EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-05568 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrIII:10539494-10540988 
TF binding sites/motifs
Number: 80             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:10539604-10539614AGGGGGAAAT+3.16
blmp-1MA0537.1chrIII:10539995-10540005AAATCGAGTG+3.17
blmp-1MA0537.1chrIII:10540339-10540349GGAATGAGGG+3.18
blmp-1MA0537.1chrIII:10540610-10540620TTTCATTCCC-3.18
blmp-1MA0537.1chrIII:10540779-10540789ATTCATTTTT-3.57
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:10540815-10540828TAACTATTCTAAT-5.16
ceh-22MA0264.1chrIII:10540412-10540422GCCCTTCAAA+3.31
ceh-22MA0264.1chrIII:10540032-10540042GCTCTTCAGA+3.36
ceh-22MA0264.1chrIII:10539556-10539566TTTAAGTGTT-3.37
ceh-22MA0264.1chrIII:10539961-10539971CCCCTTGAAC+3.51
ceh-22MA0264.1chrIII:10540538-10540548TTTAAGTAGA-3.57
ceh-22MA0264.1chrIII:10540119-10540129CACAAGTGGC-3.77
ceh-48MA0921.1chrIII:10539585-10539593TATTGGGT-3.1
ces-2MA0922.1chrIII:10540573-10540581AATATAAT-3.12
ces-2MA0922.1chrIII:10540465-10540473TAAATAAT-3.38
ces-2MA0922.1chrIII:10540008-10540016TACGAAAT-3.46
ces-2MA0922.1chrIII:10540007-10540015TTACGAAA+3.55
che-1MA0260.1chrIII:10539644-10539649GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrIII:10539925-10539939GCTCAAACACTCAC-3.27
daf-12MA0538.1chrIII:10540715-10540729TGTGCGTGGGTGTT+3.46
daf-12MA0538.1chrIII:10539929-10539943AAACACTCACATCA-3.58
daf-12MA0538.1chrIII:10540713-10540727GATGTGCGTGGGTG+3.66
daf-12MA0538.1chrIII:10539950-10539964CACCACCCACCCCC-3.92
daf-12MA0538.1chrIII:10540717-10540731TGCGTGGGTGTTAG+5.03
dpy-27MA0540.1chrIII:10540650-10540665AATGGCGCCGGGAGC-4.66
dsc-1MA0919.1chrIII:10540823-10540832CTAATGAGT+3.02
dsc-1MA0919.1chrIII:10540823-10540832CTAATGAGT-3.02
dsc-1MA0919.1chrIII:10540274-10540283TTCATTAGT+3.11
dsc-1MA0919.1chrIII:10540274-10540283TTCATTAGT-3.11
dsc-1MA0919.1chrIII:10540513-10540522TTAATGAGC+3.23
dsc-1MA0919.1chrIII:10540513-10540522TTAATGAGC-3.23
efl-1MA0541.1chrIII:10540106-10540120CTGCACGCCAAACC+3.61
elt-3MA0542.1chrIII:10539494-10539501GGTAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrIII:10540801-10540808GATAAAT-3.23
elt-3MA0542.1chrIII:10540201-10540208GAAAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrIII:10540304-10540311TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrIII:10540526-10540540TTTTTGCTCTCTTT-3.82
fkh-2MA0920.1chrIII:10539802-10539809AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:10540865-10540872AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:10539661-10539668TCAACAA+3.76
hlh-1MA0545.1chrIII:10540119-10540129CACAAGTGGC+3.28
hlh-1MA0545.1chrIII:10539969-10539979ACCAGCTGTC+4.31
hlh-1MA0545.1chrIII:10539970-10539980CCAGCTGTCG-4.5
lim-4MA0923.1chrIII:10540275-10540283TCATTAGT-3.11
lim-4MA0923.1chrIII:10540824-10540832TAATGAGT-3.35
lim-4MA0923.1chrIII:10539594-10539602TAATTGAA-3.3
lim-4MA0923.1chrIII:10540514-10540522TAATGAGC-3.58
lim-4MA0923.1chrIII:10540274-10540282TTCATTAG+3
lim-4MA0923.1chrIII:10540577-10540585TAATTATG-3
lin-14MA0261.1chrIII:10540189-10540194AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrIII:10540946-10540958TTTGGCAAAAAT-3.75
pal-1MA0924.1chrIII:10539577-10539584TAATGAT-3.26
pal-1MA0924.1chrIII:10540469-10540476TAATAAC+3.36
