EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01788 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:13289705-13290584 
TF binding sites/motifs
Number: 79             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13290190-13290200AAATTGAATT+3.03
blmp-1MA0537.1chrI:13289990-13290000TTTCGTTTAT-3.15
blmp-1MA0537.1chrI:13290435-13290445CTTCGTCTTC-3.21
blmp-1MA0537.1chrI:13290464-13290474TTTCATCTTT-3.37
blmp-1MA0537.1chrI:13290383-13290393CCTCATTTTT-3.38
blmp-1MA0537.1chrI:13290416-13290426CCTCATTTTC-3.99
blmp-1MA0537.1chrI:13289731-13289741TTTCACCTTT-4.3
ceh-22MA0264.1chrI:13290574-13290584TTCAAGTATT-3.52
ceh-22MA0264.1chrI:13290025-13290035CCACTTGTGC+3.66
ceh-48MA0921.1chrI:13290498-13290506CATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrI:13290123-13290131ATCGATTA+3.06
ceh-48MA0921.1chrI:13289815-13289823AATCGGTT-3.22
ceh-48MA0921.1chrI:13290117-13290125CTCGATAT+3.41
ceh-48MA0921.1chrI:13290122-13290130TATCGATT-4.57
ceh-48MA0921.1chrI:13290002-13290010TATCGAAT-4
ces-2MA0922.1chrI:13289983-13289991TGCGTATT-3.01
ces-2MA0922.1chrI:13289745-13289753TATAAAAT-3.12
ces-2MA0922.1chrI:13290366-13290374TATTTAAT-3.54
ces-2MA0922.1chrI:13289997-13290005TATTTTAT-3
che-1MA0260.1chrI:13290354-13290359AAGCG+3.2
daf-12MA0538.1chrI:13290526-13290540TGTGCACTTGGGTC+3.21
daf-12MA0538.1chrI:13290512-13290526TGTACGAGTGTGTG+3.22
daf-12MA0538.1chrI:13290516-13290530CGAGTGTGTGTGTG+3.56
daf-12MA0538.1chrI:13290514-13290528TACGAGTGTGTGTG+3.72
daf-12MA0538.1chrI:13290518-13290532AGTGTGTGTGTGCA+5.94
daf-12MA0538.1chrI:13290520-13290534TGTGTGTGTGCACT+6.05
dsc-1MA0919.1chrI:13290275-13290284TTAATTATG+3.48
dsc-1MA0919.1chrI:13290275-13290284TTAATTATG-3.48
dsc-1MA0919.1chrI:13290268-13290277TTAATTATT+3.67
dsc-1MA0919.1chrI:13290268-13290277TTAATTATT-3.67
elt-3MA0542.1chrI:13290283-13290290GATGAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:13290000-13290007TTTATCG+3.07
elt-3MA0542.1chrI:13290068-13290075GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:13289792-13289806CAGAAAAAAAAAAA+3.29
eor-1MA0543.1chrI:13289980-13289994TTTTGCGTATTTTC-3.36
eor-1MA0543.1chrI:13290406-13290420GTGTTCCTTTCCTC-3.46
eor-1MA0543.1chrI:13290433-13290447CTCTTCGTCTTCTG-3.97
fkh-2MA0920.1chrI:13289773-13289780TAAAAAT+3.04
hlh-1MA0545.1chrI:13289848-13289858ACACCTGATC-3.15
hlh-1MA0545.1chrI:13289964-13289974GCACCTGCGC-3.38
hlh-1MA0545.1chrI:13289847-13289857AACACCTGAT+3.99
lim-4MA0923.1chrI:13290275-13290283TTAATTAT+3.12
lim-4MA0923.1chrI:13290268-13290276TTAATTAT+3.24
lim-4MA0923.1chrI:13290269-13290277TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrI:13290276-13290284TAATTATG-3.6
