EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE005-00053 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Larvae_L1 
Coordinate
chrI:2076560-2077509 
TF binding sites/motifs
Number: 65             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:2076940-2076950CTTCTTTTTC-3.49
blmp-1MA0537.1chrI:2076694-2076704TTTCGATTTT-3.57
blmp-1MA0537.1chrI:2076633-2076643AAAGTGATAA+4.38
blmp-1MA0537.1chrI:2077184-2077194AAATGGAAAA+4.47
blmp-1MA0537.1chrI:2076881-2076891TTTCCATTTT-4.47
blmp-1MA0537.1chrI:2077291-2077301AAATAGAAAA+4.67
blmp-1MA0537.1chrI:2077496-2077506AAATTGAAAA+4.82
ceh-22MA0264.1chrI:2076981-2076991ATACTTGACC+3.46
ceh-22MA0264.1chrI:2077401-2077411GTGGAGTGCG-3.62
ceh-48MA0921.1chrI:2076829-2076837TTCGATAC+3.07
ceh-48MA0921.1chrI:2076977-2076985TTCAATAC+3.13
ceh-48MA0921.1chrI:2077121-2077129TATTGATT-4.21
ceh-48MA0921.1chrI:2077012-2077020ATCGATAA+4.96
ces-2MA0922.1chrI:2077172-2077180TGTGTAAG-3.15
ces-2MA0922.1chrI:2077481-2077489TATATGAT-3.25
ces-2MA0922.1chrI:2076643-2076651TTAAATAA+3.54
che-1MA0260.1chrI:2076827-2076832GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:2076939-2076944GCTTC-3.7
dpy-27MA0540.1chrI:2076994-2077009CTCCCCCCGCCAGAA+3.46
dsc-1MA0919.1chrI:2076775-2076784CTCATTAGG+3.04
dsc-1MA0919.1chrI:2076775-2076784CTCATTAGG-3.04
dsc-1MA0919.1chrI:2077301-2077310ATAATTAAA+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:2077301-2077310ATAATTAAA-3.33
dsc-1MA0919.1chrI:2076639-2076648ATAATTAAA+3.39
dsc-1MA0919.1chrI:2076639-2076648ATAATTAAA-3.39
efl-1MA0541.1chrI:2077280-2077294CTAGACGCGAAAAA+3.53
elt-3MA0542.1chrI:2077449-2077456GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:2077015-2077022GATAAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrI:2077140-2077147CTTATCA+4.66
eor-1MA0543.1chrI:2077286-2077300GCGAAAAATAGAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:2077264-2077271TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrI:2076626-2076633TGTTTAA-3.48
hlh-1MA0545.1chrI:2077057-2077067TCACCTGATC-3.3
hlh-1MA0545.1chrI:2077079-2077089GCAACTGCCA-3.5
hlh-1MA0545.1chrI:2077078-2077088GGCAACTGCC+3.94
lim-4MA0923.1chrI:2076776-2076784TCATTAGG-3.06
lim-4MA0923.1chrI:2076775-2076783CTCATTAG+3.36
lim-4MA0923.1chrI:2077301-2077309ATAATTAA+3.57
lim-4MA0923.1chrI:2076639-2076647ATAATTAA+3.71
lim-4MA0923.1chrI:2076640-2076648TAATTAAA-3
lim-4MA0923.1chrI:2077302-2077310TAATTAAA-3
lin-14MA0261.1chrI:2076913-2076918AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:2076975-2076980TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:2076811-2076823AAATGCAAAATC-3.53
mab-3MA0262.1chrI:2076683-2076695GTTGGCAAAAAT-3.62
mab-3MA0262.1chrI:2077362-2077374ATTGGCAACATT-6.49
pal-1MA0924.1chrI:2076742-2076749CCATAAC+3.32
pal-1MA0924.1chrI:2076856-2076863TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrI:2076640-2076647TAATTAA+3.54
pal-1MA0924.1chrI:2077302-2077309TAATTAA+3.54
pha-4MA0546.1chrI:2076584-2076593GCTTACATT-3.12
pha-4MA0546.1chrI:2077122-2077131ATTGATTAT-3.24
skn-1MA0547.1chrI:2077362-2077376ATTGGCAACATTTT-3.07
skn-1MA0547.1chrI:2077442-2077456ATATCATGATTAAA+4.13
sma-4MA0925.1chrI:2077279-2077289TCTAGACGCG-3.11
sma-4MA0925.1chrI:2077276-2077286GTTTCTAGAC+3.51
sma-4MA0925.1chrI:2076660-2076670TCCAGACTCT-3.55
sma-4MA0925.1chrI:2077002-2077012GCCAGAAATG-3.63
vab-7MA0927.1chrI:2076776-2076783TCATTAG+3.02
vab-7MA0927.1chrI:2076640-2076647TAATTAA+4.09
vab-7MA0927.1chrI:2077302-2077309TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:2076638-2076648GATAATTAAA+3.45
zfh-2MA0928.1chrI:2077300-2077310AATAATTAAA+3.54
zfh-2MA0928.1chrI:2077301-2077311ATAATTAAAA-3.64
zfh-2MA0928.1chrI:2076639-2076649ATAATTAAAT-3.68
Enhancer Sequence
TTGTCCCCCA CTGGTCGAAA ATGTGCTTAC ATTAACGAAT AAATGTCTAA TAAAAGACCA 60
AAATATTGTT TAAAAAGTGA TAATTAAATA AAACTTAAGT TCCAGACTCT ACGACACCGA 120
GAAGTTGGCA AAAATTTCGA TTTTAGCTGA AAATGGGCTA TTTTTCCCAG AACTTTGAAC 180
CGCCATAACC TTTTTTTGAG AAATTTTCAA AACGCCTCAT TAGGTAGTTT TCGGTAGTAT 240
TTTGGGTCTA AAAATGCAAA ATCTCAGGTT TCGATACTCC ACCTTTGACC TTCTATTTAT 300
TGTCTCCCAT CCCCCGTTTT TTTTCCATTT TTGTGGGCTC CCAATTCGTT ATGAACAGTG 360
AGCTGGTTTT TCATCGCAGG CTTCTTTTTC CAGCAGTTAC GAAGCAGACG TTCTGTGTTC 420
AATACTTGAC CATTCTCCCC CCGCCAGAAA TGATCGATAA GAGGTGGTCC TCGGAGACCC 480
GCGCGCGTGC GCATAGGTCA CCTGATCACG TGGTGAAGGG CAACTGCCAT TGTTTCAACG 540
CCGGAATATT TTTTGAACCT TTATTGATTA TCTCAAGTTT CTTATCAAAT TTTCGAAAAT 600
TTGCCTTTCT TTTGTGTAAG GGGAAAATGG AAAAATTACG ATTTTTGTTT CCATCGGAAA 660
CAAACAAAAT GTGTTTTGTG GTGTGACCAA ACGTCATTTT GTGTTGTTTT CTTGAAGTTT 720
CTAGACGCGA AAAATAGAAA AATAATTAAA ACTTTCTATA AAATTACCAA CTTTCAGATT 780
TCGGAAGGAT TTTATTAAAA AAATTGGCAA CATTTTTGAT TTTCAATGAA ATTTTTTTAA 840
GGTGGAGTGC GCCCAGTGGG AAAATTGCTT CACAATGGCC GAATATCATG ATTAAAAAAT 900
TCAAAAAAAA TTTCTAAATT TTATATGATT TTTTGAAAAT TGAAAAATC 949