EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-05317 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrIII:8601154-8602400 
TF binding sites/motifs
Number: 74             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:8601778-8601788AGGTTGAAAC+3.06
blmp-1MA0537.1chrIII:8602283-8602293GGATGGAAGA+3.06
blmp-1MA0537.1chrIII:8601303-8601313GAAAAGATAC+3.07
blmp-1MA0537.1chrIII:8602279-8602289GAAGGGATGG+3.17
blmp-1MA0537.1chrIII:8602116-8602126TCTCGACTTC-3.43
blmp-1MA0537.1chrIII:8602260-8602270AGGAAGAGAA+3.44
blmp-1MA0537.1chrIII:8601617-8601627AAAGAGATAT+3.59
blmp-1MA0537.1chrIII:8602343-8602353AAAACGATAA+3.71
blmp-1MA0537.1chrIII:8601615-8601625AAAAAGAGAT+3.84
blmp-1MA0537.1chrIII:8602274-8602284AAAAAGAAGG+4.04
blmp-1MA0537.1chrIII:8602262-8602272GAAGAGAAAA+4.41
blmp-1MA0537.1chrIII:8602268-8602278AAAAAGAAAA+4.91
blmp-1MA0537.1chrIII:8601717-8601727AAAATGAAAA+5.14
ceh-22MA0264.1chrIII:8601397-8601407ACACTTAAAA+3.74
ceh-48MA0921.1chrIII:8601312-8601320CTCAATAA+3.24
ceh-48MA0921.1chrIII:8601430-8601438TTCAATAC+3.27
ces-2MA0922.1chrIII:8601630-8601638TTGCGCAA+3.07
ces-2MA0922.1chrIII:8602294-8602302TTGCGCAA+3.07
ces-2MA0922.1chrIII:8602248-8602256TTATGTAT+3.34
ces-2MA0922.1chrIII:8602249-8602257TATGTATT-3.43
che-1MA0260.1chrIII:8601936-8601941AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIII:8601501-8601506AAGCG+3.2
dpy-27MA0540.1chrIII:8602385-8602400TTTCCTTCGGGAAGA+4.18
efl-1MA0541.1chrIII:8601628-8601642AATTGCGCAAAAGT+3.36
elt-3MA0542.1chrIII:8601692-8601699GCTAAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrIII:8601419-8601426CATATCA+3.58
elt-3MA0542.1chrIII:8601754-8601761GATTAGA-3.58
elt-3MA0542.1chrIII:8601612-8601619GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:8601722-8601729GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:8602044-8602051GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:8602077-8602084GATAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIII:8601612-8601626GAAAAAAAGAGATA+3.29
eor-1MA0543.1chrIII:8602257-8602271AGAAGGAAGAGAAA+3.32
eor-1MA0543.1chrIII:8601610-8601624TTGAAAAAAAGAGA+3.52
eor-1MA0543.1chrIII:8602267-8602281GAAAAAGAAAAAGA+3.5
eor-1MA0543.1chrIII:8602150-8602164GAGAGGCGTCGAAA+3.74
eor-1MA0543.1chrIII:8602265-8602279GAGAAAAAGAAAAA+3.85
eor-1MA0543.1chrIII:8602261-8602275GGAAGAGAAAAAGA+3.8
eor-1MA0543.1chrIII:8602269-8602283AAAAGAAAAAGAAG+4.08
eor-1MA0543.1chrIII:8602263-8602277AAGAGAAAAAGAAA+5.59
fkh-2MA0920.1chrIII:8602006-8602013TGTAGAC-3.02
fkh-2MA0920.1chrIII:8602079-8602086TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:8601791-8601798TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:8601728-8601735AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:8601982-8601989TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrIII:8602239-8602246TAAACAT+3.81
fkh-2MA0920.1chrIII:8601913-8601920TGTTTAC-4.05
