EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-03005 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrII:6988470-6989059 
TF binding sites/motifs
Number: 62             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:6988699-6988709AAGAAGATGA+3.03
blmp-1MA0537.1chrII:6989010-6989020TATCTTTTCT-3.05
blmp-1MA0537.1chrII:6988820-6988830AAGATGAATG+3.09
blmp-1MA0537.1chrII:6988817-6988827GAAAAGATGA+3.11
blmp-1MA0537.1chrII:6988617-6988627GAATCGATAG+3.18
blmp-1MA0537.1chrII:6988742-6988752CTTCCATTTC-3.22
blmp-1MA0537.1chrII:6988696-6988706GAAAAGAAGA+3.52
blmp-1MA0537.1chrII:6988861-6988871CTTCTTTCTT-3.62
blmp-1MA0537.1chrII:6988748-6988758TTTCTCTCTT-3.79
blmp-1MA0537.1chrII:6988879-6988889TTTCTTTTCT-4.09
blmp-1MA0537.1chrII:6989017-6989027TCTCGTTTTT-4.36
blmp-1MA0537.1chrII:6988664-6988674TTTCACTTCC-4.5
blmp-1MA0537.1chrII:6988884-6988894TTTCTTTTTC-4.91
blmp-1MA0537.1chrII:6988750-6988760TCTCTCTTTC-5.25
ceh-22MA0264.1chrII:6988782-6988792ACACTTGTAA+3.39
ceh-48MA0921.1chrII:6988480-6988488TATTGACT-3.56
ceh-48MA0921.1chrII:6988619-6988627ATCGATAG+4.44
che-1MA0260.1chrII:6988493-6988498GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrII:6988587-6988592GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrII:6988851-6988865CCTCACACGCCTTC-3.21
dsc-1MA0919.1chrII:6988547-6988556CTTATTAAT+3.1
dsc-1MA0919.1chrII:6988547-6988556CTTATTAAT-3.1
dsc-1MA0919.1chrII:6988962-6988971CTTATTAGT+3.3
dsc-1MA0919.1chrII:6988962-6988971CTTATTAGT-3.3
dsc-1MA0919.1chrII:6988536-6988545ATAATTAAT+3.62
dsc-1MA0919.1chrII:6988536-6988545ATAATTAAT-3.62
elt-3MA0542.1chrII:6988501-6988508TTAATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrII:6988662-6988669CTTTTCA+3.31
eor-1MA0543.1chrII:6988751-6988765CTCTCTTTCTACAG-3.25
eor-1MA0543.1chrII:6988694-6988708CAGAAAAGAAGATG+3.34
eor-1MA0543.1chrII:6988877-6988891TTTTTCTTTTCTTT-3.35
eor-1MA0543.1chrII:6988743-6988757TTCCATTTCTCTCT-3.44
eor-1MA0543.1chrII:6989016-6989030TTCTCGTTTTTTCT-3.44
eor-1MA0543.1chrII:6989018-6989032CTCGTTTTTTCTCG-3.76
eor-1MA0543.1chrII:6988749-6988763TTCTCTCTTTCTAC-4.57
fkh-2MA0920.1chrII:6988562-6988569AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrII:6988632-6988639TATTTAC-3.21
fkh-2MA0920.1chrII:6988476-6988483TGTTTAT-4.31
lim-4MA0923.1chrII:6988537-6988545TAATTAAT-3.12
lim-4MA0923.1chrII:6988954-6988962GTAATGAA+3.13
lim-4MA0923.1chrII:6988536-6988544ATAATTAA+3.57
lin-14MA0261.1chrII:6988708-6988713AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrII:6988720-6988725TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrII:6988934-6988941TAATTCC-3.14
pal-1MA0924.1chrII:6988955-6988962TAATGAA+3.17
pal-1MA0924.1chrII:6988537-6988544TAATTAA+3.54
pha-4MA0546.1chrII:6988633-6988642ATTTACAAT-3.54
pha-4MA0546.1chrII:6988481-6988490ATTGACTTT-4.11
skn-1MA0547.1chrII:6989041-6989055ATTTGAAGAAATAT+3.62
sma-4MA0925.1chrII:6988692-6988702TACAGAAAAG-3.08
unc-62MA0918.1chrII:6988784-6988795ACTTGTAACTG+3.09
unc-62MA0918.1chrII:6988796-6988807AATGACATGCT-3.57
unc-86MA0926.1chrII:6988549-6988556TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrII:6988540-6988547TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrII:6988931-6988938TATTAAT+3.35
unc-86MA0926.1chrII:6988513-6988520TTCATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrII:6988955-6988962TAATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrII:6988537-6988544TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrII:6988550-6988560ATTAATTTTT+3.08
zfh-2MA0928.1chrII:6988932-6988942ATTAATTCCT+3.17
zfh-2MA0928.1chrII:6988535-6988545AATAATTAAT+3.46
zfh-2MA0928.1chrII:6988536-6988546ATAATTAATA-3.87
Enhancer Sequence
CAATTTTGTT TATTGACTTT CCGGTTTCGC TTTAATCATT TCATTCATAT TTTCACGAGT 60
AATTTAATAA TTAATAACTT ATTAATTTTT AAAAAACAAA TGAAATATTT TTTTAAGGTT 120
TCGACTTATG AGTGGGAAAA GTTTCAGGAA TCGATAGCAT ATTATTTACA ATTTTCTAAT 180
ATCACATTGT TTCTTTTCAC TTCCACCAAA TGATAATTCC AGTACAGAAA AGAAGATGAA 240
CAGTAAATCG TGTTCTATTC TCCAAATGGT CACTTCCATT TCTCTCTTTC TACAGTTGAT 300
ACATTGCATT CCACACTTGT AACTGAAATG ACATGCTAAA TGCCAAAGAA AAGATGAATG 360
GAAATGCCAA ATGAACGTTC CCCTCACACG CCTTCTTTCT TCACTACTTT TTCTTTTCTT 420
TTTCAACCAT TTTGTGACGA AGAACTGTTT TCGAAAAGAA GTATTAATTC CTCAATTTAC 480
TTCGGTAATG AACTTATTAG TAACACGATA AGTTTTGGTT TTCAGGACAG TATGCTTAAA 540
TATCTTTTCT CGTTTTTTCT CGGGGCAAGA AATTTGAAGA AATATCAAA 589