EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE008-00110 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L4 
Coordinate
chrI:2011186-2012150 
TF binding sites/motifs
Number: 86             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:2012034-2012044CTTCTTCTTT-3.05
blmp-1MA0537.1chrI:2011255-2011265GGGGGGAGAA+3.16
blmp-1MA0537.1chrI:2011257-2011267GGGGAGAAAA+3.29
blmp-1MA0537.1chrI:2011227-2011237AAGTTGAAGA+3.33
blmp-1MA0537.1chrI:2011294-2011304CTTCTTCTTC-3.39
blmp-1MA0537.1chrI:2011297-2011307CTTCTTCTTC-3.39
blmp-1MA0537.1chrI:2011235-2011245GAAAAGAAAT+3.45
blmp-1MA0537.1chrI:2011300-2011310CTTCTTCTTT-3.4
blmp-1MA0537.1chrI:2011303-2011313CTTCTTTCTC-3.61
blmp-1MA0537.1chrI:2011480-2011490AAATGGAGGA+3.63
blmp-1MA0537.1chrI:2011396-2011406TCTCTCTCTC-3.72
blmp-1MA0537.1chrI:2012037-2012047CTTCTTTTTT-4.07
blmp-1MA0537.1chrI:2011241-2011251AAATCGAAAG+4.23
blmp-1MA0537.1chrI:2011247-2011257AAAGAGAAGG+4.39
blmp-1MA0537.1chrI:2011431-2011441AGAGAGAGAG+4.43
blmp-1MA0537.1chrI:2011989-2011999AAAAGGAAAA+4.7
blmp-1MA0537.1chrI:2012045-2012055TTTCTTTTTT-4.98
ceh-48MA0921.1chrI:2011900-2011908TATTGGCT-3.16
ces-2MA0922.1chrI:2011529-2011537TGGGTAAT-3.25
che-1MA0260.1chrI:2012033-2012038GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrI:2011316-2011330ATATACACACACAC-3.63
daf-12MA0538.1chrI:2011355-2011369TGTGTGTGTATATG+3.71
daf-12MA0538.1chrI:2011326-2011340ACACACACAGACAC-3.89
daf-12MA0538.1chrI:2011324-2011338ACACACACACAGAC-3.93
daf-12MA0538.1chrI:2011279-2011293TTACACCCACGCAG-4.25
daf-12MA0538.1chrI:2011365-2011379TATGTGTCTGCGTC+4.96
daf-12MA0538.1chrI:2011353-2011367TGTGTGTGTGTATA+5.15
daf-12MA0538.1chrI:2011318-2011332ATACACACACACAC-6.05
daf-12MA0538.1chrI:2011322-2011336ACACACACACACAG-6.59
daf-12MA0538.1chrI:2011320-2011334ACACACACACACAC-6.87
dsc-1MA0919.1chrI:2012059-2012068CCAATTATT+3.12
dsc-1MA0919.1chrI:2012059-2012068CCAATTATT-3.12
efl-1MA0541.1chrI:2011729-2011743AAATGCGGGAGAAG+3.26
efl-1MA0541.1chrI:2011811-2011825AATTCCCGCATTTT-3.95
efl-1MA0541.1chrI:2011875-2011889GACAGCGCCAAAAC+3.96
elt-3MA0542.1chrI:2011611-2011618GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:2012142-2012149CTTATAA+3.29
elt-3MA0542.1chrI:2011560-2011567GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:2011578-2011585GATAACA-4.15
elt-3MA0542.1chrI:2011596-2011603GATAACA-4.15
elt-3MA0542.1chrI:2011222-2011229GATAAAA-4.31
eor-1MA0543.1chrI:2012043-2012057TTTTTCTTTTTTTT-3.13
eor-1MA0543.1chrI:2012044-2012058TTTTCTTTTTTTTT-3.15
eor-1MA0543.1chrI:2011238-2011252AAGAAATCGAAAGA+3.25
eor-1MA0543.1chrI:2011236-2011250AAAAGAAATCGAAA+3.28
eor-1MA0543.1chrI:2011412-2011426CTGTGTCTCTTGTA-3.42
eor-1MA0543.1chrI:2012046-2012060TTCTTTTTTTTTGC-3.49
eor-1MA0543.1chrI:2011401-2011415CTCTCGGTTTTCTG-3.4
eor-1MA0543.1chrI:2012035-2012049TTCTTCTTTTTTTC-3.56
eor-1MA0543.1chrI:2011258-2011272GGGAGAAAAGGACG+3.61
eor-1MA0543.1chrI:2011426-2011440CAGCGAGAGAGAGA+3.61
