EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-05541 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrIII:10237349-10238906 
TF binding sites/motifs
Number: 89             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:10237941-10237951CTTCTATTCT-3.01
blmp-1MA0537.1chrIII:10238504-10238514ATTCTCTCCC-3.06
blmp-1MA0537.1chrIII:10238422-10238432ATTCAATTCT-3.09
blmp-1MA0537.1chrIII:10237619-10237629ACTCAATTTT-3.36
blmp-1MA0537.1chrIII:10238021-10238031TATCGATTTT-3.59
blmp-1MA0537.1chrIII:10238476-10238486CTTCGTTTTT-3.78
blmp-1MA0537.1chrIII:10238584-10238594AGAGAGAAGG+3.88
blmp-1MA0537.1chrIII:10238603-10238613TCTCTATTTT-4.51
blmp-1MA0537.1chrIII:10238574-10238584AGAGAGAAAA+4.67
blmp-1MA0537.1chrIII:10238580-10238590AAAAAGAGAG+4.69
blmp-1MA0537.1chrIII:10238582-10238592AAAGAGAGAA+5.33
blmp-1MA0537.1chrIII:10238554-10238564TTTCACTTTT-6.34
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:10237577-10237590TTAGTTTATTTAC+3.06
ceh-22MA0264.1chrIII:10238042-10238052TTTAAGAGCA-3.16
ceh-22MA0264.1chrIII:10238404-10238414ACACTTTAAA+3.26
ceh-22MA0264.1chrIII:10238622-10238632ATACTTCACC+3.29
ceh-22MA0264.1chrIII:10238388-10238398TTTAAGTGTT-3.47
ceh-22MA0264.1chrIII:10238525-10238535CCACTCAACT+3.57
ceh-22MA0264.1chrIII:10237419-10237429GTCAAGTGGC-6.12
ceh-48MA0921.1chrIII:10238021-10238029TATCGATT-5.22
ces-2MA0922.1chrIII:10238358-10238366TACGTTAT-3.15
ces-2MA0922.1chrIII:10237683-10237691TTGTATAA+3.19
ces-2MA0922.1chrIII:10237499-10237507GACATAAT-3.27
daf-12MA0538.1chrIII:10238636-10238650AAACAATCACAGTC-3.28
daf-12MA0538.1chrIII:10238632-10238646CAACAAACAATCAC-3.2
efl-1MA0541.1chrIII:10238101-10238115TCAGGCGGCATAAA+3.06
efl-1MA0541.1chrIII:10238309-10238323TTCTGCGGAAAATT+3.5
elt-3MA0542.1chrIII:10238174-10238181GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrIII:10238019-10238026TTTATCG+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:10238546-10238553TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:10238727-10238734TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:10237790-10237797GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIII:10237870-10237877TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:10238448-10238455TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:10238379-10238386CATAAGA-3.27
elt-3MA0542.1chrIII:10238538-10238545GATAACT-3.2
elt-3MA0542.1chrIII:10238440-10238447CTCATCA+3.35
elt-3MA0542.1chrIII:10237859-10237866CATATCA+3.58
elt-3MA0542.1chrIII:10238344-10238351TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:10238838-10238845TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:10238823-10238830GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:10238897-10238904GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIII:10238571-10238585TGAAGAGAGAAAAA+3.3
eor-1MA0543.1chrIII:10238602-10238616CTCTCTATTTTCCA-3.44
eor-1MA0543.1chrIII:10238583-10238597AAGAGAGAAGGAAT+3.49
eor-1MA0543.1chrIII:10238581-10238595AAAAGAGAGAAGGA+3.64
eor-1MA0543.1chrIII:10238579-10238593GAAAAAGAGAGAAG+3.72
eor-1MA0543.1chrIII:10237562-10237576CTGTCCCTCTTTTT-3.92
eor-1MA0543.1chrIII:10238509-10238523CTCCCCGCCTCTAC-4.28
eor-1MA0543.1chrIII:10238573-10238587AAGAGAGAAAAAGA+5.09
eor-1MA0543.1chrIII:10238577-10238591GAGAAAAAGAGAGA+5.43
eor-1MA0543.1chrIII:10238575-10238589GAGAGAAAAAGAGA+6.38
fkh-2MA0920.1chrIII:10238061-10238068TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:10238691-10238698TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10238893-10238900TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10238340-10238347TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:10237583-10237590TATTTAC-3.21
