EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE007-00169 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L3 
Coordinate
chrI:2749083-2750170 
TF binding sites/motifs
Number: 89             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:2749137-2749147AAGTAGAGAT+3.17
blmp-1MA0537.1chrI:2749630-2749640AAAGTGAGTT+3.18
blmp-1MA0537.1chrI:2749200-2749210AAGGCGATAA+3.35
blmp-1MA0537.1chrI:2749363-2749373GAAGAGAAAT+3.63
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:2749989-2750002AAAAGAAACCTAT-3.45
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:2749708-2749721TTGACTTAGTTAG+4.61
ceh-22MA0264.1chrI:2749466-2749476ATCAAGTACG-3.17
ceh-48MA0921.1chrI:2750128-2750136ATCAATGA+3.03
ceh-48MA0921.1chrI:2750109-2750117TTCGATAC+3.69
ceh-48MA0921.1chrI:2750056-2750064ATCAATAA+4.21
ces-2MA0922.1chrI:2749421-2749429CTACACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:2749545-2749553TGCGTAAT-4.46
che-1MA0260.1chrI:2749480-2749485GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:2749443-2749448AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrI:2749994-2749999AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:2749958-2749963AAGCC+3.7
daf-12MA0538.1chrI:2749250-2749264AGAGTGTCTGCAAA+4
dsc-1MA0919.1chrI:2749548-2749557GTAATTGAC+3.02
dsc-1MA0919.1chrI:2749548-2749557GTAATTGAC-3.02
dsc-1MA0919.1chrI:2749653-2749662ATAATTATT+3.11
dsc-1MA0919.1chrI:2749653-2749662ATAATTATT-3.11
dsc-1MA0919.1chrI:2749618-2749627TTAATTAAT+4.37
dsc-1MA0919.1chrI:2749618-2749627TTAATTAAT-4.37
efl-1MA0541.1chrI:2749660-2749674TTTTGCCGTTTTTG-3.11
elt-3MA0542.1chrI:2749986-2749993GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:2749144-2749151GATAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:2749271-2749278TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrI:2749132-2749146ATAAAAAGTAGAGA+3.2
eor-1MA0543.1chrI:2749364-2749378AAGAGAAATAGAAC+3.85
eor-1MA0543.1chrI:2749189-2749203AAAAAACGCAGAAG+3.88
fkh-2MA0920.1chrI:2749146-2749153TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:2749757-2749764TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:2749110-2749117TAAACAG+3.71
hlh-1MA0545.1chrI:2749233-2749243GACATCTGCC+3.27
hlh-1MA0545.1chrI:2749234-2749244ACATCTGCCA-3.31
hlh-1MA0545.1chrI:2749527-2749537ACACCTGCTG-3.74
hlh-1MA0545.1chrI:2749526-2749536AACACCTGCT+3.95
lim-4MA0923.1chrI:2749496-2749504GTAATTAC+3.06
lim-4MA0923.1chrI:2749497-2749505TAATTACA-3.06
lim-4MA0923.1chrI:2749623-2749631TAATGAGA-3.25
lim-4MA0923.1chrI:2749753-2749761TAATTGTT-3.28
lim-4MA0923.1chrI:2749619-2749627TAATTAAT-3.75
lim-4MA0923.1chrI:2749618-2749626TTAATTAA+3.96
lin-14MA0261.1chrI:2749448-2749453CGTTC-3.36
mab-3MA0262.1chrI:2749742-2749754ATATTGCTATTT+3.51
mab-3MA0262.1chrI:2749279-2749291ATTTTGCCATCT+3.65
pal-1MA0924.1chrI:2749571-2749578AAATAAA+3.12
pal-1MA0924.1chrI:2749753-2749760TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrI:2749130-2749137TAATAAA+3.63
pal-1MA0924.1chrI:2749497-2749504TAATTAC+3.85
pal-1MA0924.1chrI:2749497-2749504TAATTAC-3.85
pha-4MA0546.1chrI:2749257-2749266CTGCAAACA+3.11
pha-4MA0546.1chrI:2749209-2749218ATGAAAATA+3.1
pha-4MA0546.1chrI:2749926-2749935ATTTGCCAA-3.35
