EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01994 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:14631734-14632961 
TF binding sites/motifs
Number: 63             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:14632145-14632155TTTCATCTTT-3.37
blmp-1MA0537.1chrI:14632179-14632189TTTCCATTTC-4.42
ceh-22MA0264.1chrI:14632691-14632701GTCAAGAGGG-4.05
ceh-48MA0921.1chrI:14631823-14631831TCCAATAT+3.12
ceh-48MA0921.1chrI:14632581-14632589TCCAATAC+3.12
ces-2MA0922.1chrI:14631788-14631796TAACATAA+3.1
ces-2MA0922.1chrI:14631793-14631801TAACGAAA+3
ces-2MA0922.1chrI:14632907-14632915TTATATAA+4.53
ces-2MA0922.1chrI:14632908-14632916TATATAAT-4.53
che-1MA0260.1chrI:14632467-14632472AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:14631852-14631857GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrI:14632392-14632406GACGCATGTGCGTC+3.33
daf-12MA0538.1chrI:14632248-14632262ACGCACATGCGTCC-3.33
daf-12MA0538.1chrI:14632463-14632477ATAGAAACGCATTT-3.52
dsc-1MA0919.1chrI:14632325-14632334CTGATTAAG+3.12
dsc-1MA0919.1chrI:14632325-14632334CTGATTAAG-3.12
elt-3MA0542.1chrI:14632919-14632926GATGAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:14631972-14631979GATATAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:14632803-14632810GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:14632813-14632820TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrI:14632613-14632620CTTATCC+3.35
elt-3MA0542.1chrI:14632544-14632551GATCAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrI:14632711-14632718GATAATA-3.81
elt-3MA0542.1chrI:14632514-14632521TTTATCT+3
eor-1MA0543.1chrI:14632509-14632523TTTTTTTTATCTCA-3.11
eor-1MA0543.1chrI:14632605-14632619CTCTTCTTCTTATC-3.37
eor-1MA0543.1chrI:14632608-14632622TTCTTCTTATCCCC-3.49
eor-1MA0543.1chrI:14632178-14632192TTTTCCATTTCTCT-3.68
eor-1MA0543.1chrI:14632180-14632194TTCCATTTCTCTTT-3.76
fkh-2MA0920.1chrI:14632877-14632884TGTATAT-3.12
fkh-2MA0920.1chrI:14632597-14632604TGTATAT-3.16
fkh-2MA0920.1chrI:14632068-14632075TTTTTAC-3.26
fkh-2MA0920.1chrI:14632512-14632519TTTTTAT-3.3
hlh-1MA0545.1chrI:14632629-14632639AGCAATTGTG+3.27
hlh-1MA0545.1chrI:14632667-14632677ACAGTTGGCG-3.35
hlh-1MA0545.1chrI:14632630-14632640GCAATTGTGG-3.38
hlh-1MA0545.1chrI:14632666-14632676AACAGTTGGC+4.77
lim-4MA0923.1chrI:14632109-14632117TGATTAGT-3.38
lin-14MA0261.1chrI:14631832-14631837AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:14632675-14632680CGTTC-3.36
pal-1MA0924.1chrI:14632499-14632506TTATTGT-3.24
pal-1MA0924.1chrI:14632779-14632786TAATGAT-3.26
