EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE008-00672 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L4 
Coordinate
chrI:13476064-13477148 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13476301-13476311AAATTGATTG+3.05
blmp-1MA0537.1chrI:13476799-13476809AAATCGATGG+3.18
blmp-1MA0537.1chrI:13477054-13477064CATCGATTTT-3.19
blmp-1MA0537.1chrI:13476352-13476362CATCCATTTT-3.25
blmp-1MA0537.1chrI:13476669-13476679TTTCATTTTT-5.14
ceh-48MA0921.1chrI:13476302-13476310AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrI:13476801-13476809ATCGATGG+3.07
ceh-48MA0921.1chrI:13476203-13476211TATCGAAA-3.29
ceh-48MA0921.1chrI:13476085-13476093TCCAATAA+3.33
ceh-48MA0921.1chrI:13477054-13477062CATCGATT-3.41
ces-2MA0922.1chrI:13477110-13477118GTACACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:13477065-13477073ATATATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:13477120-13477128TGCGTAAA-3.14
ces-2MA0922.1chrI:13476475-13476483TTATGGAA+3.32
ces-2MA0922.1chrI:13477066-13477074TATATAAT-3.3
che-1MA0260.1chrI:13476954-13476959GTTTC-3.06
elt-3MA0542.1chrI:13476215-13476222GATAGAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:13476182-13476189TTTAGCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:13476236-13476243TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:13476858-13476865GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:13476575-13476582CTTGTCA+3.45
elt-3MA0542.1chrI:13476293-13476300GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:13476879-13476886GATAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:13476884-13476898AATAGACGAAAAAA+3.22
eor-1MA0543.1chrI:13476553-13476567TTCTCAGCCTCAAC-3.42
eor-1MA0543.1chrI:13476131-13476145CTCTCAGCCTCAAC-3.81
eor-1MA0543.1chrI:13476338-13476352CTCTCAGCCTCAAC-3.81
eor-1MA0543.1chrI:13476948-13476962TTCTTCGTTTCACA-3.98
fkh-2MA0920.1chrI:13476450-13476457TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrI:13476711-13476718TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:13476985-13476992TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrI:13476838-13476845TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrI:13476390-13476397TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrI:13476597-13476604TAAACAT+3.28
fkh-2MA0920.1chrI:13476850-13476857TTTTTAC-3.4
hlh-1MA0545.1chrI:13477130-13477140GACAAATGGC+3.55
mab-3MA0262.1chrI:13476690-13476702AATCGCAAAAAT-3.98
pha-4MA0546.1chrI:13476604-13476613ATTTTCTTT-3.17
pha-4MA0546.1chrI:13476506-13476515TTGCAAATA+3.45
skn-1MA0547.1chrI:13477049-13477063AAAATCATCGATTT-4.14
skn-1MA0547.1chrI:13476945-13476959TTTTTCTTCGTTTC-4.24
skn-1MA0547.1chrI:13476236-13476250TTTGTCATCTTACC-4.52
unc-62MA0918.1chrI:13476574-13476585TCTTGTCATGA+3
unc-86MA0926.1chrI:13477094-13477101TCCATAT-3.14
unc-86MA0926.1chrI:13476866-13476873TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrI:13476079-13476086TATTAAT+3.35
zfh-2MA0928.1chrI:13476868-13476878AATAATTTGG+3.06
zfh-2MA0928.1chrI:13476862-13476872AAAATTAATA-3.08
Enhancer Sequence
TCGAGCTTTT ACGTGTATTA ATCCAATAAA ATTTGGTTGA GGCTCAGATG ATTTTGTAGT 60
TTGTAGTCTC TCAGCCTCAA CCATTTATTT TTGCATGAAA ATTGAGTTTT TGATAGATTT 120
TAGCAGAATT TCCTGCATTT ATCGAAATTT TGATAGAATT TTAAAAAAAT ATTTTGTCAT 180
CTTACCGTTA AAATTTATAG ATATAATTCA GTTTTTAGGT GTATTCAGTG AAAAAAAAAA 240
TTGATTGAGG CTCAGGGATG TTGTAGTTTG TAGTCTCTCA GCCTCAACCA TCCATTTTTG 300
CTTGAAGAAT TACCATTTTT GATAGATTTT TACAGATGTT GAGGCATTTC CATATCTAAA 360
TTCCCACAAA AATACAACTT TCCTCATGTT TTCTGATTTT GCCTTCGAAA ATTATGGAAA 420
TAACCCCATT TTACTCATAC TTTTGCAAAT AAATTTGGTT GAGGCTAACA CGATTTTGTA 480
GTTTGTAGTT TCTCAGCCTC AACCATTTAT TCTTGTCATG AAAATTGTAT TTTTAAACAT 540
ATTTTCTTTG AATTTAAGCT GCTAGCACAA CTTATTTCAC TTGATTTTAG GTGTAAAAGT 600
CAGATTTTCA TTTTTTTTTC GGTGAAAATC GCAAAAATGT GTTGAAATTT TTATTTTAAT 660
AAATTTAATA CGTTAAAAAA TGTATCAATG TCGACTTTCG CGGCTCGTGT ACTCCCCGAG 720
GAGAAGTTGG GATGAAAATC GATGGATTTG TCGTTGAAAA TCTGAAAATT CTCATAAAAA 780
CCTAGTTTTT TACTGACAAA AATTAATAAT TTGGAGATAA AATAGACGAA AAAAAAGGCC 840
AAAAACTGTA AAATGCTCGA ATTTAGACTA TTTTCGCCAA TTTTTTCTTC GTTTCACAAA 900
GAAATAGCCT ATTTCATCTG TTATTTATAG TTTTTTTGGG TGAAAATTTG AAAGTTTTTT 960
TCCCGAGAAT TTGTAGATTT TTAATAAAAT CATCGATTTT AATATATAAT TCCGGCCAAA 1020
AACCGTAAAA TCCATATCCT CGGGGAGTAC ACAACTTGCG TAAATCGACA AATGGCAGTG 1080
GAAG 1084