EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-04813 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrIII:5086873-5087755 
TF binding sites/motifs
Number: 60             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:5087709-5087719ACTCATTTTC-3.08
blmp-1MA0537.1chrIII:5087109-5087119CTTCAATTTC-3.34
blmp-1MA0537.1chrIII:5087186-5087196GAATTGAAGA+3.45
blmp-1MA0537.1chrIII:5087294-5087304ATTCAATTTT-3.46
blmp-1MA0537.1chrIII:5087222-5087232AGAAAGAAAT+3.54
blmp-1MA0537.1chrIII:5087202-5087212GGAGTGAAAA+3.98
blmp-1MA0537.1chrIII:5087715-5087725TTTCCTTCTT-4.1
blmp-1MA0537.1chrIII:5087174-5087184AAATGGAGAA+4.26
blmp-1MA0537.1chrIII:5087663-5087673AAATGGAAAA+4.47
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:5087279-5087292TTATGAAGCTAAT-4.05
ces-2MA0922.1chrIII:5087541-5087549TGAGTAAT-3.17
che-1MA0260.1chrIII:5087500-5087505AAACC+3.36
daf-12MA0538.1chrIII:5086881-5086895AAGCACAAACATAT-3.03
dsc-1MA0919.1chrIII:5087287-5087296CTAATTTAT+3.19
dsc-1MA0919.1chrIII:5087287-5087296CTAATTTAT-3.19
dsc-1MA0919.1chrIII:5087359-5087368GTAATTATG+3.26
dsc-1MA0919.1chrIII:5087359-5087368GTAATTATG-3.26
elt-3MA0542.1chrIII:5087089-5087096TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:5087616-5087623GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIII:5087383-5087390GATAACT-3.2
elt-3MA0542.1chrIII:5087687-5087694GAAAAGA-3.31
eor-1MA0543.1chrIII:5087070-5087084CTTTTCCTCTGTGC-3.03
eor-1MA0543.1chrIII:5087158-5087172AACAGACAAAAACA+3.06
eor-1MA0543.1chrIII:5087171-5087185ATGAAATGGAGAAA+3.44
eor-1MA0543.1chrIII:5087184-5087198AAGAATTGAAGAGA+3.46
eor-1MA0543.1chrIII:5087068-5087082CTCTTTTCCTCTGT-3.54
eor-1MA0543.1chrIII:5087722-5087736CTTTTGGTCTCACA-3.5
eor-1MA0543.1chrIII:5087192-5087206AAGAGAAATAGGAG+3.67
eor-1MA0543.1chrIII:5087219-5087233GAGAGAAAGAAATG+3.67
eor-1MA0543.1chrIII:5087553-5087567AAGATAAGCAAAGA+3.86
eor-1MA0543.1chrIII:5087217-5087231TGGAGAGAAAGAAA+4.39
fkh-2MA0920.1chrIII:5087254-5087261TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:5087250-5087257TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrIII:5087233-5087243AGCAATTGAT+3.69
lim-4MA0923.1chrIII:5087287-5087295CTAATTTA+3.04
lim-4MA0923.1chrIII:5087359-5087367GTAATTAT+3.55
pal-1MA0924.1chrIII:5086873-5086880TTATTGT-3.24
pal-1MA0924.1chrIII:5087360-5087367TAATTAT-3.33
pal-1MA0924.1chrIII:5087612-5087619TTATGAC-3.79
pha-4MA0546.1chrIII:5087558-5087567AAGCAAAGA+3.11
pha-4MA0546.1chrIII:5087366-5087375TGGCAAATA+3.39
pha-4MA0546.1chrIII:5087255-5087264ATTTATATA-3.64
pha-4MA0546.1chrIII:5087251-5087260GTTTATTTA-3.79
skn-1MA0547.1chrIII:5087187-5087201AATTGAAGAGAAAT+4.19
sma-4MA0925.1chrIII:5087455-5087465GTTAGACATT-3.08
sma-4MA0925.1chrIII:5087158-5087168AACAGACAAA-3.28
unc-86MA0926.1chrIII:5087129-5087136CATGCAT+3.18
unc-86MA0926.1chrIII:5087131-5087138TGCATGT-3.18
unc-86MA0926.1chrIII:5087415-5087422TATGAAT+3.58
unc-86MA0926.1chrIII:5087748-5087755TGAATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrIII:5087268-5087275TATTCAT+3.68
unc-86MA0926.1chrIII:5087270-5087277TTCATAT-3.87
unc-86MA0926.1chrIII:5087417-5087424TGAATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrIII:5087360-5087367TAATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrIII:5087360-5087367TAATTAT-3.6
vab-7MA0927.1chrIII:5087389-5087396TAATGGA+3
zfh-2MA0928.1chrIII:5087320-5087330TTTAATTTAC+3.11
zfh-2MA0928.1chrIII:5087286-5087296GCTAATTTAT+3.1
zfh-2MA0928.1chrIII:5087359-5087369GTAATTATGG-3.31
zfh-2MA0928.1chrIII:5087358-5087368GGTAATTATG+3.37
Enhancer Sequence
TTATTGTTAA GCACAAACAT ATATATGCGC TTTCTGAAAA TTCAGCAATA ATGATTCAAT 60
TCAACAGAAA AGTTGTTTTG AATAGTTGAA GAAATGCAGC TTAACCTAAT AAAACACGGA 120
AACAAAACGG AAAGCTGGTG GGTGGGAAAC AAAAAAGGTG CCACGATTTA TAGTGCCCCG 180
AATATTTTAT GAGTGCTCTT TTCCTCTGTG CTCTTTTTTC TCAGTTGAAC AAGTCACTTC 240
AATTTCAACG ACTGCACATG CATGTTTCCG AGGAGTTCCA TGTAAAACAG ACAAAAACAT 300
GAAATGGAGA AAAGAATTGA AGAGAAATAG GAGTGAAAAG GTGTTGGAGA GAAAGAAATG 360
AGCAATTGAT TTAAGCTTGT TTATTTATAT ATGAGTATTC ATATACTTAT GAAGCTAATT 420
TATTCAATTT TTAGTGTTTT AGAGCAATTT AATTTACTGA CGTGCCAAGA ATTTGGAACT 480
TTCTTGGTAA TTATGGCAAA TAGAATGCTT GATAACTAAT GGAAACTTAC TAGGTCTGAT 540
ATTATGAATA TATTTAGGTT TAGGATTAGG CTTAGGTAAA GGGTTAGACA TTAGCCTAGG 600
CTCAGGTTTT GGCACAGAGT CAAGCTGAAA CCTATTGTTT TAGCTTTGTT CCTTAGTTTT 660
GAGTTTGTTG AGTAATCGCC AAGATAAGCA AAGACCAAAA TCTGTATCGT GAGAGCTTGA 720
GCTCGATGAT TCTAAAATTT TATGACAAAA CACTTTCATA AAGTTCTGGT TTTACGGAAC 780
GAAATCTGTA AAATGGAAAA TATCTCAGAA AACTGAAAAG ATCTGAGTTC CACAAGACTC 840
ATTTTCCTTC TTTTGGTCTC ACATACCTCA TTTCATGAAT AA 882