EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE007-00431 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L3 
Coordinate
chrI:6459750-6460538 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:6460342-6460352AGAAAGAGTA+3.15
blmp-1MA0537.1chrI:6460317-6460327AGAAAGAATG+3.22
blmp-1MA0537.1chrI:6460338-6460348GAAGAGAAAG+4.4
blmp-1MA0537.1chrI:6459859-6459869AAAATGAAAA+5.14
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:6460020-6460033TAACGAAATTAAT-4.34
ceh-22MA0264.1chrI:6460370-6460380CCACTTTAGA+3.54
ceh-48MA0921.1chrI:6460270-6460278ACCGATCA+3.16
ceh-48MA0921.1chrI:6460492-6460500ATCGATGA+3.26
ceh-48MA0921.1chrI:6460265-6460273TATCGACC-3.43
ceh-48MA0921.1chrI:6460210-6460218TATTGAAT-3.49
ceh-48MA0921.1chrI:6460487-6460495TATCGATC-4.35
ceh-48MA0921.1chrI:6460115-6460123ATCGATAT+4.57
ces-2MA0922.1chrI:6460353-6460361TGCGAAAT-3.01
dsc-1MA0919.1chrI:6460028-6460037TTAATTAAC+4.37
dsc-1MA0919.1chrI:6460028-6460037TTAATTAAC-4.37
elt-3MA0542.1chrI:6459864-6459871GAAAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrI:6460074-6460081TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrI:6460339-6460353AAGAGAAAGAGTAT+3.18
eor-1MA0543.1chrI:6460337-6460351GGAAGAGAAAGAGT+3.89
fkh-2MA0920.1chrI:6459852-6459859TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:6460173-6460180TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:6459826-6459833TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrI:6460124-6460131TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrI:6460477-6460484AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:6460275-6460282TCAACAC+3.57
fkh-2MA0920.1chrI:6459791-6459798TGTTGAC-3.63
hlh-1MA0545.1chrI:6459819-6459829TCATGTGTTT-3.18
lim-4MA0923.1chrI:6460028-6460036TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrI:6460029-6460037TAATTAAC-3.96
lin-14MA0261.1chrI:6459963-6459968TGTTC-3.01
mab-3MA0262.1chrI:6459913-6459925TTATTGCGAAAA+3.56
pal-1MA0924.1chrI:6460025-6460032AAATTAA+3.07
pal-1MA0924.1chrI:6460170-6460177GAATAAA+3.15
pal-1MA0924.1chrI:6460127-6460134TTATGGT-3.21
pha-4MA0546.1chrI:6460326-6460335GTTTGTTCA-3.77
skn-1MA0547.1chrI:6460044-6460058AAATTATGACTTTT+3.06
unc-62MA0918.1chrI:6459792-6459803GTTGACAGCTT-4.28
unc-86MA0926.1chrI:6460416-6460423TGACTAA-3.37
unc-86MA0926.1chrI:6460249-6460256TAGGAAT+3.42
unc-86MA0926.1chrI:6459925-6459932TTAATAT-3.47
vab-7MA0927.1chrI:6460029-6460036TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:6460029-6460036TAATTAA-3.22
zfh-2MA0928.1chrI:6460098-6460108AATAATTTGA+3.06
zfh-2MA0928.1chrI:6459921-6459931AAAATTAATA-3.06
zfh-2MA0928.1chrI:6460004-6460014AGAATTAACT-3.18
zfh-2MA0928.1chrI:6460024-6460034GAAATTAATT-3.22
zfh-2MA0928.1chrI:6460028-6460038TTAATTAACG-4.26
zfh-2MA0928.1chrI:6460027-6460037ATTAATTAAC+4.29
Enhancer Sequence
TGAGCTGCTT CACAAGAGCT TGGCGAAAGC AAAGGGCAAA GTGTTGACAG CTTAGTGGTG 60
GTAGTTGGAT CATGTGTTTT TATGTTTCCG GTGGGAGAAG GTTCAACAAA AAATGAAAAG 120
AAAAAGTTCA AGCGGCATGA ATCATTCTGA GTTTAAAACA AAATTATTGC GAAAATTAAT 180
ATTAAAACCT TTTCACAAAA CTTCAAGCTA ATCTGTTCAT GAAAATTTGA ATAATAGTTT 240
TTTCCCACCT ATTTAGAATT AACTTCATAT TAACGAAATT AATTAACGAA TCGAAAATTA 300
TGACTTTTCA GAATCATCTG AAGTTTTTTC ACATTCCATG CTGCATGGAA TAATTTGATC 360
CTGGAATCGA TATGTTTTTA TGGTATACTT TTTAACCTTC AATTTAGCTG GAAAAGTATG 420
GAATAAATAA TTCCCGAAGC TATGTACATA TATGTAGAAT TATTGAATGA TTGTGAGAAC 480
AACTTGACTT TAGCTTGAGT AGGAATCGGA ATGGCTATCG ACCGATCAAC ACTTAGGATT 540
GTAAGAATGG CAGTAAGAAT ATATTGAAGA AAGAATGTTT GTTCATAGGA AGAGAAAGAG 600
TATTGCGAAA TCATCATCGC CCACTTTAGA ATGGACGGGC GGTGAGCGGA CATAGAGAAT 660
TGTGAATGAC TAATGCTTTT GCAGAATCTA GGGCAAAATC GTAGGAACAA ACAATTGTAA 720
TACGGAGAAA ACAATCATAT CGATCGATGA TCATGGAGAA AAATGTGATT TAAGTGAGTA 780
GACTTGGA 788