EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE006-00963 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L2 
Coordinate
chrI:11416508-11416840 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:11416591-11416601TTTCGCTCAT-3.07
blmp-1MA0537.1chrI:11416542-11416552AAAATGAATT+3.12
blmp-1MA0537.1chrI:11416652-11416662AAAACGAGAA+4.36
ceh-48MA0921.1chrI:11416604-11416612TATTGATT-4.21
ces-2MA0922.1chrI:11416522-11416530TTTCGCAA+3.01
daf-12MA0538.1chrI:11416743-11416757GTGCATGCGCGCTC-3.25
dsc-1MA0919.1chrI:11416669-11416678TTAATTTAC+3.05
dsc-1MA0919.1chrI:11416669-11416678TTAATTTAC-3.05
efl-1MA0541.1chrI:11416771-11416785GTTGGAGGGAAGTT+3.44
elt-3MA0542.1chrI:11416820-11416827GATGAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:11416736-11416743TTTAGCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:11416555-11416562GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:11416823-11416830GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:11416628-11416635GATAAAA-4.31
fkh-2MA0920.1chrI:11416600-11416607TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:11416724-11416731TGTTGAC-3.76
hlh-1MA0545.1chrI:11416698-11416708AACAAATGGC+3.98
mab-3MA0262.1chrI:11416522-11416534TTTCGCAAGATT-4.23
mab-3MA0262.1chrI:11416643-11416655TTGTTGCAAAAA+4.27
pal-1MA0924.1chrI:11416624-11416631TAATGAT-3.26
pal-1MA0924.1chrI:11416710-11416717TAACAAA+3
pha-4MA0546.1chrI:11416605-11416614ATTGATTTT-3.55
skn-1MA0547.1chrI:11416579-11416593TTTTTCATGGATTT-3.66
skn-1MA0547.1chrI:11416805-11416819TTTTTCAGCGTTTT-5.07
sma-4MA0925.1chrI:11416726-11416736TTGACTGGAT+3.59
vab-7MA0927.1chrI:11416624-11416631TAATGAT-3.43
zfh-2MA0928.1chrI:11416668-11416678GTTAATTTAC+3.22
zfh-2MA0928.1chrI:11416546-11416556TGAATTAATG-3.28
Enhancer Sequence
TCAAGTTTTC ACGATTTCGC AAGATTTTCA CGAAAAAATG AATTAATGCT AAAATCAACG 60
ATTTTCCTTA GTTTTTCATG GATTTTCGCT CATTTTTATT GATTTTCAGC TGTTTTTAAT 120
GATAAAACGT GAAATTTGTT GCAAAAAACG AGAAAAAACG GTTAATTTAC GGGGTTTTTG 180
GCTGACAAAG AACAAATGGC GGTAACAAAA ACAGGTTGTT GACTGGATTT TAGCAGTGCA 240
TGCGCGCTCT ATTGAGAATT TTCGTTGGAG GGAAGTTTGA ATTTTGGTTT TTTGCAATTT 300
TTCAGCGTTT TTGATGAAAA AACGGCCAAA TT 332