fkh-2MA0920.1chrIII:10237848-10237855TTTTTAC-3.26
fkh-2MA0920.1chrIII:10237666-10237673TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrIII:10238777-10238784TCAACAC+3.57
fkh-2MA0920.1chrIII:10237446-10237453TGTTGAT-3.66
fkh-2MA0920.1chrIII:10238401-10238408TAAACAC+3.95
lim-4MA0923.1chrIII:10237449-10237457TGATTAAG-3.05
lim-4MA0923.1chrIII:10237738-10237746TTCATTAA+3.18
lim-4MA0923.1chrIII:10237978-10237986ACAATTAG+3.22
lin-14MA0261.1chrIII:10237821-10237826TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIII:10238501-10238506AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrIII:10238394-10238399TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrIII:10238055-10238062TAATGAT-3.26
pha-4MA0546.1chrIII:10237724-10237733TTTTGCATA-3.03
pha-4MA0546.1chrIII:10237447-10237456GTTGATTAA-3.26
pha-4MA0546.1chrIII:10237517-10237526GTTGGTATT-3.57
pha-4MA0546.1chrIII:10238774-10238783GTATCAACA+3.61
pha-4MA0546.1chrIII:10237584-10237593ATTTACACT-4.55
skn-1MA0547.1chrIII:10237443-10237457AATTGTTGATTAAG+3.96
skn-1MA0547.1chrIII:10238852-10238866ATTTTCTTGATTTT-4.28
skn-1MA0547.1chrIII:10238413-10238427AAAGTCATCATTCA-4.59
skn-1MA0547.1chrIII:10238437-10238451ATTCTCATCATTTT-6.8
sma-4MA0925.1chrIII:10237773-10237783CTTTCTGGTT+3.27
unc-62MA0918.1chrIII:10237367-10237378GTTGACATTTT-3.35
unc-62MA0918.1chrIII:10237560-10237571ACCTGTCCCTC+3.53
unc-62MA0918.1chrIII:10238874-10238885AACTGTCAAGA+3.61
unc-86MA0926.1chrIII:10237922-10237929TTAATAT-3.47
vab-7MA0927.1chrIII:10238786-10238793TCATTAT-3.35
vab-7MA0927.1chrIII:10238055-10238062TAATGAT-3.43
zfh-2MA0928.1chrIII:10237978-10237988ACAATTAGTG-3.03
zfh-2MA0928.1chrIII:10237918-10237928AAAATTAATA-3.08
zfh-2MA0928.1chrIII:10237743-10237753TAAATTAAAG-3.11
zfh-2MA0928.1chrIII:10238659-10238669TTTAATTCAG+3.15
Enhancer Sequence
CATATTGAAA ATTTGTTAGT TGACATTTTG GTTTTAAAAA ATTATGCACG AATTTGAAGT 60
TTGAAGCTAT GTCAAGTGGC AAAACAAATT TAAAAATTGT TGATTAAGAA ATAATCAAGA 120
CATCGGAAAA GTCGGCAACT AGCAGCTTTT GACATAATCA GCCAACTTGT TGGTATTGCT 180
GAAATTTCCA AATTTTCCAA AATCGCCGTT CACCTGTCCC TCTTTTTATT AGTTTATTTA 240
CACTTTTTTT CTGATTTTTC CCCGGCCCGC ACTCAATTTT TTAGAACTTA TTTCTAAAAA 300
AGACATACCA AGGATCGTAA AAAACCAACG CCTATTGTAT AAATCACGCC TTGAGGCAGT 360
CTCTTTTGTC CCAATTTTTG CATAAAAAGT TCATTAAATT AAAGTTAAAA TTCAACTTTC 420
AAATCTTTCT GGTTTTATTT TGACAAAAAA GAACAAAAAA AGACGGAATA CCTGTTCCTA 480
ACGCGTGTTA ACTTCCCGGT TTTTACAAAT CATATCAGTG TTTTAACAGG GAATATATGT 540
AGGTTAAAGA CTGTATTCCG CATTTTTTAA AAATTAATAT CTATTGTATG TACTTCTATT 600
CTTTAGGTAA ACTTTTCCAT TTGTTGTACA CAATTAGTGG GGCGTGGTTT TTAAATTGAT 660
CTAGTAGAAT TTTATCGATT TTGTACTTTT GATTTTAAGA GCAATTTAAT GATGTTTTCA 720
AAAGATAACA ATAATACTTT AGGTTTTATG TATCAGGCGG CATAAAATTA GGCCTAAATC 780
TACTCATCTG GAAAAAAAAT GTTTGGAGGA AAATTAAAGT TTTCTGAGAA AAATTTCGCC 840
GGAAGTTCAA TTTTTTTGAC AAAGAAATTT TGCAGGAAAT TCCAACTTTC TGATTGTGAG 900
TAAAATTTTC TGATTGTGAG CAAATTTTCG GAGGGGAGTT CAAACTTTCT AAGAAAATTT 960
TTCTGCGGAA AATTCAAATT TTCTAAAAAA TTGTTTTTTT CAAACTTACT ACGTTATAGT 1020
CAAAAAAAGT CATAAGAACT TTAAGTGTTC CATAAACACT TTAAAAAGTC ATCATTCAAT 1080
TCTCCCAAAT TCTCATCATT TTAACAAGCC ATGAATCTTC GAAATACCTT CGTTTTTTTC 1140
TCGACTTACG GGAACATTCT CTCCCCGCCT CTACTGCCAC TCAACTTGTG ATAACTTTTT 1200
GTCATTTTCA CTTTTTTGTT AGTGAAGAGA GAAAAAGAGA GAAGGAATTG CATCTCTCTA 1260
TTTTCCATAT ACGATACTTC ACCCAACAAA CAATCACAGT CTATAGACTT TTTAATTCAG 1320
AATTTTAATT TTTTTTGGTG CATTTTTATA GTGGTATTAA CGTTCATATG ACCATTGTTT 1380
TGTCATTTTG GAATCTGATT TAGTTTTTTG TATTTTTTGC GATAAGTATC AACACCTTCA 1440
TTATTTTTCC AAAAATCTTA AGTTTCTGAA AACTGAAAAA AAAACACTTT TTTTCAAGTT 1500
TTAATTTTCT TGATTTTGTA TTGTTAACTG TCAAGAATTT TTTTTGTTGA AAAAATA 1557