eor-1MA0543.1chrI:2011250-2011264GAGAAGGGGGGAGA+3.64
eor-1MA0543.1chrI:2011292-2011306GTCTTCTTCTTCTT-3.68
eor-1MA0543.1chrI:2011983-2011997AAGAAAAAAAGGAA+3.71
eor-1MA0543.1chrI:2011295-2011309TTCTTCTTCTTCTT-3.82
eor-1MA0543.1chrI:2011393-2011407CTGTCTCTCTCTCG-3.92
eor-1MA0543.1chrI:2012038-2012052TTCTTTTTTTCTTT-3.99
eor-1MA0543.1chrI:2012040-2012054CTTTTTTTCTTTTT-4.06
eor-1MA0543.1chrI:2011248-2011262AAGAGAAGGGGGGA+4.24
eor-1MA0543.1chrI:2011428-2011442GCGAGAGAGAGAGC+4.43
eor-1MA0543.1chrI:2011298-2011312TTCTTCTTCTTTCT-4.4
eor-1MA0543.1chrI:2011391-2011405CACTGTCTCTCTCT-4.64
eor-1MA0543.1chrI:2011395-2011409GTCTCTCTCTCGGT-4.94
eor-1MA0543.1chrI:2011410-2011424TTCTGTGTCTCTTG-6.15
eor-1MA0543.1chrI:2011370-2011384GTCTGCGTCTCTAC-6.92
fkh-2MA0920.1chrI:2011317-2011324TATACAC+3.16
fkh-2MA0920.1chrI:2011361-2011368TGTATAT-3.16
fkh-2MA0920.1chrI:2011970-2011977TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:2011646-2011653TTTTTAC-3.4
lim-4MA0923.1chrI:2012000-2012008TAATGGGA-3.04
lim-4MA0923.1chrI:2012059-2012067CCAATTAT+3.37
lin-14MA0261.1chrI:2011495-2011500AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrI:2012098-2012110TTGTTGCAATAT+4.62
pal-1MA0924.1chrI:2011221-2011228TGATAAA+3.1
pal-1MA0924.1chrI:2011973-2011980TTATTGT-3.46
sma-4MA0925.1chrI:2011368-2011378GTGTCTGCGT+3.33
sma-4MA0925.1chrI:2011331-2011341CACAGACACC-3.85
snpc-4MA0544.1chrI:2011369-2011380TGTCTGCGTCT+3.93
unc-62MA0918.1chrI:2011872-2011883GGAGACAGCGC-3.24
unc-62MA0918.1chrI:2011647-2011658TTTTACAGCTG-3.2
unc-62MA0918.1chrI:2011601-2011612CAAGACATGTG-3.48
unc-86MA0926.1chrI:2011270-2011277CGCATAT-3.18
vab-7MA0927.1chrI:2012060-2012067CAATTAT+3.03
vab-7MA0927.1chrI:2012000-2012007TAATGGG-3.16
zfh-2MA0928.1chrI:2012059-2012069CCAATTATTA-3.04
zfh-2MA0928.1chrI:2011995-2012005AAAATTAATG-3.09
Enhancer Sequence
GGTGGTAAAC GGTAGGAAAT AGGTTGTGAA TAAAGTGATA AAAGTTGAAG AAAAGAAATC 60
GAAAGAGAAG GGGGGAGAAA AGGACGCATA TTATTACACC CACGCAGTCT TCTTCTTCTT 120
CTTTCTCACA ATATACACAC ACACACACAG ACACCAGATC ACTTTTCTGT GTGTGTGTAT 180
ATGTGTCTGC GTCTCTACCA CGAATCACTG TCTCTCTCTC GGTTTTCTGT GTCTCTTGTA 240
CAGCGAGAGA GAGAGCACCG GAAGTTCGGA TGATGGACCA TTTGTGAAAG TGGGAAATGG 300
AGGACGGAGA ACACGGAAAG TTTTGGAATT TATTCAAATA TTTTGGGTAA TACCTAAAAA 360
TAAAGAATTT TCGTGAAAAA AATTGTCGTT GTGATAACAG ATAACACAGT GATAACAAGA 420
CATGTGATTA AAAATTATGT TTTTTTTTTG AAAATTTTAT TTTTTACAGC TGGAAAAGTT 480
TAAACGTGTA CACGTGGTGT CAGAGTGTCT CTTATTTCGG TTTGATCTAC GTTGATCTAC 540
AAAAAATGCG GGAGAAGAGA CGCATAGTTT TCAACTGATT TTGCATGGTT AAGAACGTGC 600
TGACGTCACA TTTTTTTGGG CGAAAAATTC CCGCATTTTT TGTAGATCAA ACCGTATTGG 660
GACAGCCCCT GGCACTACTT GCGTGTGGAG ACAGCGCCAA AACACCACAT GGTGTATTGG 720
CTGCGCCTAC TTTTTCAATG AAATTTTACA TTTTTAGAGC AGTTTTGCCG TAAAATTCAG 780
CTGTTTTTTA TTGTTTGAAG AAAAAAAGGA AAATTAATGG GACAAGTACC AGCTCCTGCT 840
CCTCCGGGCT TCTTCTTTTT TTCTTTTTTT TTGCCAATTA TTATTACTCG GAGGAAGTTT 900
TTTTTTTTTT TTTTGTTGCA ATATTTTTTT TTCTAAAAGA ATTTTAATTT TAAATTCTTA 960
TAAC 964