EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE006-00192 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L2 
Coordinate
chrI:2189400-2190138 
TF binding sites/motifs
Number: 57             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:2189582-2189592TCTCTACCTT-3.32
blmp-1MA0537.1chrI:2189420-2189430CCTCTCTTTT-3.56
blmp-1MA0537.1chrI:2189573-2189583TCTCCATTCT-3.66
blmp-1MA0537.1chrI:2189422-2189432TCTCTTTTTT-4.76
blmp-1MA0537.1chrI:2189883-2189893TTTCCCTTTT-5.25
daf-12MA0538.1chrI:2189486-2189500TGTGTGTGTGATGA+3.55
daf-12MA0538.1chrI:2189470-2189484TATGTGTGTGTGTG+4.41
daf-12MA0538.1chrI:2189484-2189498TGTGTGTGTGTGAT+6.28
daf-12MA0538.1chrI:2189472-2189486TGTGTGTGTGTGTG+6.52
daf-12MA0538.1chrI:2189474-2189488TGTGTGTGTGTGTG+8.26
daf-12MA0538.1chrI:2189476-2189490TGTGTGTGTGTGTG+8.26
daf-12MA0538.1chrI:2189478-2189492TGTGTGTGTGTGTG+8.26
daf-12MA0538.1chrI:2189480-2189494TGTGTGTGTGTGTG+8.26
daf-12MA0538.1chrI:2189482-2189496TGTGTGTGTGTGTG+8.26
dsc-1MA0919.1chrI:2190005-2190014ATAATTACA+3.08
dsc-1MA0919.1chrI:2190005-2190014ATAATTACA-3.08
dsc-1MA0919.1chrI:2189875-2189884TTAATTATT+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:2189875-2189884TTAATTATT-3.33
dsc-1MA0919.1chrI:2189752-2189761GTAATTACG+3.42
dsc-1MA0919.1chrI:2189752-2189761GTAATTACG-3.42
efl-1MA0541.1chrI:2189589-2189603CTTTGCCGCCTTTT-4.06
eor-1MA0543.1chrI:2189581-2189595CTCTCTACCTTTGC-3.75
eor-1MA0543.1chrI:2189564-2189578GTCGTTTTCTCTCC-4.69
fkh-2MA0920.1chrI:2189554-2189561TAAACAC+3.37
fkh-2MA0920.1chrI:2189427-2189434TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:2189867-2189874TATACAA+3.45
fkh-2MA0920.1chrI:2190015-2190022TGTATAC-3.45
lim-4MA0923.1chrI:2189753-2189761TAATTACG-3.22
lim-4MA0923.1chrI:2190006-2190014TAATTACA-3.22
lim-4MA0923.1chrI:2189752-2189760GTAATTAC+3.2
lim-4MA0923.1chrI:2189876-2189884TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrI:2189875-2189883TTAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrI:2189642-2189647TGTTC-3.14
mab-3MA0262.1chrI:2189996-2190008AAACGCAAGATA-3.76
pal-1MA0924.1chrI:2190006-2190013TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrI:2189625-2189632TTATGGC-3.51
pal-1MA0924.1chrI:2189876-2189883TAATTAT-3.54
pal-1MA0924.1chrI:2189753-2189760TAATTAC+3.85
pal-1MA0924.1chrI:2189753-2189760TAATTAC-3.85
pha-4MA0546.1chrI:2189864-2189873GAGTATACA+3.08
pha-4MA0546.1chrI:2189655-2189664GTTTGCTTT-3.16
sma-4MA0925.1chrI:2189951-2189961ATTTCTAGTG+3.04
sma-4MA0925.1chrI:2189737-2189747CATAGACATA-3.23
unc-62MA0918.1chrI:2189812-2189823ACTTGTCAAGC+3.75
vab-7MA0927.1chrI:2190006-2190013TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrI:2189753-2189760TAATTAC+3.54
vab-7MA0927.1chrI:2189753-2189760TAATTAC-3.54
vab-7MA0927.1chrI:2190006-2190013TAATTAC+3.6
vab-7MA0927.1chrI:2189876-2189883TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:2190005-2190015ATAATTACAT-3.23
zfh-2MA0928.1chrI:2190004-2190014GATAATTACA+3.41
zfh-2MA0928.1chrI:2189751-2189761AGTAATTACG+3.43
zfh-2MA0928.1chrI:2189752-2189762GTAATTACGC-3.4
zfh-2MA0928.1chrI:2189875-2189885TTAATTATTT-3.54
zfh-2MA0928.1chrI:2189874-2189884TTTAATTATT+3.72
zfh-2MA0928.1chrI:2190096-2190106ACTAATTTTA+3
zfh-2MA0928.1chrI:2189776-2189786AAAATTAGTT-3
Enhancer Sequence
AAAATCCCTA TCATCATTCA CCTCTCTTTT TTATATTACC ACTATTAACA ATCCAATTTA 60
TGAGCCCTGT TATGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGATGA GCACAAAAGA GCACCACACC 120
TACCTTGTCA AAAGGACGTG TATTATTGAG GTATTAAACA CTTTGTCGTT TTCTCTCCAT 180
TCTCTCTACC TTTGCCGCCT TTTCCGAATA TTTTATGTTT GGAATTTATG GCTCCGTTCG 240
TATGTTCGTT CGTGCGTTTG CTTTTACGAT TTTTTTTAAT CGAAAATTTG AATTTTTAGT 300
TAACAACTCT GTAGATGTGA ATTTGATACC GTTATGCCAT AGACATATCG TAGTAATTAC 360
GCTCAAAAAA TGGCCTAAAA TTAGTTAAAA TTTGAAATTT GAAATTTGAC CGACTTGTCA 420
AGCGGCTGGA AACTAACTTT TTTTGGAAAT CACCGTCAAA TTTTGAGTAT ACAATTTAAT 480
TATTTTCCCT TTTCAACTCG ATTTAGGTAC ATTTGAGGGC AACGGATCAC CAGATTTTGT 540
GAAATTTGGT AATTTCTAGT GATCCATTGA CCTTAAATGT ACCTAAATCG AGTTGAAAAC 600
GCAAGATAAT TACATTGTAT ACCCAAAATT TGACGGTGAT TTCAAAAAAA ACTTAGTTTC 660
CAGCTGCTTG AAAAGTCGGT CAAATTTCAT ATTTTAACTA ATTTTAGGCC ATTTTTTGAG 720
CCGGCTTAAC TGGTTTTT 738