EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-03301 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrII:9311456-9312747 
TF binding sites/motifs
Number: 77             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:9311881-9311891GAGAAGAGGA+3.01
blmp-1MA0537.1chrII:9311560-9311570GAAATGATAC+3.11
blmp-1MA0537.1chrII:9312478-9312488CTTCTTCCTC-3.13
blmp-1MA0537.1chrII:9312467-9312477ATTCTTTCTT-3.23
blmp-1MA0537.1chrII:9312713-9312723AAATAGAGTG+3.32
blmp-1MA0537.1chrII:9312481-9312491CTTCCTCTTT-3.3
blmp-1MA0537.1chrII:9312528-9312538GAGAAGAAAA+3.41
blmp-1MA0537.1chrII:9311963-9311973GAGAAGAAAA+3.4
blmp-1MA0537.1chrII:9312471-9312481TTTCTTCCTT-3.51
blmp-1MA0537.1chrII:9312474-9312484CTTCCTTCTT-3.52
blmp-1MA0537.1chrII:9311817-9311827AGAGAGAAAT+3.79
blmp-1MA0537.1chrII:9312335-9312345AAAATGAAGA+4.11
blmp-1MA0537.1chrII:9311815-9311825GAAGAGAGAA+4.28
blmp-1MA0537.1chrII:9311726-9311736AAAGAGAAAC+4.39
blmp-1MA0537.1chrII:9312690-9312700AAAATGAGAA+4.88
ceh-22MA0264.1chrII:9312572-9312582GTGAAGAGCT-3.59
ceh-22MA0264.1chrII:9311827-9311837TTCAAGAAGC-3.61
ceh-48MA0921.1chrII:9311510-9311518GTCGATTA+3
ces-2MA0922.1chrII:9311749-9311757TATAGAAT-3.19
ces-2MA0922.1chrII:9311748-9311756TTATAGAA+3.25
che-1MA0260.1chrII:9311732-9311737AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrII:9311833-9311838AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrII:9311638-9311643AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrII:9311471-9311476GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrII:9311760-9311774AAAGTAAGTGCATG+3.02
dsc-1MA0919.1chrII:9312383-9312392CTGATTAGC+3.16
dsc-1MA0919.1chrII:9312383-9312392CTGATTAGC-3.16
dsc-1MA0919.1chrII:9312455-9312464CTAATTAGA+4.01
dsc-1MA0919.1chrII:9312455-9312464CTAATTAGA-4.01
elt-3MA0542.1chrII:9311721-9311728GATAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrII:9312175-9312182GTTATCA+3.2
elt-3MA0542.1chrII:9312194-9312201GATAGGA-3.35
eor-1MA0543.1chrII:9311721-9311735GATAAAAAGAGAAA+3.18
eor-1MA0543.1chrII:9312531-9312545AAGAAAAATAGGAA+3.36
eor-1MA0543.1chrII:9311727-9311741AAGAGAAACGCAAA+3.37
eor-1MA0543.1chrII:9312477-9312491CCTTCTTCCTCTTT-3.45
eor-1MA0543.1chrII:9312526-9312540AAGAGAAGAAAAAT+3.53
eor-1MA0543.1chrII:9311719-9311733CGGATAAAAAGAGA+3.5
eor-1MA0543.1chrII:9311729-9311743GAGAAACGCAAAAT+3.66
eor-1MA0543.1chrII:9312716-9312730TAGAGTGAGAGACG+3.77
eor-1MA0543.1chrII:9312714-9312728AATAGAGTGAGAGA+3.81
eor-1MA0543.1chrII:9312479-9312493TTCTTCCTCTTTAG-3.86
eor-1MA0543.1chrII:9312722-9312736GAGAGACGTAGAAT+4.46
eor-1MA0543.1chrII:9311916-9311930GAGAGAAATAGACG+4.53
fkh-2MA0920.1chrII:9312118-9312125TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrII:9312017-9312024TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrII:9311661-9311668TGTATAT-3.35
fkh-2MA0920.1chrII:9312496-9312503TCAACAA+3.76
fkh-2MA0920.1chrII:9311578-9311585TAAACAA+4.31
fkh-2MA0920.1chrII:9312634-9312641TAAACAA+4.31
