EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE006-00317 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L2 
Coordinate
chrI:3992182-3992972 
TF binding sites/motifs
Number: 50             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:3992891-3992901ATTCTTCTTC-3.06
blmp-1MA0537.1chrI:3992601-3992611ATTCTTCTTT-3.07
blmp-1MA0537.1chrI:3992504-3992514TCTCAACTCT-3.26
blmp-1MA0537.1chrI:3992596-3992606TTTCCATTCT-3.29
blmp-1MA0537.1chrI:3992511-3992521TCTCTTCTCT-3.32
blmp-1MA0537.1chrI:3992450-3992460GGAGAGATAG+3.35
blmp-1MA0537.1chrI:3992903-3992913TATCTCTCCT-3.36
blmp-1MA0537.1chrI:3992196-3992206AAATTGATGA+3.38
blmp-1MA0537.1chrI:3992537-3992547CATCATTTTT-3.49
blmp-1MA0537.1chrI:3992604-3992614CTTCTTTTCC-3.5
blmp-1MA0537.1chrI:3992522-3992532TTTCACCTCT-3.66
blmp-1MA0537.1chrI:3992794-3992804GGATGGAGGG+3
blmp-1MA0537.1chrI:3992487-3992497TTTCACTTTT-4.43
blmp-1MA0537.1chrI:3992514-3992524CTTCTCTTTT-4.43
blmp-1MA0537.1chrI:3992516-3992526TCTCTTTTTC-4.7
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:3992283-3992296TAGGCTTGGTTTT+3.51
ceh-22MA0264.1chrI:3992321-3992331CCCCTTAAAA+3.13
ces-2MA0922.1chrI:3992773-3992781GATGTAAT-3.46
che-1MA0260.1chrI:3992553-3992558GTTTC-3.06
dpy-27MA0540.1chrI:3992724-3992739CTCTCTGGGCCATAA+4.06
dsc-1MA0919.1chrI:3992875-3992884CCAATTAAG+3.31
dsc-1MA0919.1chrI:3992875-3992884CCAATTAAG-3.31
elt-3MA0542.1chrI:3992201-3992208GATGAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:3992295-3992302TTAATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:3992446-3992453GATAGGA-3.35
eor-1MA0543.1chrI:3992659-3992673ATCTCTGTTTCTAT-3.32
eor-1MA0543.1chrI:3992579-3992593GTGTCCTTCACTGT-3.47
eor-1MA0543.1chrI:3992515-3992529TTCTCTTTTTCACC-3.53
eor-1MA0543.1chrI:3992547-3992561GCCTCCGTTTCCAG-3.62
eor-1MA0543.1chrI:3992512-3992526CTCTTCTCTTTTTC-3.64
eor-1MA0543.1chrI:3992661-3992675CTCTGTTTCTATGG-3.73
eor-1MA0543.1chrI:3992517-3992531CTCTTTTTCACCTC-4.27
fkh-2MA0920.1chrI:3992217-3992224TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3992385-3992392TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3992248-3992255TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:3992849-3992856TAAACAA+4.31
hlh-1MA0545.1chrI:3992464-3992474AACAATCGTC+3.26
lim-4MA0923.1chrI:3992875-3992883CCAATTAA+4.04
lin-14MA0261.1chrI:3992782-3992787AACAG+3.01
pal-1MA0924.1chrI:3992777-3992784TAATGAA+3.17
pal-1MA0924.1chrI:3992733-3992740CCATAAA+3.51
pal-1MA0924.1chrI:3992251-3992258TTATTAT-3.63
pal-1MA0924.1chrI:3992846-3992853TAATAAA+4.57
pha-4MA0546.1chrI:3992595-3992604GTTTCCATT-3.24
skn-1MA0547.1chrI:3992892-3992906TTCTTCTTCATTAT-3.91
skn-1MA0547.1chrI:3992197-3992211AATTGATGAAAACT+4.83
vab-7MA0927.1chrI:3992777-3992784TAATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrI:3992899-3992906TCATTAT-3.35
vab-7MA0927.1chrI:3992876-3992883CAATTAA+3.7
zfh-2MA0928.1chrI:3992875-3992885CCAATTAAGG-3.56
Enhancer Sequence
CAACAACTTC CAAAAAATTG ATGAAAACTG CGTTTTCAAC AAAAAATTCC AGAACTTTTT 60
TGAATTTTTT TATTATGATA TATTTGGTCA TTTTAACGCC ATAGGCTTGG TTTTTAATCA 120
TTTCCCACTG GCTCTACTCC CCCTTAAAAA ATTATACATT TTACAGTTAA ATGCCTCTGT 180
AGTCTAAAAT AACTCGAAAA CTTTGTTGAA AAGTTCATTT TCGGTTGTGA ATATTGTGAA 240
ACAATACTTC TCTATATATA GAATGATAGG AGAGATAGGA GCAACAATCG TCCTTTCCCC 300
CAATGTTTCA CTTTTATTTT TCTCTCAACT CTCTTCTCTT TTTCACCTCT CGCATCATCA 360
TTTTTGCCTC CGTTTCCAGC CATTGCCCCA TATAATTGTG TCCTTCACTG TTTGTTTCCA 420
TTCTTCTTTT CCATTAAATA TATGTTTCCT GTTATTTCCA GCCAAAAACT TTCAGGAATC 480
TCTGTTTCTA TGGAATTTGA TTTTAGATGA TCTTCTGCCA CGTCGTAAAA TATTTTATAG 540
TGCTCTCTGG GCCATAAACG TTTTAAGATC TGTCCAACAG AAGGGATCTG TGATGTAATG 600
AACAGAATGG CGGGATGGAG GGATGGAGAT TATTATTGGC AGTGTGCCAA GTTACTAGAG 660
ATCGTAATAA ACAAGGGGGT CACAAATGGA CCCCCAATTA AGGGGAATTA TTCTTCTTCA 720
TTATCTCTCC TACAGGCGAT ATTTTCAAGT TTCTACCAAA TTTCGAATTC GAGAACCCCA 780
ATTTTTAAAT 790