EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE007-00898 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L3 
Coordinate
chrI:11960262-11961411 
TF binding sites/motifs
Number: 52             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:11960881-11960891AAATCGAATG+3.22
blmp-1MA0537.1chrI:11960592-11960602ATTCGATTTC-3.22
blmp-1MA0537.1chrI:11960713-11960723TATCCTTTTC-3.27
blmp-1MA0537.1chrI:11960400-11960410CATCAATTTT-3.38
blmp-1MA0537.1chrI:11960671-11960681AAAATGAGGC+3.44
blmp-1MA0537.1chrI:11961094-11961104AAATTGAAAT+3.85
ces-2MA0922.1chrI:11960269-11960277TTTCGCAA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:11960700-11960708ATATATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:11960701-11960709TATATAAT-3.3
dsc-1MA0919.1chrI:11960817-11960826CTAATTACC+4.01
dsc-1MA0919.1chrI:11960817-11960826CTAATTACC-4.01
dsc-1MA0919.1chrI:11960657-11960666GTAATTAGT+4.23
dsc-1MA0919.1chrI:11960657-11960666GTAATTAGT-4.23
efl-1MA0541.1chrI:11961023-11961037TCAGGCGGAAATTT+4.02
efl-1MA0541.1chrI:11960352-11960366TTTTGCCGCTAAAT-4.1
elt-3MA0542.1chrI:11960693-11960700TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:11960902-11960909TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:11960574-11960581GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:11961187-11961194GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:11960986-11960993GATAAAT-3.23
elt-3MA0542.1chrI:11960840-11960847TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:11960636-11960643GAAAAAA-3
lim-4MA0923.1chrI:11960658-11960666TAATTAGT-3.31
lim-4MA0923.1chrI:11960817-11960825CTAATTAC+3.34
lim-4MA0923.1chrI:11960657-11960665GTAATTAG+4.39
lim-4MA0923.1chrI:11960818-11960826TAATTACC-4.39
lin-14MA0261.1chrI:11960931-11960936AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrI:11960547-11960552TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:11961082-11961094TTTCCCAACAAA-3.55
mab-3MA0262.1chrI:11961073-11961085TTTTTGCAATTT+3.65
pal-1MA0924.1chrI:11960985-11960992TGATAAA+3.1
pha-4MA0546.1chrI:11961279-11961288GAGCAAAAA+3.12
skn-1MA0547.1chrI:11960395-11960409AAAATCATCAATTT-4.86
sma-4MA0925.1chrI:11960406-11960416TTTTCTAGAA+3.14
sma-4MA0925.1chrI:11960409-11960419TCTAGAAAAT-3.14
sma-4MA0925.1chrI:11961233-11961243TCTAGACCGA-3
unc-62MA0918.1chrI:11960602-11960613AAATGTCAAAA+3.22
unc-62MA0918.1chrI:11960870-11960881TTTGACATTTG-3.22
unc-86MA0926.1chrI:11960979-11960986TATGCGT+3.18
vab-7MA0927.1chrI:11960658-11960665TAATTAG+3.02
vab-7MA0927.1chrI:11960818-11960825TAATTAC-3.02
vab-7MA0927.1chrI:11960818-11960825TAATTAC+4.31
vab-7MA0927.1chrI:11960658-11960665TAATTAG-4.31
zfh-2MA0928.1chrI:11961385-11961395CAAATTATGA-3.01
zfh-2MA0928.1chrI:11960465-11960475ACTAATTTCA+3.03
zfh-2MA0928.1chrI:11960264-11960274ACTAATTTCG+3.05
zfh-2MA0928.1chrI:11961191-11961201AAAATTAAGA-3.05
zfh-2MA0928.1chrI:11960423-11960433GCTAATTCAC+3.1
zfh-2MA0928.1chrI:11960816-11960826CCTAATTACC+3.66
zfh-2MA0928.1chrI:11960657-11960667GTAATTAGTT-3.71
zfh-2MA0928.1chrI:11960656-11960666GGTAATTAGT+3.87
zfh-2MA0928.1chrI:11960817-11960827CTAATTACCG-3.98
Enhancer Sequence
CAACTAATTT CGCAAATTTT TTGATGTTTT TTCGCTGTTT TAGGTACATT TTCAGTGAAA 60
TTGGTTTTTT TTTTTCGGCA ATTTTCAGAA TTTTGCCGCT AAATTTGAAA TTTTCTGCGG 120
AAGAATTCTT CTAAAAATCA TCAATTTTCT AGAAAATTTT AGCTAATTCA CTAGAAAAAT 180
CAGCTGAAAA ATCGACTTTT TCAACTAATT TCAGGGATTT TTTGCTGATT CACGTAGATT 240
TTAATACAGT GCGTGCAACT TCTATAGCGC CCCCTATTTT TTTCGTGTTC CGTCACTTTC 300
CCTAACTTTT TTGAGAAAAC CATTATAGCC ATTCGATTTC AAATGTCAAA AAACCCCCTG 360
TCCGAAATTT TCATGAAAAA ATATCAAAGA CTACGGTAAT TAGTTTTGAA AAATGAGGCC 420
TTATGATCAT TTTTCTCAAT ATATAATACT ATATCCTTTT CAGAAATCTC ATAAAACTCG 480
GTATTTTATT GAAAAATAGC GAAAATTGGA GGGAGCGCTA TAGAAGTTCC ACGGTCGTTT 540
TTCAGACTTT TTGACCTAAT TACCGTAGTC TTTGATATTT TTTCATGAAA ATTTCGGACA 600
GGGGGTTTTT TGACATTTGA AATCGAATGG CTATAATGGT TTTCTCAAAA AAGTTAGGGA 660
AAGTGACGGA ACACGAAAAA AATAGGGGGC GCTATAGAAG TTGCACGCAC TGTACAATAT 720
GCGTGATAAA TCAGCTGAAT TTCGCCATTT TTGAGGAATT TTCAGGCGGA AATTTGAGCT 780
TTTCAGAAAG TTTTCATCGA AAAATGAGCA ATTTTTGCAA TTTCCCAACA AAAAATTGAA 840
ATTTTCGCTC AAAATGGGCA AAAACGGGGG CTTTTGTGCC CAATTTTAGA ATTTTTCGGG 900
CAAAAATCAA ATTTTAATAG AAATTGCTAA AAATTAAGAT TTTCAGCCAA ATTTCAGAAT 960
TTTCAGGAAG TTCTAGACCG AATTTTGGGG TTTTCAGTAC TTTTTTTCGC TCAAACTGAG 1020
CAAAAATTAG GCTTTTGAGC TAATTTTTCG CCATTTTTTG GGGGGTTTTC AGCAAAAATT 1080
CGGAATTTTT GGCGTAAAAC TCAATTTTCA ATAGAAATTA CTTCAAATTA TGATTTTAAG 1140
CTAATTTTC 1149