EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01962 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:14446980-14448016 
TF binding sites/motifs
Number: 51             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:14447928-14447938TTTCTTTTTT-4.04
blmp-1MA0537.1chrI:14447989-14447999TTTCTTTTTT-4.98
ceh-22MA0264.1chrI:14447191-14447201TTGAAGTGTA-4.05
ceh-48MA0921.1chrI:14447320-14447328ATCAATAG+3.03
ceh-48MA0921.1chrI:14447877-14447885ATCGATGT+3.19
ceh-48MA0921.1chrI:14447296-14447304ATCAATTA+3.22
ceh-48MA0921.1chrI:14448007-14448015CATCGGTT-3.24
ces-2MA0922.1chrI:14447563-14447571TTTATAAT-3.18
ces-2MA0922.1chrI:14447788-14447796TGATGTAA+3.32
che-1MA0260.1chrI:14447927-14447932GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:14447694-14447708AAAGTGTGTGTGTG+5.04
daf-12MA0538.1chrI:14447968-14447982AGCGCGCTTGCATC+5.3
daf-12MA0538.1chrI:14447700-14447714TGTGTGTGTGCTGA+5.86
daf-12MA0538.1chrI:14447696-14447710AGTGTGTGTGTGTG+6.51
daf-12MA0538.1chrI:14447698-14447712TGTGTGTGTGTGCT+6.51
dsc-1MA0919.1chrI:14447843-14447852TTAATTGAC+3.14
dsc-1MA0919.1chrI:14447843-14447852TTAATTGAC-3.14
efl-1MA0541.1chrI:14447721-14447735TTTTTCCGGGCAAA-3.25
efl-1MA0541.1chrI:14447660-14447674AAATGCGGGAGAAG+3.26
efl-1MA0541.1chrI:14447940-14447954AATGCGCGCCAAAA-3.91
efl-1MA0541.1chrI:14447736-14447750ATTTCCCGCATTTT-4.3
efl-1MA0541.1chrI:14447941-14447955ATGCGCGCCAAAAC+5.26
elt-3MA0542.1chrI:14447334-14447341TTCATCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:14447430-14447437CTTTTCA+3.31
elt-3MA0542.1chrI:14447933-14447940TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:14448002-14448009TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:14447885-14447892GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:14447278-14447292GAAAGATACAAAAA+3.47
fkh-2MA0920.1chrI:14447352-14447359TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:14447994-14448001TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:14447644-14447651TGTTGAT-3.66
hlh-1MA0545.1chrI:14447338-14447348TCAGTTGATC-3.35
hlh-1MA0545.1chrI:14447337-14447347ATCAGTTGAT+3.41
lim-4MA0923.1chrI:14447293-14447301GTAATCAA+3.12
lim-4MA0923.1chrI:14447844-14447852TAATTGAC-3.65
mab-3MA0262.1chrI:14447314-14447326AAACGCATCAAT-3.54
pal-1MA0924.1chrI:14447294-14447301TAATCAA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:14447291-14447300ATGTAATCA+3.12
pha-4MA0546.1chrI:14447645-14447654GTTGATCTA-3.4
snpc-4MA0544.1chrI:14447108-14447119TGTCGGCCGCT+7.5
snpc-4MA0544.1chrI:14447178-14447189TGTCGGCCGCT+7.5
unc-62MA0918.1chrI:14447326-14447337AGTTACATTTC-3.02
unc-62MA0918.1chrI:14447768-14447779TGAGACAGCAT-3.02
unc-62MA0918.1chrI:14447615-14447626AACTGTCTTAT+3.27
unc-86MA0926.1chrI:14447044-14447051TATGTAT+3.06
unc-86MA0926.1chrI:14447359-14447366TATGCAC+3.18
unc-86MA0926.1chrI:14447570-14447577TGCACAT-3.18
unc-86MA0926.1chrI:14447048-14447055TATGAAT+3.68
vab-7MA0927.1chrI:14447298-14447305CAATTAC-3.09
vab-7MA0927.1chrI:14447809-14447816TAATGAT+3.12
zfh-2MA0928.1chrI:14447842-14447852TTTAATTGAC+3.07
Enhancer Sequence
AGACAGTTAG TTAACTACAA TCGTGCAATA TCAGCTCCAG GTACCCTCTT TTGGTAGCGA 60
TAGATATGTA TGAATTTTGC ATACACACCA AGCTACTTGT TTCACGCCAA GCTGCGGAAA 120
CTCGAAAGTG TCGGCCGCTC CAAACAACTA CCTTTTCACA CTACGTTGCG CACACCTCAA 180
GCTGCGGAAC CCTGAACGTG TCGGCCGCTG TTTGAAGTGT AAGTAAGTAA GTAAGTAAGT 240
CAAAAGTGCT TGCAAAAATG GCTTTTTTAA CTTTGAGCGG CGCTAACTTG AGGTACGTGA 300
AAGATACAAA AATGTAATCA ATTACAATAT TAACAAACGC ATCAATAGTT ACATTTCATC 360
AGTTGATCAC TTTGTTGAAT ATGCACTGGT TGCTGAGCTA CGATGAGTTT TAGTGGAGCT 420
CGTCCAATTT TTCAAAACTC AAAACCCTAT CTTTTCACTA TATGACCCGT AACACCAAAA 480
CCACTAACAA AAAAATGTAT CTGTTTCCAG GTCCTCGGCA AGGGCGCCGA GGACCTGGAA 540
TAAGGAAAGG TTTGGATAAA TGTTAATATT CTTTTATTTT CGTTTTATAA TGCACATGAG 600
CCTAGCAATA CAAGTAATGT AACACGTGGG TGTTAAACTG TCTTATTTTG GATACGATCT 660
ACGTTGTTGA TCTACCAAAA AAATGCGGGA GAAGAGACTG ATTTCGCATG GTTAAAAGTG 720
TGTGTGTGTG CTGACGTCAC ATTTTTCCGG GCAAAAATTT CCCGCATTTT TTGTAGATCA 780
CGTCGCAATG AGACAGCATG ACGCCACATG ATGTAAGTGA TGTAAGCCCT AATGATTGGG 840
GTACCGAAAT CTGGGAAATA TTTTTAATTG ACTTCAAATT TTCCCCTGAT TCCCAAAATC 900
GATGTGAAAA AAATTTTAAA AAATTCCCTG ATTTTATATT TACCCCGGTT TCTTTTTTCA 960
AATGCGCGCC AAAACAAATT CGCATTGGAG CGCGCTTGCA TCGTTTGATT TTCTTTTTTA 1020
TTTTTTTCAT CGGTTT 1036