EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE007-00600 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L3 
Coordinate
chrI:8280875-8281833 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8281273-8281283TAAACGAAAA+3.14
blmp-1MA0537.1chrI:8281216-8281226CATCACCTTT-3.18
blmp-1MA0537.1chrI:8281439-8281449AAATTGAAGA+3.97
ceh-22MA0264.1chrI:8281138-8281148CCACTTGTCG+3.84
ceh-48MA0921.1chrI:8281253-8281261ACCAATAA+3.2
ceh-48MA0921.1chrI:8281182-8281190GTCAATAT+3.31
ceh-48MA0921.1chrI:8281064-8281072CTCGATAT+3.41
ces-2MA0922.1chrI:8280880-8280888TTTTATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:8281620-8281628TTACATAG+3.78
che-1MA0260.1chrI:8281761-8281766AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrI:8281556-8281561AAACC+3.36
daf-12MA0538.1chrI:8281239-8281253ACACACACGGGTAC-3.54
daf-12MA0538.1chrI:8281235-8281249ACACACACACACGG-3.76
daf-12MA0538.1chrI:8281229-8281243TACCACACACACAC-4.81
daf-12MA0538.1chrI:8281231-8281245CCACACACACACAC-6.76
daf-12MA0538.1chrI:8281233-8281247ACACACACACACAC-8.26
dsc-1MA0919.1chrI:8280964-8280973CTAATTGAA+3
dsc-1MA0919.1chrI:8280964-8280973CTAATTGAA-3
efl-1MA0541.1chrI:8281759-8281773TGAAGCGGGAATAG+3.35
efl-1MA0541.1chrI:8281741-8281755CCCGACGCCAAAAA+3.46
elt-3MA0542.1chrI:8280999-8281006GATAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:8280883-8280890TATAAGA-3.29
elt-3MA0542.1chrI:8281527-8281534GATAAGT-3.75
elt-3MA0542.1chrI:8281364-8281371TTTTTCA+3
fkh-2MA0920.1chrI:8281359-8281366TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8281816-8281823AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:8281001-8281008TAAAAAA+3.3
hlh-1MA0545.1chrI:8281138-8281148CCACTTGTCG-3.23
hlh-1MA0545.1chrI:8281458-8281468AACAGCCGGG+3.31
hlh-1MA0545.1chrI:8281137-8281147ACCACTTGTC+3.33
hlh-1MA0545.1chrI:8281297-8281307ACATTTGGTG-3.37
lim-4MA0923.1chrI:8280965-8280973TAATTGAA-3.22
lim-4MA0923.1chrI:8281793-8281801TAATTGCC-3.26
lin-14MA0261.1chrI:8281458-8281463AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:8281191-8281196AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrI:8280921-8280928TTATGAC-3.79
pal-1MA0924.1chrI:8281225-8281232TTATTAC-4.57
pha-4MA0546.1chrI:8280939-8280948ATTTACTGT-3.19
pha-4MA0546.1chrI:8281180-8281189TAGTCAATA+3.42
pha-4MA0546.1chrI:8281017-8281026ATTTGTCCA-3.45
skn-1MA0547.1chrI:8281440-8281454AATTGAAGAAATCT+3.62
unc-62MA0918.1chrI:8281293-8281304GCTGACATTTG-3.54
unc-86MA0926.1chrI:8280934-8280941TGGATAT-3.14
unc-86MA0926.1chrI:8281518-8281525TGAATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrI:8281163-8281170CAATTAT-3.15
vab-7MA0927.1chrI:8281012-8281019TCATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrI:8281515-8281522TCATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrI:8280965-8280972TAATTGA+3.6
Enhancer Sequence
CATAATTTTA TAAGAACGTT TTTCATGAAA ATACTTCGTA AAGCTTTTAT GACACGGTAT 60
GGATATTTAC TGTAAAGTAC CGTATTCCTC TAATTGAATT TACAGTATTC CCCTCGGTTG 120
ACCGGATAAA AAACAGCTCA TTATTTGTCC ACAGGATCCT TTATTCGATG CCAAGTGTAT 180
TCTGTGGTAC TCGATATGAC GGATGAATTA CCACCAAATT TGAACCATAT GTCGTCGACA 240
ATTCCGATGC TTGTCTTCTC CCACCACTTG TCGTCGTCAT CTTCTGCTCA ATTATCTTCG 300
CACCATAGTC AATATGAACA CTATCCAGAG AAAAGAGTCA CCATCACCTT TTATTACCAC 360
ACACACACAC ACGGGTACAC CAATAAAAGG GCAAGTCGTA AACGAAAAGC GCCTGCCTGC 420
TGACATTTGG TGATGCCCAC CCTTTCACAT CTGGCATCCT TGACCACTAT TACAGGAAGA 480
CGTTTGTTTT TTTTCAATGC CCGTTTGAAT CACTTTAGAG CATTCTCTAT AATTTGGAGC 540
TTTCGTAAAA TCACTTTGAA GGGAAAATTG AAGAAATCTA GGGAACAGCC GGGTGCAATC 600
GAGAACGGGG GCGAGTGGAG CTGCACAATT TAACAGAACC TCATGAATAT ATGATAAGTT 660
CGTGAATGCA ATCTCCATCA GAAACCTTAG CATGACGTTG AGATTTTAGG AGCAAAGTTT 720
TGCTTGAGCT CAGATGATAA TGATATTACA TAGATCTTCA CATAGATAAG CTCAACTTCG 780
TCCTTGGAGA TGGTTCTGAA ATTTTTTAGA ACTATTATAT TCAGTCAAAC ACCCTCTTGC 840
TTCCAAGAAA ACTCAAGCAT CCACCACCCG ACGCCAAAAA CGCCTGAAGC GGGAATAGAT 900
TTTCTTTTAG TGGTGTGATA ATTGCCACCC TCTGGTACAT GAAAACAACA TTAGGTGG 958