EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE008-00350 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L4 
Coordinate
chrI:7001359-7002338 
TF binding sites/motifs
Number: 72             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:7001583-7001593AAAACGAGTA+3.25
blmp-1MA0537.1chrI:7001826-7001836GAAGAGAAAT+3.63
blmp-1MA0537.1chrI:7002022-7002032TCTCTTTCTC-4.1
blmp-1MA0537.1chrI:7002020-7002030TTTCTCTTTC-4.23
blmp-1MA0537.1chrI:7001577-7001587AAAATGAAAA+5.14
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:7001839-7001852TAATGAAAACAAG-3.44
ceh-22MA0264.1chrI:7001942-7001952TTAAAGTGCA-3.38
ces-2MA0922.1chrI:7001523-7001531TTATGTAC+3.39
ces-2MA0922.1chrI:7001508-7001516TTATATAA+3.3
ces-2MA0922.1chrI:7001509-7001517TATATAAA-3.3
ces-2MA0922.1chrI:7001524-7001532TATGTACT-3.46
daf-12MA0538.1chrI:7002170-7002184ACCCACACAAACTC-3.48
dsc-1MA0919.1chrI:7001594-7001603ACAATTAGC+3.19
dsc-1MA0919.1chrI:7001594-7001603ACAATTAGC-3.19
dsc-1MA0919.1chrI:7002250-7002259TTAATTAAT+4.29
dsc-1MA0919.1chrI:7002250-7002259TTAATTAAT-4.29
efl-1MA0541.1chrI:7001421-7001435GCTGGCGGATATTT+3.37
elt-3MA0542.1chrI:7001564-7001571TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrI:7001920-7001927TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrI:7001969-7001976CTTATAA+3.29
elt-3MA0542.1chrI:7001971-7001978TATAAGA-3.29
eor-1MA0543.1chrI:7002314-7002328GGCTTTTTCTCTAA-3.25
eor-1MA0543.1chrI:7002021-7002035TTCTCTTTCTCGCC-5.09
fkh-2MA0920.1chrI:7001492-7001499AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrI:7001914-7001921AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrI:7001695-7001702TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:7002207-7002214TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrI:7001793-7001800AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:7001844-7001851AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:7001434-7001441TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:7001893-7001900TGTTGAT-3.43
fkh-2MA0920.1chrI:7001513-7001520TAAACAA+4.31
hlh-1MA0545.1chrI:7001757-7001767ACAAATGTTT-3.17
hlh-1MA0545.1chrI:7001756-7001766AACAAATGTT+3.52
lim-4MA0923.1chrI:7001594-7001602ACAATTAG+3.33
lim-4MA0923.1chrI:7002290-7002298TAATTGAA-3.3
lim-4MA0923.1chrI:7002250-7002258TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrI:7002251-7002259TAATTAAT-3.75
lim-4MA0923.1chrI:7001520-7001528TAATTATG-3
lin-14MA0261.1chrI:7002296-7002301AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrI:7001546-7001558TTGTTTCCTTTT+3.6
mab-3MA0262.1chrI:7001636-7001648ATTTGCAACATT-5.19
pal-1MA0924.1chrI:7002017-7002024TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrI:7002255-7002262TAATTTC-3.07
pha-4MA0546.1chrI:7001947-7001956GTGCAAAGA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:7001841-7001850ATGAAAACA+3.24
pha-4MA0546.1chrI:7001790-7001799AAGAAAACA+3.27
pha-4MA0546.1chrI:7001548-7001557GTTTCCTTT-3.27
pha-4MA0546.1chrI:7001894-7001903GTTGATCTT-3.43
pha-4MA0546.1chrI:7002305-7002314ATTTATCTT-3.53
pha-4MA0546.1chrI:7001510-7001519ATATAAACA+3.73
pha-4MA0546.1chrI:7001794-7001803AAACAAATA+3.73
pha-4MA0546.1chrI:7002077-7002086ATTTATTTT-3.76
pha-4MA0546.1chrI:7001751-7001760GAACAAACA+3.86
sma-4MA0925.1chrI:7001873-7001883TCTAGTCATA-3.17
unc-62MA0918.1chrI:7002272-7002283GCTTGTCAGCG+3.13
unc-86MA0926.1chrI:7002122-7002129TATGAAT+3.58
unc-86MA0926.1chrI:7001631-7001638TGAATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrI:7002118-7002125TCATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrI:7002251-7002258TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:7002251-7002258TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrI:7001520-7001527TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrI:7001520-7001527TAATTAT-3.29
zfh-2MA0928.1chrI:7001743-7001753AAAATTAAGA-3.05
zfh-2MA0928.1chrI:7002288-7002298TTTAATTGAA+3.11
zfh-2MA0928.1chrI:7002015-7002025CTTAATTTCT+3.16
zfh-2MA0928.1chrI:7002253-7002263ATTAATTTCA+3.2
zfh-2MA0928.1chrI:7001519-7001529ATAATTATGT-3.33
zfh-2MA0928.1chrI:7002246-7002256TGAATTAATT-3.36
zfh-2MA0928.1chrI:7001518-7001528AATAATTATG+3.4
zfh-2MA0928.1chrI:7002249-7002259ATTAATTAAT+4.38
zfh-2MA0928.1chrI:7002250-7002260TTAATTAATT-4.38
Enhancer Sequence
GATATGAAAT TTAGCGAGTT TAAGAAGGTA TGTGGGCCAT TGAATCTAGG CTTGCTTTTT 60
TAGCTGGCGG ATATTTTTTT ATGTGGAGAA CTTAGAATGT GTCATTCATA GTTCAGCTAA 120
TAGTTGAAAA CAGAAAACAT TTATAAATTT TATATAAACA ATAATTATGT ACTGTCTTAA 180
CTAAATATTG TTTCCTTTTA TGGGATTTAT CATGAACAAA AATGAAAACG AGTAGACAAT 240
TAGCAAAGAA TTGGCAATGA TTTTGGAGTA AATGAATATT TGCAACATTG AATCAAAATG 300
AATCAAAAAC ACAGCATTGA ACCATTCAAA ACACTTTCAA CAACTTCGAC TTCTCAGCGT 360
AACCATTCAT TTATAAAACA TTTTAAAATT AAGAACAAAC AAATGTTTCC TCCATTTAGC 420
TTAGAATTAA AAAGAAAACA AATATTTTTC TGAATATTCG ATTTATGGAA GAGAAATGCT 480
TAATGAAAAC AAGTCAAATC TATTTTCAGA TGATTCTAGT CATAATGGAA TTCCTGTTGA 540
TCTTGCTGAT CATCGAAAAC ATTTATCAAT TTGAAAATTT GTTTTAAAGT GCAAAGAACA 600
AAACAAATTT CTTATAAGAT TAAACTGTAT GATTTAAAGA AAAAATATTT TTCAAACTTA 660
ATTTCTCTTT CTCGCCAATT TTTCCAGAGG ATTGTCAACT CACCATAGTT TGTCTGATAT 720
TTATTTTTTT AAAAACTTTT GGAAATTTTT TGTGAAGTCT CATTATGAAT TTCGGTGGTT 780
TTGGACCAGT TTTAGTCTAT TTAACCAAAA TACCCACACA AACTCTACAC CCCCTTTAAA 840
GGTGTGCGTA AAAATGACAA AGTAACGATT TTAAACTATT TCGAACCTGA ATTAATTAAT 900
TTCACTGATT TACGCTTGTC AGCGTGCTTT TTAATTGAAC ATTTGTATTT ATCTTGGCTT 960
TTTCTCTAAA ATTCAAGCA 979