hlh-1MA0545.1chrIII:8602100-8602110ATCAAATGAC+3.09
lim-4MA0923.1chrIII:8601156-8601164TAATTGTA-3.14
lim-4MA0923.1chrIII:8601753-8601761TGATTAGA-3.21
lin-14MA0261.1chrIII:8601808-8601813AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrIII:8601866-8601871TGTTC-3.14
pal-1MA0924.1chrIII:8601156-8601163TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrIII:8601943-8601950TAGTAAA+3
pal-1MA0924.1chrIII:8601192-8601199TAATAAA+4.57
pha-4MA0546.1chrIII:8601280-8601289GTGAAAATA+3.11
pha-4MA0546.1chrIII:8601881-8601890GTGAAAATA+3.11
pha-4MA0546.1chrIII:8601983-8601992TTTTACATT-3.2
pha-4MA0546.1chrIII:8602379-8602388GTCTACTTT-3.2
pha-4MA0546.1chrIII:8602236-8602245AAATAAACA+3.87
pha-4MA0546.1chrIII:8601914-8601923GTTTACCCT-4.29
skn-1MA0547.1chrIII:8601316-8601330ATAAGTTGAAAATG+3.68
skn-1MA0547.1chrIII:8602258-8602272GAAGGAAGAGAAAA+3.9
sma-4MA0925.1chrIII:8602006-8602016TGTAGACACC-3.04
sma-4MA0925.1chrIII:8601271-8601281GATAGACAAG-3.13
sma-4MA0925.1chrIII:8601540-8601550TTCAGACAGT-3.36
unc-62MA0918.1chrIII:8601272-8601283ATAGACAAGTG-3.06
unc-62MA0918.1chrIII:8601351-8601362TCATGTCAGCA+3.17
unc-62MA0918.1chrIII:8602331-8602342AACTGTCTCCG+3.51
unc-86MA0926.1chrIII:8601207-8601214TGCATTT-3.11
vab-7MA0927.1chrIII:8601753-8601760TGATTAG-3.13
vab-7MA0927.1chrIII:8601156-8601163TAATTGT-3.22
zfh-2MA0928.1chrIII:8601874-8601884TGAATTAGTG-3.13
zfh-2MA0928.1chrIII:8601154-8601164GTTAATTGTA+3.18
Enhancer Sequence
GTTAATTGTA GGGTTCTTAT TTCTACAAGT ATTGCGCGTA ATAAATTGAT GAATGCATTT 60
CAATTGAAAA GTAAGTGGGT CATCTCAGAA GTGAGCAGCT ATATAGTGGT AAATTGAGAT 120
AGACAAGTGA AAATAGATTT CAAACCTGGG AAAAGATACT CAATAAGTTG AAAATGTCTC 180
CACAATTTTC ACATAAATCA TGTCAGCATG CCTGCCTCTA CTCACCTACC GCCTCCTCTT 240
CTAACACTTA AAAGCTCACC AAGTTCATAT CACAGATTCA ATACAGGCTA ATCGCACACG 300
GGGCAGGCGG AAGAGATTGG TAGGAGGCAA GAGAAAAGGC GGATGAGAAG CGCTCCTTCA 360
CGACTCAACT AGGTTGAACT CTAGATTTCA GACAGTATTC TCAGTATAGG ACGACAAAAT 420
TAGTAACCAA GCAGCCCTAT CGTGTAACCA TCACATTTGA AAAAAAGAGA TATAAATTGC 480
GCAAAAGTCG GCCTCAAAAC TCAAGGAAAA TCACAAAAAT CTTTCCAATT CGGAAGATGC 540
TAAGAAGGCA ACGGACTTTT GGAAAAATGA AAAAAAAACA ATTCGACTTT TTTGAACTTT 600
GATTAGATAT TGCTGGTATA GTTGAGGTTG AAACTTATAA ATAAACTGGT ATAGAACATT 660
TTCAGCTTTC ACTAATAAAA GCTCAGTTTC AGTAGTTATA GAGAAAAAAT AATGTTCTGT 720
TGAATTAGTG AAAATATAAG ATTAGCTTTC TAAAACCTAT GTTTACCCTA TTCAGTCATA 780
TGAAACGGGT AGTAAATTAT AAGTTTACAG ATTGACGTAA AGAAACTTTT TTTACATTTT 840
GAACTGTACT TTTGTAGACA CCTTCAAATG TAAAGTCTCT GTGGCAAGTT GAAAAAATGA 900
ACTTTGGCAG GAATAAGCTT GAAGATAAAA ATCTCAGTAT GAAGTCATCA AATGACGTGA 960
TTTCTCGACT TCTTATTTCT CCGGATCGTC CGTCCGGAGA GGCGTCGAAA TGCGGAAATG 1020
GGGCCAGCGG AGGTCGGGAA GCAGTGCGCG CAATCGTAGC CATCCAAATA GCCGATCGTT 1080
GAAAATAAAC ATTATTATGT ATTAGAAGGA AGAGAAAAAG AAAAAGAAGG GATGGAAGAA 1140
TTGCGCAACT CTCGATTTAA CCTAGTTGAA TCCTAAGAAC TGTCTCCGAA AAACGATAAC 1200
GGCATCCTGC CCGGGCTTTT TGTATGTCTA CTTTCCTTCG GGAAGA 1246