EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01955 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:14400282-14400857 
TF binding sites/motifs
Number: 30             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:14400713-14400723TAAATGAGAA+3.26
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:14400686-14400699TAATGAAAATAAC-4.02
ceh-22MA0264.1chrI:14400480-14400490CTACTTGATG+3.36
ces-2MA0922.1chrI:14400755-14400763TTACACAC+3.15
daf-12MA0538.1chrI:14400636-14400650TAATAGACACTCAC-3.02
daf-12MA0538.1chrI:14400759-14400773ACACACACACATGT-3.51
daf-12MA0538.1chrI:14400755-14400769TTACACACACACAC-5.58
daf-12MA0538.1chrI:14400757-14400771ACACACACACACAT-5.66
dsc-1MA0919.1chrI:14400318-14400327CTAATTTGG+3.19
dsc-1MA0919.1chrI:14400613-14400622CAAATTAGT+3.19
dsc-1MA0919.1chrI:14400777-14400786CTAATTTGG+3.19
dsc-1MA0919.1chrI:14400318-14400327CTAATTTGG-3.19
dsc-1MA0919.1chrI:14400613-14400622CAAATTAGT-3.19
dsc-1MA0919.1chrI:14400777-14400786CTAATTTGG-3.19
elt-3MA0542.1chrI:14400711-14400718GATAAAT-3.23
elt-3MA0542.1chrI:14400453-14400460CCTATCA+3.35
lin-14MA0261.1chrI:14400282-14400287TGTTC-3.01
pal-1MA0924.1chrI:14400742-14400749TAATAAC+3.36
pha-4MA0546.1chrI:14400657-14400666GTATGCTTA-3.02
pha-4MA0546.1chrI:14400735-14400744AAGTGAATA+3.08
pha-4MA0546.1chrI:14400688-14400697ATGAAAATA+3.1
sma-4MA0925.1chrI:14400293-14400303GTGTCTATTA+3.06
sma-4MA0925.1chrI:14400637-14400647AATAGACACT-3.15
sma-4MA0925.1chrI:14400395-14400405TCCAGACTGA-3.33
unc-62MA0918.1chrI:14400767-14400778ACATGTAATAC+3.15
unc-86MA0926.1chrI:14400660-14400667TGCTTAT-3.17
unc-86MA0926.1chrI:14400683-14400690TATTAAT+3.35
zfh-2MA0928.1chrI:14400776-14400786ACTAATTTGG+3.32
zfh-2MA0928.1chrI:14400613-14400623CAAATTAGTA-3.32
zfh-2MA0928.1chrI:14400317-14400327ACTAATTTGG+3.37
Enhancer Sequence
TGTTCAAGAC TGTGTCTATT AGTCAAACAT GCAAGACTAA TTTGGCCCGT AGCTTAAAAG 60
GTCTTAGGTT GTCCGTTTGG TTCAGAGGGA ATACTGGTGG CGTATAAATC TCTTCCAGAC 120
TGAATTTAAG CCGCGCCGGG ATCAGAGGCA TTTCGGTATT GTGATTTTTT TCCTATCAAG 180
CTCGTTCCGT TGGAATAACT ACTTGATGGA AAAAAAAATC ACAATGCCGA AATGCCTCTG 240
TACGGCATAA ATTCGGTCTA AAAGAGATTT ATACGCCACC AGTACCCCCT CAGAACCAAG 300
TGGACAACCT AATACCTTTT AAGCTACGGG CCAAATTAGT ATTGCATGTT AGACTAATAG 360
ACACTCACGT GAAATGTATG CTTATATATA TTGGAATGGT GTATTAATGA AAATAACTAT 420
TGTAATAATG ATAAATGAGA ACAACAATGA ACAAAGTGAA TAATAACAAA ATATTACACA 480
CACACACATG TAATACTAAT TTGGTCCGTA GCTAAAAATA GGCTGAATTT AAGCCGTACC 540
GGGATGGGAC CGAAGATGCA ATAGTAAAAG TGGAT 575