fkh-2MA0920.1chrII:9311858-9311865TGTTTAT-4.31
lim-4MA0923.1chrII:9312384-9312392TGATTAGC-3.43
lim-4MA0923.1chrII:9312455-9312463CTAATTAG+3.93
lim-4MA0923.1chrII:9312456-9312464TAATTAGA-3.93
lin-14MA0261.1chrII:9311600-9311605TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrII:9311800-9311805TGTTC-3.62
lin-14MA0261.1chrII:9312740-9312745TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrII:9312292-9312299TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrII:9312050-9312057TACTAAA+3
pha-4MA0546.1chrII:9311490-9311499ATGTGAACA+3.04
pha-4MA0546.1chrII:9312709-9312718ATGAAAATA+3.1
pha-4MA0546.1chrII:9312631-9312640GGATAAACA+3.63
pha-4MA0546.1chrII:9311494-9311503GAACAAATA+3.66
pha-4MA0546.1chrII:9312556-9312565GAGCCAACA+4.13
skn-1MA0547.1chrII:9311739-9311753AAATGATTATTATA+3.02
skn-1MA0547.1chrII:9311537-9311551AAATGATTACAATA+3.13
skn-1MA0547.1chrII:9312544-9312558AAATGGTGATTTGA+3.64
skn-1MA0547.1chrII:9312336-9312350AAATGAAGAAAATT+5.42
sma-4MA0925.1chrII:9312679-9312689TTGTCTATTC+3.08
unc-62MA0918.1chrII:9312254-9312265AGTTGTCTTCA+3.3
unc-86MA0926.1chrII:9312605-9312612TATGAAT+3.68
unc-86MA0926.1chrII:9312027-9312034TAGGCAT+4.1
vab-7MA0927.1chrII:9312456-9312463TAATTAG+3.51
vab-7MA0927.1chrII:9312456-9312463TAATTAG-3.51
zfh-2MA0928.1chrII:9311653-9311663GCTAATTTTG+3.01
zfh-2MA0928.1chrII:9312455-9312465CTAATTAGAA-4.04
zfh-2MA0928.1chrII:9312454-9312464TCTAATTAGA+4.13
Enhancer Sequence
TAAATTCATG GGCAGGTTTC CAAACCTTTC GACTATGTGA ACAAATATTT TCAGGTCGAT 60
TAAAAAACTT TCAGAACGTG TAAATGATTA CAATAATTTT ATTAGAAATG ATACGGTAGA 120
TATAAACAAA TTGGCCAAAA TGTATGTTCC TAAAACATGT GTGATCTGCA GTAGATATTT 180
CGAAACCTTC AGCATGAGCT AATTTTGTAT ATGTTTCTCA AAATCCTAGA TACACTGGAG 240
CATTCATCCC TGAGAGCGTA AATCGGATAA AAAGAGAAAC GCAAAATGAT TATTATAGAA 300
TTTGAAAGTA AGTGCATGCT CCTGCTCGTG CTGCTTCAGA ATTGTGTTCA CCGAATGTAG 360
AAGAGAGAAA TTTCAAGAAG CGGGTCCTTG AGTGTGAAAA TTTGTTTATG CTGCTGTTGG 420
AAGCAGAGAA GAGGATTAGG CGTTGAGCAC AAGGAGCTAT GAGAGAAATA GACGATTATA 480
ATCAAAATGG ACAACAAGTA GCCGTAGGAG AAGAAAATTG GAAATTGAGT TGAGTTGGTA 540
CGGAATTCTG TTGGTGGGAA TTGTTTTTGA ATAGGCATGC TGGAAATGTT GTAGTACTAA 600
AAATATTCCC AAAAAACTAA AGTTTAGTCG CATTTCAATC ACTCAGAAGC TTCTATGCTA 660
AATAAAAATC TATGTGTGTC AAATTTTCAA TACAATCTAA AAATTTATAG TATGGTACAG 720
TTATCAAAAG AAAGTTTTGA TAGGAGTCTA TTAGATGTGA AAGTCCTAAT AATCAAAATA 780
CGGGCAGATC GGGTTTTGAG TTGTCTTCAC CGTTATGCTG GAACTTTCTT AAACTTTAAT 840
TTCCTATTTT GCAAAACAAC TTGGAACAAA ACTCTAGAGA AAATGAAGAA AATTAGCATA 900
TGCTCATATA GTTGGAACAA GAGAAATCTG ATTAGCTAGG ACCGCTTGTT GTACTTGATT 960
CCAATGTGCC AAAAAGATGG CACATCTGGA GGGATACCTC TAATTAGAAA TATTCTTTCT 1020
TCCTTCTTCC TCTTTAGACG TCAACAACGA CAACAATGGG TGGATGAACC AAGAGAAGAA 1080
AAATAGGAAA ATGGTGATTT GAGCCAACAG AAGGGTGTGA AGAGCTCTGG CACCCATAGG 1140
TACGAAGGGT ATGAATGGGA CCATTGAAAT GTGAAGGATA AACAAGAAGT TTTGAAGAAT 1200
TCGTAATCGT TCTCTCCGGA AGTTTGTCTA TTCAAAAATG AGAACAAGTT GAAATGAAAA 1260
TAGAGTGAGA GACGTAGAAT AAGGTGTTCA A 1291