pal-1MA0924.1chrI:14631840-14631847TCATAAA+3.29
pal-1MA0924.1chrI:14632686-14632693TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrI:14632898-14632905GTATTAC-3
pha-4MA0546.1chrI:14632812-14632821ATTTATCAT-3.22
pha-4MA0546.1chrI:14632600-14632609ATATGCTCT-3
skn-1MA0547.1chrI:14632143-14632157CATTTCATCTTTCC-3.76
skn-1MA0547.1chrI:14632912-14632926TAATGGTGATGAAA+3.79
skn-1MA0547.1chrI:14632915-14632929TGGTGATGAAAAAT+4.19
skn-1MA0547.1chrI:14632320-14632334AATTGCTGATTAAG+4.33
skn-1MA0547.1chrI:14632564-14632578AAATCCTGACATTA+4.41
sma-4MA0925.1chrI:14632818-14632828CATAGACAGT-3.28
snpc-4MA0544.1chrI:14632646-14632657GCCGACGACAA-4.4
snpc-4MA0544.1chrI:14632360-14632371TGTCGGCCGTC+5.05
snpc-4MA0544.1chrI:14632283-14632294ACGGCCGACAA-5.05
unc-62MA0918.1chrI:14632054-14632065TATGACAAGCT-3.09
unc-86MA0926.1chrI:14632877-14632884TGTATAT-3.07
unc-86MA0926.1chrI:14632885-14632892TGCATGT-3.18
unc-86MA0926.1chrI:14632883-14632890TATGCAT+4.66
vab-7MA0927.1chrI:14632109-14632116TGATTAG-3.13
vab-7MA0927.1chrI:14632326-14632333TGATTAA+3.27
vab-7MA0927.1chrI:14632779-14632786TAATGAT-3.43
Enhancer Sequence
AACATTAACA TTACTGGTAG CCTTTTTTAA AGCCTATTAA CAAGCCTTCA AGCCTAACAT 60
AACGAAATCA TATTGCCTTT CACCATACAT CCAATATGAA CAGATATCAT AAATCTGGGC 120
TTCCCTAGTA ATATTACACT ACGAAAGAGT ATGCTACAAG TATGGTTTTT TTCCAGTTGA 180
ACCTTTTTTT AAGAACCTTG AAACTTTATG GAAAGGGTTG CAACACTAAT GCACACGTGA 240
TATAAGATAT CCTATTACTG TAACTATTCA TGAATGAATT TTTAAAGAAA ACTGAACAAT 300
CAAAACTGAA TTTTAAAAAA TATGACAAGC TCAGTTTTTA CAGTGCCATG TTACATAGCT 360
TTGTTCTCCG GAATTTGATT AGTGTCTAAT TTTACAATAA GAAGTACCAC ATTTCATCTT 420
TCCAATTTTC ATACATTCCC ATATTTTTCC ATTTCTCTTT ACCCACTATT AGGGCTGTAC 480
AACCGGACGT CCGGTCGTCC GAAGTTCGAA CCGGACGCAC ATGCGTCCGG TTGGGGGTAG 540
CTATCCACGA CGGCCGACAA TTTCCGAATT TCGCCACTCA CTATAAAATT GCTGATTAAG 600
TATAGTGAGT GGCGAAACTC GGAAGTTGTC GGCCGTCGTG GATAGCTACC CCCAACCGGA 660
CGCATGTGCG TCCGGTGGTG TCAAAATCGG ACGACCGGAC GCCGATTTGT ACAGCCCTAC 720
CCACTATCCA TAGAAACGCA TTTACTTCCC TTAAACTTTT TTTTGTTATT GTTCTTTTTT 780
TTTATCTCAG ATTCCCAAAA GTCGGTCAAT GATCAGAGTC TCAGTTTTTG AAATCCTGAC 840
ATTAGAATCC AATACTACTT GTGTGTATAT GCTCTTCTTC TTATCCCCGA AAAGAAGCAA 900
TTGTGGCATC CAGCCGACGA CAAAACATTC GAAACAGTTG GCGTTCGAGA GTTTATTGTC 960
AAGAGGGCAA CTTGTTTGAT AATATCAGTG GATTATGTGG AAGAGGTATA ATAGTAGTGG 1020
TTTATTTTGA ATTTAGGGTT ATATTTAATG ATTTTGTAGG AGAATACTTG TTAAAACTAT 1080
TTATCATAGA CAGTATTTCT AAATAAGTCG TGATAATTTA ATGTCAACTA AGATTCGTGA 1140
TCATGTATAT ATGCATGTAT GTATGTATTA CGATTATATA ATGGTGATGA AAAATAGATC 1200
CATGAATAGT ACCAGCTACT TGCTACA 1227