EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01782 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:13267567-13268114 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13267708-13267718TTTCAATTCT-3.99
blmp-1MA0537.1chrI:13267715-13267725TCTCGATTTT-4.17
ceh-48MA0921.1chrI:13267998-13268006TTCGATAG+3.36
ces-2MA0922.1chrI:13267673-13267681TACCGTAA+3.01
daf-12MA0538.1chrI:13267685-13267699GTGCAAGCGCGCTC-4.42
dsc-1MA0919.1chrI:13267603-13267612TTAATTATT+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:13267603-13267612TTAATTATT-3.33
efl-1MA0541.1chrI:13267651-13267665ATTTCGCGTGAAAT-4.26
elt-3MA0542.1chrI:13267888-13267895TTTATCG+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:13267862-13267869TGTTTAC-4.66
hlh-1MA0545.1chrI:13268005-13268015GCAAATGTTG-3.25
lim-4MA0923.1chrI:13267604-13267612TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrI:13267603-13267611TTAATTAT+3
mab-3MA0262.1chrI:13268009-13268021ATGTTGAAAAAC+3.6
pal-1MA0924.1chrI:13267833-13267840TTATTTC-3.12
pal-1MA0924.1chrI:13267760-13267767TTATTAT-3.36
pal-1MA0924.1chrI:13267604-13267611TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:13267879-13267888AAGTAAACT+3.19
skn-1MA0547.1chrI:13268007-13268021AAATGTTGAAAAAC+4.32
sma-4MA0925.1chrI:13267768-13267778TACAGAAAGC-3.06
vab-7MA0927.1chrI:13268037-13268044TCATTAT-3.35
vab-7MA0927.1chrI:13267905-13267912TCATTAT-3
vab-7MA0927.1chrI:13267604-13267611TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:13267603-13267613TTAATTATTT-3.54
zfh-2MA0928.1chrI:13267602-13267612TTTAATTATT+3.72
Enhancer Sequence
TTTAAAACTT TTTTAAAGCA ATAATAATCC CAATATTTAA TTATTTTTTC CAAATTTCAT 60
CTTGAAAACT CGAATAATCG CGAAATTTCG CGTGAAATTC ATTTAATACC GTAAAAGTGT 120
GCAAGCGCGC TCCGTTGGAC TTTTCAATTC TCGATTTTCA CAACTCTCCC GATTTGGGGC 180
GCTGTGCGAA AAGTTATTAT CTACAGAAAG CAGTGATACT TTTTCAGAAG AAAAGTTACA 240
GATTTCCAGA GGTTTTGGGC AGAATTTTAT TTCAGATTCT GGTAGCTGAT CACATTGTTT 300
ACCCCTACAA AAAAGTAAAC TTTTATCGTA CAGGCAAGTC ATTATACAGT GCGTCCAACT 360
TCTATAGCAC CCCCCTCCAA TTTGGCGGTT TGGAGCTTCT CAAAATATTT TTTGAAAAAG 420
TGCTAGTGCA GTTCGATAGC AAATGTTGAA AAACCTATGC TCCCCAATTT TCATTATGAT 480
ATCTCAAAAA TCACAGGAAT TAGGTCAAAA TATCGGAAAA ATGGCCGTCC AACTTCTATA 540
GCACCCC 547