EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-05912 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrIII:12917713-12918508 
TF binding sites/motifs
Number: 47             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:12918101-12918111AAATCGATAT+3.12
blmp-1MA0537.1chrIII:12918025-12918035TGAGTGAGAG+3.17
blmp-1MA0537.1chrIII:12918021-12918031AAAATGAGTG+3.46
blmp-1MA0537.1chrIII:12917816-12917826CCTCAATTTC-3.81
blmp-1MA0537.1chrIII:12917748-12917758TTTCGTTTTC-4.49
blmp-1MA0537.1chrIII:12918457-12918467TTTCAATTTT-4.82
ceh-48MA0921.1chrIII:12918239-12918247AATTGATT-3.22
ceh-48MA0921.1chrIII:12918103-12918111ATCGATAT+4.57
ces-2MA0922.1chrIII:12918141-12918149TTGCACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrIII:12918010-12918018TATATATT-3.12
ces-2MA0922.1chrIII:12918428-12918436TTATTTAA+3.38
ces-2MA0922.1chrIII:12918429-12918437TATTTAAT-3.54
ces-2MA0922.1chrIII:12918005-12918013TACGTTAT-4.33
dsc-1MA0919.1chrIII:12918241-12918250TTGATTAAC+3.09
dsc-1MA0919.1chrIII:12918241-12918250TTGATTAAC-3.09
dsc-1MA0919.1chrIII:12918237-12918246TTAATTGAT+3.43
dsc-1MA0919.1chrIII:12918237-12918246TTAATTGAT-3.43
efl-1MA0541.1chrIII:12917768-12917782ATTTTGCGCGTCAA-3.67
efl-1MA0541.1chrIII:12918494-12918508TTCAGCGCGAAAAA+3.87
elt-3MA0542.1chrIII:12917982-12917989GATAACA-4.15
eor-1MA0543.1chrIII:12918022-12918036AAATGAGTGAGAGA+3.82
eor-1MA0543.1chrIII:12918039-12918053GCTAGACGCAGACA+4.06
fkh-2MA0920.1chrIII:12917843-12917850TATACAG+3.15
fkh-2MA0920.1chrIII:12917841-12917848TGTATAC-3.24
fkh-2MA0920.1chrIII:12918363-12918370TTTTTAT-3.3
lim-4MA0923.1chrIII:12918200-12918208TTCATTAA+3.07
lim-4MA0923.1chrIII:12918242-12918250TGATTAAC-3.14
lim-4MA0923.1chrIII:12918238-12918246TAATTGAT-3.5
lin-14MA0261.1chrIII:12918117-12918122AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrIII:12917830-12917837TTATTTC-3.12
pha-4MA0546.1chrIII:12917840-12917849ATGTATACA+3.12
pha-4MA0546.1chrIII:12917922-12917931ATTTGTTTG-3.48
pha-4MA0546.1chrIII:12917914-12917923ATGCAAATA+4.28
sma-4MA0925.1chrIII:12918464-12918474TTTTCTAGGC+3.17
sma-4MA0925.1chrIII:12918039-12918049GCTAGACGCA-3.18
sma-4MA0925.1chrIII:12918045-12918055CGCAGACAAT-3.27
sma-4MA0925.1chrIII:12918399-12918409CCTAGAAAAT-3.27
sma-4MA0925.1chrIII:12918420-12918430GCCAGACATT-5.42
unc-62MA0918.1chrIII:12918255-12918266AGTGACAACGT-3.18
unc-86MA0926.1chrIII:12917915-12917922TGCAAAT-3.09
unc-86MA0926.1chrIII:12917913-12917920TATGCAA+3.11
unc-86MA0926.1chrIII:12917860-12917867TGACTAA-3.37
unc-86MA0926.1chrIII:12917723-12917730TAGTCAT+3.42
unc-86MA0926.1chrIII:12918305-12918312TAGTCAT+3.42
unc-86MA0926.1chrIII:12918235-12918242TATTAAT+3.47
unc-86MA0926.1chrIII:12918135-12918142TGCATAT-4.66
zfh-2MA0928.1chrIII:12918236-12918246ATTAATTGAT+3.25
Enhancer Sequence
AGCGCTACAG TAGTCATTTA ATGGATTACT GTAGTTTTCG TTTTCGCTAA GATATATTTT 60
GCGCGTCAAA TATGTTGTGC AAAACGTATT CTCAGAATTT TTTCCTCAAT TTCCAGTTTA 120
TTTCCAAATG TATACAGTTC CGGTGCATGA CTAATGTCTT CAGGTGGGTG GCGGGTCGTC 180
TTCAAAGTTT CACCCCGCAA TATGCAAATA TTTGTTTGTA GAGCGAGTAT GCTCTTTACG 240
ATGGAAAGTC TCAAGGTCTA CAGCCTACTG ATAACAATGG TTAACATTGT TTTACGTTAT 300
ATATTTGGAA AATGAGTGAG AGATAGGCTA GACGCAGACA ATTTGGAAAA GCAAAACAAT 360
TTTAGAAAGA AGTTTCGAAA AAATTCGAAA ATCGATATTA TGGGAACACA GAATTCTGAG 420
AATGCATATT GCACAACATA TTTGACGCAC AAAATATAAC TATATCTCGT AGCGAAAACT 480
ACAGTAATTC ATTAAATGAC CTTGTGTCGA TTTACGGGCT TATATTAATT GATTAACCGA 540
ATAGTGACAA CGTTAAAAAA ATCGAGCCCG TCAATCGACA CCAGCGCTAC AGTAGTCATG 600
TAAAGAATTA CTGTAGTTTT CGCTACGAGA TATTTTGCGT GGCAATAATT TTTTTATATT 660
CTCGGTCCCT CAGAGGTGCT GCGTGGCCTA GAAAATTCTA AAATTCGGCC AGACATTATT 720
TAATGTAAGC TGAGAGGCCC AGGTTTTCAA TTTTTCTAGG CCACGTATTC TAGGCCACCC 780
ATTCAGCGCG AAAAA 795