EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-04624 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrIII:3603146-3603950 
TF binding sites/motifs
Number: 51             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:3603770-3603780TATCGATTTT-3.12
blmp-1MA0537.1chrIII:3603655-3603665AGAAAGAATA+3.21
blmp-1MA0537.1chrIII:3603467-3603477TCTCACCCTT-3.69
blmp-1MA0537.1chrIII:3603641-3603651AGAGAGAAAT+3.76
blmp-1MA0537.1chrIII:3603506-3603516AGAGTGAGGG+3.83
blmp-1MA0537.1chrIII:3603647-3603657AAATGGAGAG+4.23
ceh-22MA0264.1chrIII:3603489-3603499ACACTTGTCA+3.47
ceh-48MA0921.1chrIII:3603867-3603875TATTGAAT-3.49
ceh-48MA0921.1chrIII:3603558-3603566TTCGATAC+3.69
ceh-48MA0921.1chrIII:3603770-3603778TATCGATT-4.57
ceh-48MA0921.1chrIII:3603929-3603937ACCAATAA+4
ces-2MA0922.1chrIII:3603551-3603559TGCGTAAT-3.14
ces-2MA0922.1chrIII:3603839-3603847TTTATAAT-3.18
che-1MA0260.1chrIII:3603743-3603748GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrIII:3603303-3603308AAACC+3.36
efl-1MA0541.1chrIII:3603573-3603587AACTTGCGCCCCCT-3.35
efl-1MA0541.1chrIII:3603520-3603534ACTTTCCGCGTGCC-3.59
efl-1MA0541.1chrIII:3603603-3603617TGTTGGCGCGGCGG-3.68
elt-3MA0542.1chrIII:3603465-3603472TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:3603785-3603792GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrIII:3603673-3603680GATACGA-3.45
elt-3MA0542.1chrIII:3603282-3603289GTTATCA+3.89
eor-1MA0543.1chrIII:3603652-3603666GAGAGAAAGAATAA+3.18
eor-1MA0543.1chrIII:3603895-3603909GTTTGCATATCTTT-3.52
eor-1MA0543.1chrIII:3603650-3603664TGGAGAGAAAGAAT+3.77
eor-1MA0543.1chrIII:3603642-3603656GAGAGAAATGGAGA+4.3
eor-1MA0543.1chrIII:3603644-3603658GAGAAATGGAGAGA+5.18
fkh-2MA0920.1chrIII:3603837-3603844TTTTTAT-3.3
hlh-1MA0545.1chrIII:3603713-3603723ACCACCTGCC+3.54
hlh-1MA0545.1chrIII:3603488-3603498AACACTTGTC+4.02
lim-4MA0923.1chrIII:3603843-3603851TAATTATC-3.08
lim-4MA0923.1chrIII:3603482-3603490TAATTGAA-3.3
lin-14MA0261.1chrIII:3603488-3603493AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrIII:3603728-3603735TTATTGC-3.69
pal-1MA0924.1chrIII:3603294-3603301TTCTTAC-3
pha-4MA0546.1chrIII:3603349-3603358GTTAACTTT-3.23
pha-4MA0546.1chrIII:3603895-3603904GTTTGCATA-4.49
skn-1MA0547.1chrIII:3603492-3603506CTTGTCATGATTCA-4.03
skn-1MA0547.1chrIII:3603845-3603859ATTATCATGTTTTG-4.44
sma-4MA0925.1chrIII:3603298-3603308TACAGAAACC-3.07
unc-62MA0918.1chrIII:3603696-3603707GTTGACAGTAT-3.02
unc-62MA0918.1chrIII:3603491-3603502ACTTGTCATGA+3.81
unc-62MA0918.1chrIII:3603333-3603344CCCTGTCATGT+3.85
unc-62MA0918.1chrIII:3603355-3603366TTTGACAGCTT-4.28
unc-86MA0926.1chrIII:3603898-3603905TGCATAT-3.11
vab-7MA0927.1chrIII:3603843-3603850TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrIII:3603843-3603850TAATTAT-3.29
zfh-2MA0928.1chrIII:3603480-3603490TTTAATTGAA+3.11
zfh-2MA0928.1chrIII:3603841-3603851TATAATTATC+3.14
zfh-2MA0928.1chrIII:3603553-3603563CGTAATTCGA+3.1
zfh-2MA0928.1chrIII:3603842-3603852ATAATTATCA-3.29
Enhancer Sequence
GGGGCGGGGA GCCTCAGCCA AAGCCAAAGC ATAGGCCTAA GCCTAAGCTT AAGCCTGAGC 60
CTAATCTAGA TTTAGTTTAC GTTCAAAGTT TCTAAAGATC AAAAATCTTT TCCGGTTGAG 120
TTCTGAACCA GTAAACGTTA TCAGATATTT CTTACAGAAA CCTGATACTT GTTTCCAAGA 180
GATTTTTCCC TGTCATGTGT CATGTTAACT TTGACAGCTT CTCAATAATG TTTTGATATT 240
TTACAAGATT TTTCACTATA CAATTTTTTG ATAGCGTTTT TCACAAGAAT CAGTGTTGAA 300
AATATTCACA CCTGAATCTT TTCTCACCCT TCCTTTTAAT TGAACACTTG TCATGATTCA 360
AGAGTGAGGG GCTCACTTTC CGCGTGCCGC CGCCGTGTGG CTCAATGCGT AATTCGATAC 420
TCTCGAGAAC TTGCGCCCCC TTTAGAGACC GGTTACCTGT TGGCGCGGCG GCACAAAGAG 480
CAATGGAGCT ATTTGAGAGA GAAATGGAGA GAAAGAATAA AAGTTTTGAT ACGAGCCATT 540
CCTGCTGAGA GTTGACAGTA TTGAGCCACC ACCTGCCTTG GGTTATTGCT CTCCCACGTT 600
TCCCATTTAT TTGGTTTTTG AAGATATCGA TTTTGCTTTG ATTAAAAAAA GGTTTTGATC 660
TAACTTTTAG AGAATTTCTT GAATTTGAAG TTTTTTATAA TTATCATGTT TTGAACGGGT 720
TTATTGAATC TAGAGTTGTT CAATTTTTTG TTTGCATATC TTTAAGCCGT AATAGTTTAA 780
CTAACCAATA AATTTCACTA AAAT 804