EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01981 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:14551170-14551776 
TF binding sites/motifs
Number: 32             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:14551618-14551628CTTCTTCTTT-3.05
blmp-1MA0537.1chrI:14551588-14551598AGAAGGAAGC+3.12
blmp-1MA0537.1chrI:14551678-14551688AAATAGAGGT+3.24
blmp-1MA0537.1chrI:14551269-14551279ACTCTTCTTC-3
ceh-22MA0264.1chrI:14551596-14551606GCTCTTCAAA+3.66
ceh-48MA0921.1chrI:14551370-14551378TATCGGAC-3.2
ceh-48MA0921.1chrI:14551724-14551732TATTGAAT-3.49
ces-2MA0922.1chrI:14551741-14551749TATCTTAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:14551714-14551722TGATATAA+3.25
che-1MA0260.1chrI:14551617-14551622GCTTC-3.2
che-1MA0260.1chrI:14551552-14551557AAGCC+3.7
dpy-27MA0540.1chrI:14551583-14551598TTACGAGAAGGAAGC-4.05
elt-3MA0542.1chrI:14551199-14551206GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:14551210-14551217GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:14551715-14551722GATATAA-3.14
fkh-2MA0920.1chrI:14551731-14551738TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:14551331-14551338TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:14551737-14551744TGTTTAT-3.81
lim-4MA0923.1chrI:14551546-14551554GTAATGAA+3.13
lin-14MA0261.1chrI:14551757-14551762AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:14551512-14551517AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrI:14551259-14551264TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrI:14551334-14551341TTATTCC-3.15
pal-1MA0924.1chrI:14551547-14551554TAATGAA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:14551738-14551747GTTTATCTT-3.62
skn-1MA0547.1chrI:14551195-14551209AAATGATCAAAAAT+3.06
skn-1MA0547.1chrI:14551319-14551333GTAAGATGATATTT+4.28
sma-4MA0925.1chrI:14551226-14551236TCGTCTGGCT+3.28
sma-4MA0925.1chrI:14551305-14551315TTGACTAGAC+3.32
sma-4MA0925.1chrI:14551308-14551318ACTAGACAAT-3.92
snpc-4MA0544.1chrI:14551517-14551528GCCGCCGACGA-4.7
vab-7MA0927.1chrI:14551547-14551554TAATGAA+3.29
Enhancer Sequence
ATGTTTTTCA GCTTCAACTT CATCGAAATG ATCAAAAATT GATCAAACCA TTATCGTCGT 60
CTGGCTCAGA ATCATAATTT TTGTTCATGT GTTCGTGGCA CTCTTCTTCT GCCACCTGAA 120
GTTCCTTAAA ATCACTTGAC TAGACAATAG TAAGATGATA TTTTTTATTC CGCCCCAGCT 180
TTCTCAAGCA CTTTGCCAGC TATCGGACGA AGTGCACGGG GAAGTTGACG CTACTTGCCG 240
AGTACGACAT ACTCAATCTG ACTCAATTTG CAGGCTTTGT CACATTCTCA GGAATTCTGG 300
TTGGATTCGC TTTGACATAC TTCTCCAGCA AAATTCCAGA AGAACACGCC GCCGACGATT 360
TCCACCCAAT TCGACGGTAA TGAAGCCTCG TTCGTGGAGC AGAGGGAGAA GTTTTACGAG 420
AAGGAAGCTC TTCAAAAAGA CAAAGCCGCT TCTTCTTTTG CTCAACGGGA AGATATTTGT 480
CGTGATCGAG ACAGTATTGT GATTGTGGAA ATAGAGGTTT TAGATCAAAA TCGGTGCCCA 540
TGAATGATAT AAATTATTGA ATAAAAATGT TTATCTTATA GCTTTTGAAC ATTTTCAGAA 600
CAATTT 606