lin-14MA0261.1chrI:13290078-13290083AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:13289862-13289867TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:13290082-13290087TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:13290103-13290108AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:13290304-13290309AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:13289847-13289852AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrI:13290407-13290412TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrI:13289770-13289777AAATAAA+3.12
pal-1MA0924.1chrI:13290151-13290158TAATGAA+3.17
pal-1MA0924.1chrI:13290269-13290276TAATTAT-3.54
pal-1MA0924.1chrI:13290276-13290283TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:13290525-13290534GTGTGCACT-3.09
pha-4MA0546.1chrI:13290073-13290082AAGTGAACA+3.24
pha-4MA0546.1chrI:13290549-13290558CAGCAAACA+3.26
skn-1MA0547.1chrI:13289751-13289765ATTTTCAACGTTTA-3.91
skn-1MA0547.1chrI:13290279-13290293TTATGATGAAATTT+4.42
skn-1MA0547.1chrI:13290462-13290476TATTTCATCTTTTT-5.24
sma-4MA0925.1chrI:13290198-13290208TTTTCTGGTG+3.34
sma-4MA0925.1chrI:13289955-13289965CTTTCTGGGG+3.67
sma-4MA0925.1chrI:13290564-13290574ACTAGACAGG-3.97
sma-4MA0925.1chrI:13289909-13289919CTGTCTGGCA+4.63
unc-62MA0918.1chrI:13290565-13290576CTAGACAGGTT-3.5
unc-86MA0926.1chrI:13290273-13290280TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrI:13290397-13290404TATGAAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:13290497-13290504TCATTGA+3.09
vab-7MA0927.1chrI:13290151-13290158TAATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrI:13290269-13290276TAATTAT-4.09
vab-7MA0927.1chrI:13290276-13290283TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:13289738-13289748TTTAATTTAT+3.11
zfh-2MA0928.1chrI:13290357-13290367CGAATTACTT-3.14
zfh-2MA0928.1chrI:13290275-13290285TTAATTATGA-3.43
zfh-2MA0928.1chrI:13290268-13290278TTAATTATTA-3.44
zfh-2MA0928.1chrI:13290267-13290277GTTAATTATT+3.84
zfh-2MA0928.1chrI:13290274-13290284ATTAATTATG+3.98
Enhancer Sequence
TGAGAACTTT TCATGTATTC CATAGTTTTC ACCTTTAATT TATAAAATTT TCAACGTTTA 60
AATTGAAATA AAAATTCTAA ATTTCAACAG AAAAAAAAAA AATCCTCGAA AATCGGTTGG 120
GAACTCGCAA AAAATCGTCA CGAACACCTG ATCAGCATGT TCGCTCCACC GCACATGAGC 180
ACGCGACGCG ACCGCATCGC CTCACTGTCT GGCACGAAAT AACACCACAG ATTTTGCAGT 240
TTTTTGGACC CTTTCTGGGG CACCTGCGCC CGATTTTTTG CGTATTTTCG TTTATTTTAT 300
CGAATTCCCC GTATTTTTCT CCACTTGTGC CTAAAATTTT AGTGATTTTC ATCGAAAACT 360
TGTGAAAAAA GTGAACATGT TCGACATTTT TCTGATGGAA CGCCTCAAAA AACTCGATAT 420
CGATTATTTT CAAATCCTGT TGCTTGTAAT GAATTTTGAG TGATTTTCGA TGATTTTCGT 480
AGGTGAAATT GAATTTTCTG GTGCGATTTT GATGCCGAAA TGTACAAATT TACCCAAAAA 540
CCGCGTAATT TTTGTGTTTT GTGTTAATTA TTAATTATGA TGAAATTTAG CACAGTGAGA 600
ACGCGGTATG TGGAGCAATA TATTTCTAAG ATTCTTGAAA ACCTATTTGA AGCGAATTAC 660
TTATTTAATC GTAAAATACC TCATTTTTTA AATATGAATT TGTGTTCCTT TCCTCATTTT 720
CGGTTTAACT CTTCGTCTTC TGGTGTTATA ATCTACATAT TTCATCTTTT TAAATTCAAA 780
AGTATGTCAT TCTCATTGAT TCGCCACTGT ACGAGTGTGT GTGTGCACTT GGGTCAAGAT 840
GACACAGCAA ACAATTCAGA CTAGACAGGT TCAAGTATT 879