pha-4MA0546.1chrIII:10540527-10540536TTTTGCTCT-3.24
pha-4MA0546.1chrIII:10540809-10540818GTTTGCTAA-3.58
pha-4MA0546.1chrIII:10539658-10539667ATGTCAACA+4.06
sma-4MA0925.1chrIII:10540620-10540630AACAGACATC-3.51
sma-4MA0925.1chrIII:10540360-10540370CTTTCTGGAA+3.72
snpc-4MA0544.1chrIII:10540896-10540907TGTCGGCCGCT+6.87
unc-62MA0918.1chrIII:10540621-10540632ACAGACATCAC-3.08
unc-62MA0918.1chrIII:10540893-10540904AGATGTCGGCC+3.18
unc-62MA0918.1chrIII:10539972-10539983AGCTGTCGGAG+3.32
unc-62MA0918.1chrIII:10539517-10539528TCTGACATGGC-3.4
unc-62MA0918.1chrIII:10539872-10539883AAATGTCAGAG+3.54
unc-86MA0926.1chrIII:10540778-10540785TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrIII:10540824-10540831TAATGAG-3.02
vab-7MA0927.1chrIII:10540078-10540085TAACTAA+3.05
vab-7MA0927.1chrIII:10540577-10540584TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrIII:10540577-10540584TAATTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrIII:10539577-10539584TAATGAT-3.43
vab-7MA0927.1chrIII:10540275-10540282TCATTAG-3.82
vab-7MA0927.1chrIII:10540514-10540521TAATGAG-3.88
zfh-2MA0928.1chrIII:10540875-10540885AAAATTAAAT-3.01
zfh-2MA0928.1chrIII:10540292-10540302AAAATTAAAT-3.04
zfh-2MA0928.1chrIII:10539501-10539511TAAATTAAAA-3.07
zfh-2MA0928.1chrIII:10540905-10540915CTTAATTTTT+3.08
zfh-2MA0928.1chrIII:10539592-10539602TTTAATTGAA+3.15
zfh-2MA0928.1chrIII:10540575-10540585TATAATTATG+3.26
zfh-2MA0928.1chrIII:10540576-10540586ATAATTATGA-3.27
zfh-2MA0928.1chrIII:10539572-10539582TGAATTAATG-3.28
Enhancer Sequence
GGTAAAATAA ATTAAAAGAT TTTTCTGACA TGGCACGTGA TTTCTCAGAA GATTCTCAAA 60
AATTTAAGTG TTGTAAAATG AATTAATGAT TTATTGGGTT TAATTGAAAA AGGGGGAAAT 120
GGATCAGGAA AAGAATTTGG GACATAATGG GCTTCGGTCA GAATATGTCA ACAAATAAGG 180
TTTAGCCTAG GTCTAAATCA AGGCCTAAGG CTTAACCTCA GGTTAAACCC AAGGCTAAGC 240
TTAAGCCTAA TCCTAATCCT AAGTCTAAGG CCCAAGCCTA AGCCTAAACC AATGCCAAAA 300
ATTTTCCAAA AACAAGTATG ATTAAGCGAT TAAAATGACG AGAACTTTGT AAATGCCGGA 360
AATGGGAGAA AGTAGGTCAA ATGTCAGAGT AATCGGATCC ACCAACAAAA AGAGCCCGTT 420
GCCCGTCTGA TGCTCAAACA CTCACATCAA CCCCACCACC ACCCACCCCC CTTGAACCAG 480
CTGTCGGAGT TGTTGGTGCA AAAATCGAGT GCATTACGAA ATTCGAGACG TTGCTGTTGC 540
TCTTCAGAGG CTCCCCCAGG CTCCACCCAT TTTCTTAAGG GCGCTAACTA ACATATTTTT 600
TTTGGGTAAA ACCTGCACGC CAAACCACAA GTGGCCTATT TGCAACTGGC GGTGATTTTC 660
AAGTTTAATG TGGGAAAATG ACGAGCTGGG AAAAGAACAC CCATTTTGAA AAGAAACTTG 720
AAGATACGAG GTTTTCGCGA ATTTTAAATT TTTTAGAAAT TTGAAAAATA TTTGATCGAA 780
TTCATTAGTT TTCAAAACAA AATTAAATTT TTTTTCAGAA AATCCTAAAG TTCGAGAAAC 840
TTCTAGGAAT GAGGGAGATT TTGGAACTTT CTGGAAAATT TTAGATTTTG TTAATACTAG 900
ATTAAAAAAA TTTCTACAGC CCTTCAAAGT AACCTTTCTC AAACAAATTT TACATGGTTT 960
GAGTTTAAAT TTAAATAATA ACAGCAAAAA GTAACTTTTT GAAAAAGCGG ACAAAAATGT 1020
TAATGAGCCA TTTTTTTGCT CTCTTTTAAG TAGACTTTTC CATCATGATG GTGACCTCTA 1080
ATATAATTAT GATGATGTGG AGATGGAACG AGGACATTTC ATTCCCAACA GACATCACTT 1140
TAAGAAACAA AATAACAATG GCGCCGGGAG CTCCGCAGTG AGATTTAGGG CAAGAAAAAT 1200
ACAAAACAAG TATTTAGGTG ATGTGCGTGG GTGTTAGTCA CTTGAGGAGC CAAGATGTGG 1260
GTGGAGTCTG TTGTGAACAA AAAATATTCA TTTTTAGGTT TTTTTTTGAT AAATTGTTTG 1320
CTAACTATTC TAATGAGTTT TACCGAAAAC TATATCTATA AAAAGTACAA GAAAACAAAA 1380
AAAAATTAAA TGGCCCACGA GATGTCGGCC GCTTAATTTT TTTAAAAGAA ATTCAAAACT 1440
AGGGCCTGAA AATTTGGCAA AAATTATTAA AACACTGGTG GCCGAGTTTT CCCT 1494