EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01823 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:13498647-13499264 
TF binding sites/motifs
Number: 55             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13499005-13499015CCTCCCCCTC-3.13
blmp-1MA0537.1chrI:13499173-13499183AGGAAGAGAG+3.41
blmp-1MA0537.1chrI:13499175-13499185GAAGAGAGAC+3.6
blmp-1MA0537.1chrI:13498919-13498929AAAATGAAGA+4.15
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:13498789-13498802TTTTGTTAGTTAG+3.32
ceh-22MA0264.1chrI:13498992-13499002GACAAGTGCC-3.79
ceh-22MA0264.1chrI:13499127-13499137GCACTTGATA+4.01
ces-2MA0922.1chrI:13498833-13498841TTACACAA+3.15
ces-2MA0922.1chrI:13499063-13499071TTATGCAA+4.22
che-1MA0260.1chrI:13498978-13498983GTTTC-3.06
daf-12MA0538.1chrI:13499080-13499094ACGCAGACACCCAA-3.93
dsc-1MA0919.1chrI:13499068-13499077CAAATTAGA+3.07
dsc-1MA0919.1chrI:13499068-13499077CAAATTAGA-3.07
dsc-1MA0919.1chrI:13499225-13499234TCAATTAAT+3.27
dsc-1MA0919.1chrI:13499225-13499234TCAATTAAT-3.27
dsc-1MA0919.1chrI:13498765-13498774ATAATTACC+3.4
dsc-1MA0919.1chrI:13498765-13498774ATAATTACC-3.4
efl-1MA0541.1chrI:13498821-13498835CTCCCCGCCAAGTT+3.2
efl-1MA0541.1chrI:13498820-13498834ACTCCCCGCCAAGT-3.41
elt-3MA0542.1chrI:13499133-13499140GATATGA-3.58
eor-1MA0543.1chrI:13499073-13499087TAGAGAGACGCAGA+3.4
eor-1MA0543.1chrI:13498917-13498931GAAAAATGAAGAAA+3.65
eor-1MA0543.1chrI:13499170-13499184ACGAGGAAGAGAGA+4.21
eor-1MA0543.1chrI:13499004-13499018CCCTCCCCCTCTTC-4.25
eor-1MA0543.1chrI:13499075-13499089GAGAGACGCAGACA+7.93
hlh-1MA0545.1chrI:13498993-13499003ACAAGTGCCC-3.35
lim-4MA0923.1chrI:13498801-13498809GCAATTAC+3.01
lim-4MA0923.1chrI:13499225-13499233TCAATTAA+3.52
lim-4MA0923.1chrI:13498766-13498774TAATTACC-3.55
lin-14MA0261.1chrI:13498649-13498654TGTTC-3.01
mab-3MA0262.1chrI:13498770-13498782TACCGCAAAATT-3.58
pal-1MA0924.1chrI:13498766-13498773TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrI:13498802-13498809CAATTAC+3.59
pha-4MA0546.1chrI:13498650-13498659GTTCACTCT-3.25
skn-1MA0547.1chrI:13498920-13498934AAATGAAGAAAATA+5.23
sma-4MA0925.1chrI:13498913-13498923CCTAGAAAAA-3.01
sma-4MA0925.1chrI:13498808-13498818CTTTCTAGCT+3.17
sma-4MA0925.1chrI:13499081-13499091CGCAGACACC-3.4
snpc-4MA0544.1chrI:13499079-13499090GACGCAGACAC-3.93
unc-62MA0918.1chrI:13499159-13499170ATATGTCAAGC+3.15
unc-62MA0918.1chrI:13499179-13499190AGAGACAAGTT-3.21
unc-62MA0918.1chrI:13498688-13498699TCATGTCATCT+3.34
unc-62MA0918.1chrI:13498960-13498971GGCTGTCAACT+3.55
unc-62MA0918.1chrI:13498989-13499000ATTGACAAGTG-3.8
unc-86MA0926.1chrI:13499066-13499073TGCAAAT-3.09
unc-86MA0926.1chrI:13499229-13499236TTAATAT-3.47
unc-86MA0926.1chrI:13499250-13499257TATGAAT+3.58
vab-7MA0927.1chrI:13498795-13498802TAGTTAG-3.05
vab-7MA0927.1chrI:13498766-13498773TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrI:13498766-13498773TAATTAC+3.6
zfh-2MA0928.1chrI:13499252-13499262TGAATTAGGT-3.11
zfh-2MA0928.1chrI:13499068-13499078CAAATTAGAG-3.16
zfh-2MA0928.1chrI:13499225-13499235TCAATTAATA-3.28
zfh-2MA0928.1chrI:13498765-13498775ATAATTACCG-3.37
zfh-2MA0928.1chrI:13498764-13498774AATAATTACC+3.4
Enhancer Sequence
ACTGTTCACT CTCTAGAGTT ATGGGGCTTT GAAGACTACA TTCATGTCAT CTACATTGTC 60
TTTAAACTCC CATATCTCAA CGAACAATGG ATTTAACAAA AAGTTTCCAA CTAGCAAAAT 120
AATTACCGCA AAATTCCCTA CATTTTGTTA GTTAGCAATT ACTTTCTAGC TCAACTCCCC 180
GCCAAGTTAC ACAAGTTTTA AAATTTTAGG TACGGAGCTA TCAAGCTATC AAATAGGTCT 240
AAATATTGTA GTTTATAGTG TCCTAACCTA GAAAAATGAA GAAAATAGTA AGAATGTGAG 300
AATTTGTGAA AATGGCTGTC AACTTCACGT CGTTTCGTGT CAATTGACAA GTGCCCCCCC 360
TCCCCCTCTT CCAATTGCGA AACAAGTCTT TCACTGAGAG AATATAAGTA GAGAGATTAT 420
GCAAATTAGA GAGACGCAGA CACCCAAAGA CCATTGTCAT TGTTTGGATA AGCTCTCATG 480
GCACTTGATA TGATATAGGG AGGTTAAGCA TGATATGTCA AGCACGAGGA AGAGAGACAA 540
GTTGATCTGG TTAGTATGTA GTTTGTAGTC ACTGAGCCTC AATTAATATG CTATTGACAA 600
CCTTATGAAT TAGGTGT 617