EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-03943 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrII:13789350-13790084 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:13789606-13789616TATCTTCTCC-3.02
blmp-1MA0537.1chrII:13789920-13789930CTTCCTCCTC-3.06
blmp-1MA0537.1chrII:13789917-13789927CTTCTTCCTC-3.13
blmp-1MA0537.1chrII:13789562-13789572AAAACGAGGC+3.22
blmp-1MA0537.1chrII:13789911-13789921CTTCTTCTTC-3.39
blmp-1MA0537.1chrII:13789914-13789924CTTCTTCTTC-3.39
blmp-1MA0537.1chrII:13789571-13789581CTTCACTTTT-3.74
blmp-1MA0537.1chrII:13790038-13790048TCTCAATTTC-4.58
blmp-1MA0537.1chrII:13790017-13790027TTTCAATTTT-4.82
blmp-1MA0537.1chrII:13790024-13790034TTTCTTTTTC-4.91
ceh-48MA0921.1chrII:13789477-13789485ATCGATGC+3.05
ceh-48MA0921.1chrII:13789653-13789661ATCGATGC+3.05
ces-2MA0922.1chrII:13789978-13789986TTACACAC+3.15
ces-2MA0922.1chrII:13789489-13789497TGACATAA+3.55
che-1MA0260.1chrII:13789570-13789575GCTTC-3.7
che-1MA0260.1chrII:13789687-13789692GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrII:13789615-13789629CCGCACCCTCCCTC-3.23
daf-12MA0538.1chrII:13789982-13789996ACACACGTACACAT-3.41
daf-12MA0538.1chrII:13789980-13789994ACACACACGTACAC-3.59
daf-12MA0538.1chrII:13789978-13789992TTACACACACGTAC-4.85
dpy-27MA0540.1chrII:13789779-13789794CCCCCTGCACAATAA+3.49
dpy-27MA0540.1chrII:13789865-13789880ACACCTGCGCGATGG+4.02
efl-1MA0541.1chrII:13789610-13789624TTCTCCCGCACCCT-3.39
elt-3MA0542.1chrII:13789811-13789818GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrII:13790015-13790022CTTTTCA+3.31
elt-3MA0542.1chrII:13789931-13789938CCTATCA+3.35
eor-1MA0543.1chrII:13789953-13789967TTCTTGCTCTCACA-3.75
eor-1MA0543.1chrII:13789912-13789926TTCTTCTTCTTCCT-3.91
fkh-2MA0920.1chrII:13789414-13789421TATACAG+3.15
fkh-2MA0920.1chrII:13790052-13790059TTTTTAC-3.19
hlh-1MA0545.1chrII:13789437-13789447AGCAGCCGAC+3.18
hlh-1MA0545.1chrII:13789551-13789561AGCAACCGAC+3.23
hlh-1MA0545.1chrII:13789757-13789767TCAGGTGCTA-3.23
hlh-1MA0545.1chrII:13789865-13789875ACACCTGCGC-3.45
hlh-1MA0545.1chrII:13789585-13789595TCAGGTGTTA-3.46
hlh-1MA0545.1chrII:13789723-13789733AACAGCCGAC+3.88
lim-4MA0923.1chrII:13789970-13789978TGATTGGA-3.01
lin-14MA0261.1chrII:13790035-13790040TGTTC-3.14
pal-1MA0924.1chrII:13789851-13789858TAATGGC-3.28
pal-1MA0924.1chrII:13789788-13789795CAATAAA+3.46
pha-4MA0546.1chrII:13790053-13790062TTTTACTTA-3.15
pha-4MA0546.1chrII:13789718-13789727AAGCCAACA+4.25
skn-1MA0547.1chrII:13789906-13789920AAAATCTTCTTCTT-3.66
snpc-4MA0544.1chrII:13789724-13789735ACAGCCGACAA-5.04
snpc-4MA0544.1chrII:13789552-13789563GCAACCGACAA-5.27
snpc-4MA0544.1chrII:13789438-13789449GCAGCCGACAA-6.16
unc-62MA0918.1chrII:13789861-13789872ATTGACACCTG-3.22
unc-62MA0918.1chrII:13789662-13789673CCATGTCATTG+3.51
Enhancer Sequence
AGCTACAATT TAAGGGTGCT GCCAGATTAC TGTAGTTTCA GGAACTGGGG TAACTCGGTA 60
GGGGTATACA GGTAGAACTA GAAATATAGC AGCCGACAAA ATCAAGGCTG ACACCAAACC 120
CTTTCTGATC GATGCACCAT GACATAAGGG GGTTAGCGGT AGGATTCCTG TAGCAGAGAG 180
CTAAAGGAGC ACTATTTGGC CAGCAACCGA CAAAAACGAG GCTTCACTTT TAGTATCAGG 240
TGTTACTATG TACATCTATC TTCTCCCGCA CCCTCCCTCA AAACTGATAC CAAACCCATT 300
CTGATCGATG CACCATGTCA TTGTGAGATT TGCTCAGGCT TCTGTAGCAG AGCTATAGGA 360
GCAGTATAAA GCCAACAGCC GACAAAAACC AGGCTTAACT TCCAGTATCA GGTGCTACTC 420
TCAAAAAACC CCCCTGCACA ATAAATCACT GGAACCCCAT TGACAAAAAG AAACACTTCT 480
GCTGGCTCCC CTCCCCCGGT GTAATGGCAG GATTGACACC TGCGCGATGG GGTGGTGGTG 540
GTGGTGGACA ACATCAAAAA TCTTCTTCTT CTTCCTCCTC TCCTATCATC AAGCTTTTGC 600
TTTTTCTTGC TCTCACATCT TGATTGGATT ACACACACGT ACACATTGAA ATCCTTGTAC 660
CCCCTCTTTT CAATTTTCTT TTTCATGTTC TCAATTTCAA TATTTTTACT TATTTTTCAC 720
ACCCTACAAT CTAC 734