EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE008-00213 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L4 
Coordinate
chrI:3992209-3992920 
TF binding sites/motifs
Number: 47             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:3992891-3992901ATTCTTCTTC-3.06
blmp-1MA0537.1chrI:3992601-3992611ATTCTTCTTT-3.07
blmp-1MA0537.1chrI:3992504-3992514TCTCAACTCT-3.26
blmp-1MA0537.1chrI:3992596-3992606TTTCCATTCT-3.29
blmp-1MA0537.1chrI:3992511-3992521TCTCTTCTCT-3.32
blmp-1MA0537.1chrI:3992450-3992460GGAGAGATAG+3.35
blmp-1MA0537.1chrI:3992903-3992913TATCTCTCCT-3.36
blmp-1MA0537.1chrI:3992537-3992547CATCATTTTT-3.49
blmp-1MA0537.1chrI:3992604-3992614CTTCTTTTCC-3.5
blmp-1MA0537.1chrI:3992522-3992532TTTCACCTCT-3.66
blmp-1MA0537.1chrI:3992794-3992804GGATGGAGGG+3
blmp-1MA0537.1chrI:3992487-3992497TTTCACTTTT-4.43
blmp-1MA0537.1chrI:3992514-3992524CTTCTCTTTT-4.43
blmp-1MA0537.1chrI:3992516-3992526TCTCTTTTTC-4.7
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:3992283-3992296TAGGCTTGGTTTT+3.51
ceh-22MA0264.1chrI:3992321-3992331CCCCTTAAAA+3.13
ces-2MA0922.1chrI:3992773-3992781GATGTAAT-3.46
che-1MA0260.1chrI:3992553-3992558GTTTC-3.06
dpy-27MA0540.1chrI:3992724-3992739CTCTCTGGGCCATAA+4.06
dsc-1MA0919.1chrI:3992875-3992884CCAATTAAG+3.31
dsc-1MA0919.1chrI:3992875-3992884CCAATTAAG-3.31
elt-3MA0542.1chrI:3992295-3992302TTAATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:3992446-3992453GATAGGA-3.35
eor-1MA0543.1chrI:3992659-3992673ATCTCTGTTTCTAT-3.32
eor-1MA0543.1chrI:3992579-3992593GTGTCCTTCACTGT-3.47
eor-1MA0543.1chrI:3992515-3992529TTCTCTTTTTCACC-3.53
eor-1MA0543.1chrI:3992547-3992561GCCTCCGTTTCCAG-3.62
eor-1MA0543.1chrI:3992512-3992526CTCTTCTCTTTTTC-3.64
eor-1MA0543.1chrI:3992661-3992675CTCTGTTTCTATGG-3.73
eor-1MA0543.1chrI:3992517-3992531CTCTTTTTCACCTC-4.27
fkh-2MA0920.1chrI:3992217-3992224TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3992385-3992392TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3992248-3992255TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:3992849-3992856TAAACAA+4.31
hlh-1MA0545.1chrI:3992464-3992474AACAATCGTC+3.26
lim-4MA0923.1chrI:3992875-3992883CCAATTAA+4.04
lin-14MA0261.1chrI:3992782-3992787AACAG+3.01
pal-1MA0924.1chrI:3992777-3992784TAATGAA+3.17
pal-1MA0924.1chrI:3992733-3992740CCATAAA+3.51
pal-1MA0924.1chrI:3992251-3992258TTATTAT-3.63
pal-1MA0924.1chrI:3992846-3992853TAATAAA+4.57
pha-4MA0546.1chrI:3992595-3992604GTTTCCATT-3.24
skn-1MA0547.1chrI:3992892-3992906TTCTTCTTCATTAT-3.91
vab-7MA0927.1chrI:3992777-3992784TAATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrI:3992899-3992906TCATTAT-3.35
vab-7MA0927.1chrI:3992876-3992883CAATTAA+3.7
zfh-2MA0928.1chrI:3992875-3992885CCAATTAAGG-3.56
Enhancer Sequence
CTGCGTTTTC AACAAAAAAT TCCAGAACTT TTTTGAATTT TTTTATTATG ATATATTTGG 60
TCATTTTAAC GCCATAGGCT TGGTTTTTAA TCATTTCCCA CTGGCTCTAC TCCCCCTTAA 120
AAAATTATAC ATTTTACAGT TAAATGCCTC TGTAGTCTAA AATAACTCGA AAACTTTGTT 180
GAAAAGTTCA TTTTCGGTTG TGAATATTGT GAAACAATAC TTCTCTATAT ATAGAATGAT 240
AGGAGAGATA GGAGCAACAA TCGTCCTTTC CCCCAATGTT TCACTTTTAT TTTTCTCTCA 300
ACTCTCTTCT CTTTTTCACC TCTCGCATCA TCATTTTTGC CTCCGTTTCC AGCCATTGCC 360
CCATATAATT GTGTCCTTCA CTGTTTGTTT CCATTCTTCT TTTCCATTAA ATATATGTTT 420
CCTGTTATTT CCAGCCAAAA ACTTTCAGGA ATCTCTGTTT CTATGGAATT TGATTTTAGA 480
TGATCTTCTG CCACGTCGTA AAATATTTTA TAGTGCTCTC TGGGCCATAA ACGTTTTAAG 540
ATCTGTCCAA CAGAAGGGAT CTGTGATGTA ATGAACAGAA TGGCGGGATG GAGGGATGGA 600
GATTATTATT GGCAGTGTGC CAAGTTACTA GAGATCGTAA TAAACAAGGG GGTCACAAAT 660
GGACCCCCAA TTAAGGGGAA TTATTCTTCT TCATTATCTC TCCTACAGGC G 711