAAAATGGT CAAAAAACCG T 771