EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-04989 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrIII:6268215-6268591 
TF binding sites/motifs
Number: 41             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:6268470-6268480AGAATGAAGC+3.21
blmp-1MA0537.1chrIII:6268261-6268271AAATTGATAT+3.28
blmp-1MA0537.1chrIII:6268497-6268507GAATTGATAG+3.37
blmp-1MA0537.1chrIII:6268424-6268434AGAAAGAGAG+4.09
blmp-1MA0537.1chrIII:6268338-6268348AGAGAGAAAA+4.62
blmp-1MA0537.1chrIII:6268348-6268358AAAAAGAAAA+4.98
ceh-22MA0264.1chrIII:6268565-6268575GTGAATTGGT-3.46
ceh-48MA0921.1chrIII:6268304-6268312ATCAATAA+3.44
ces-2MA0922.1chrIII:6268557-6268565TAGATAAT-3.42
che-1MA0260.1chrIII:6268379-6268384AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIII:6268218-6268223AAACC+3.36
daf-12MA0538.1chrIII:6268382-6268396CGAGTGAGTGTGTA+3.01
daf-12MA0538.1chrIII:6268384-6268398AGTGAGTGTGTACA+3.36
daf-12MA0538.1chrIII:6268386-6268400TGAGTGTGTACATG+3.6
dsc-1MA0919.1chrIII:6268401-6268410CTAATTGAT+3.45
dsc-1MA0919.1chrIII:6268401-6268410CTAATTGAT-3.45
elt-3MA0542.1chrIII:6268295-6268302CTTGTCA+3.45
elt-3MA0542.1chrIII:6268266-6268273GATATGA-3.58
eor-1MA0543.1chrIII:6268346-6268360AAAAAAAGAAAACA+3.31
eor-1MA0543.1chrIII:6268449-6268463TTCTGAATATCTTG-3.3
eor-1MA0543.1chrIII:6268335-6268349TTGAGAGAGAAAAA+3.59
eor-1MA0543.1chrIII:6268343-6268357GAAAAAAAAAGAAA+3.82
eor-1MA0543.1chrIII:6268341-6268355GAGAAAAAAAAAGA+4.06
eor-1MA0543.1chrIII:6268421-6268435CGGAGAAAGAGAGC+4.12
eor-1MA0543.1chrIII:6268337-6268351GAGAGAGAAAAAAA+4.35
eor-1MA0543.1chrIII:6268339-6268353GAGAGAAAAAAAAA+4.46
fkh-2MA0920.1chrIII:6268354-6268361AAAACAC+3.08
fkh-2MA0920.1chrIII:6268325-6268332AAAACAA+3.09
hlh-1MA0545.1chrIII:6268327-6268337AACAAGTGTT+3.43
hlh-1MA0545.1chrIII:6268432-6268442AGCAGGTGTG+3.44
hlh-1MA0545.1chrIII:6268328-6268338ACAAGTGTTG-3.68
lim-4MA0923.1chrIII:6268519-6268527TAATGGGA-3.04
lim-4MA0923.1chrIII:6268233-6268241TAATGAAG-3.09
lim-4MA0923.1chrIII:6268402-6268410TAATTGAT-3.39
pha-4MA0546.1chrIII:6268351-6268360AAGAAAACA+3.27
pha-4MA0546.1chrIII:6268302-6268311GTATCAATA+3.51
unc-62MA0918.1chrIII:6268294-6268305TCTTGTCAGTA+3.08
unc-86MA0926.1chrIII:6268398-6268405TGCCTAA-3.78
vab-7MA0927.1chrIII:6268519-6268526TAATGGG-3.16
vab-7MA0927.1chrIII:6268402-6268409TAATTGA+3.6
zfh-2MA0928.1chrIII:6268400-6268410CCTAATTGAT+3.08
Enhancer Sequence
TTGAAACCAC CACAAGTTTA ATGAAGCTTC GTCGGAAAAC TAATCGAAAT TGATATGAAA 60
ATCAGAAGCA TACACTTCTT CTTGTCAGTA TCAATAACAA TTATAACTCA AAAACAAGTG 120
TTGAGAGAGA AAAAAAAAGA AAACACACGG GAGAGCTCAG AGAGAAACGA GTGAGTGTGT 180
ACATGCCTAA TTGATAGTTG CTCGAGCGGA GAAAGAGAGC AGGTGTGAGC TCCTTTCTGA 240
ATATCTTGTA TTAAGAGAAT GAAGCTCATT TACCAAATGA GGGAATTGAT AGCTTACAAG 300
ATTTTAATGG GATGTAGTGA GTGGAGGACG GAGTGAGTTG GTTAGATAAT GTGAATTGGT 360
TGTCCTGGCT ACCGAA 376