pha-4MA0546.1chrI:2750054-2750063AAATCAATA+3.55
skn-1MA0547.1chrI:2749319-2749333CAATGAAGATTTAT+3.74
sma-4MA0925.1chrI:2749680-2749690GGGTCTAGAA+3.11
sma-4MA0925.1chrI:2749733-2749743ACCAGAAAAA-3.18
sma-4MA0925.1chrI:2749229-2749239CATAGACATC-3.23
sma-4MA0925.1chrI:2749347-2749357CCTAGAAAAT-3.27
sma-4MA0925.1chrI:2749683-2749693TCTAGAAACA-3.38
sma-4MA0925.1chrI:2749253-2749263GTGTCTGCAA+3.51
sma-4MA0925.1chrI:2750009-2750019TCCAGAAAAT-3.59
snpc-4MA0544.1chrI:2749798-2749809GCGGCCGACAT-6.87
unc-62MA0918.1chrI:2749288-2749299TCTGACAAGCT-3.04
unc-62MA0918.1chrI:2749092-2749103AGTTGTAATTT+3.13
unc-62MA0918.1chrI:2749230-2749241ATAGACATCTG-3.34
unc-62MA0918.1chrI:2749551-2749562ATTGACACGTC-3.41
unc-62MA0918.1chrI:2749692-2749703AGCTGTAAGCC+3.59
unc-86MA0926.1chrI:2749589-2749596TAGGCAT+3.83
unc-86MA0926.1chrI:2749917-2749924TGCCTAC-3.83
vab-7MA0927.1chrI:2749714-2749721TAGTTAG-3.05
vab-7MA0927.1chrI:2749549-2749556TAATTGA+3.09
vab-7MA0927.1chrI:2749619-2749626TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:2749619-2749626TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrI:2749753-2749760TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrI:2749654-2749661TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrI:2749654-2749661TAATTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrI:2749207-2749214TAATGAA+3.35
vab-7MA0927.1chrI:2749497-2749504TAATTAC+3.54
vab-7MA0927.1chrI:2749497-2749504TAATTAC-3.54
vab-7MA0927.1chrI:2749623-2749630TAATGAG-3.88
zfh-2MA0928.1chrI:2749751-2749761TTTAATTGTT+3.04
zfh-2MA0928.1chrI:2749495-2749505TGTAATTACA+3.29
zfh-2MA0928.1chrI:2749496-2749506GTAATTACAT-3.29
zfh-2MA0928.1chrI:2749652-2749662AATAATTATT+3.35
zfh-2MA0928.1chrI:2749653-2749663ATAATTATTT-3.38
zfh-2MA0928.1chrI:2749618-2749628TTAATTAATG-4.24
zfh-2MA0928.1chrI:2749617-2749627GTTAATTAAT+4.34
Enhancer Sequence
TTTTTAGAAA GTTGTAATTT TTTTCTATAA ACAGAAAAAA TTCAAAATAA TAAAAAGTAG 60
AGATAAAAAT CCTCCCAACT CCCCAGATGG GACAAACTCA TAAATCAAAA AACGCAGAAG 120
GCGATAATGA AAATACAACC TGCACACATA GACATCTGCC ACGTCACAGA GTGTCTGCAA 180
ACATATATTT TATCAGATTT TGCCATCTGA CAAGCTACAT TACCACCACT AGATTACAAT 240
GAAGATTTAT TGAGGGGTAC GTGGCCTAGA AAATTCGGTG GAAGAGAAAT AGAACTTTGC 300
GGACTCCAAG CATTAAATTT CAAAGTTTTC CACGCAGACT ACACAAGTAA ATTTTCAGTG 360
AAGCGCGTTC AAATTTCCCC ATTATCAAGT ACGCCACGTT TCACACAACG GATGTAATTA 420
CATCGGATTA CCTTTACAGT AACAACACCT GCTGCCACTA GTTGCGTAAT TGACACGTCA 480
CACTTTTGAA ATAAAGGTAG CCAAAGTAGG CATAGTAGTA GAGGTGATTG ATCAGTTAAT 540
TAATGAGAAA GTGAGTTTTA TTTGGCTGGA ATAATTATTT TGCCGTTTTT GGATAGGGGG 600
TCTAGAAACA GCTGTAAGCC CAAAATTGAC TTAGTTAGCA AGAATTGCCA ACCAGAAAAA 660
TATTGCTATT TAATTGTTTT TTGCAGTTAA ATTATTTTAA AACTTTACTC TTGGAGCGGC 720
CGACATCTTG CGGGCCCACT AGAAAATTAA AAAAGTGATC TGTCGTCGGA GATTTTAGCT 780
TACGGGCCTG CCTGCGTACA TGCCTGCCTA CATGCCTGCC TACGTGCCTA CCTATGCCTA 840
CATATTTGCC AATTTTAGGC TTACAGATTA TTTTGAAGCC ATGGAAAAAC TGAACTTTTA 900
TTTGACAAAA GAAACCTATA TAAATTTCCA GAAAATTGTT AAATTCTACA ATAGGTAATA 960
CGTTTACAGA AAAATCAATA AGCTTTAAAA ATAATTCCAG AACCCATTTG AAAATTTTTC 1020
CAAAAATTCG ATACATTTTT AAAAAATCAA TGAAATTTCA GAGAAAAATT TTCAAAACTA 1080
TCCAAGA 1087