EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01780 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:13259777-13260844 
TF binding sites/motifs
Number: 52             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13260178-13260188GAGAAGAAGA+3.06
blmp-1MA0537.1chrI:13260262-13260272AAGAGGAGAT+3.18
blmp-1MA0537.1chrI:13259992-13260002TATCCTTTTC-3.31
blmp-1MA0537.1chrI:13259843-13259853GAATAGAAAC+3.39
blmp-1MA0537.1chrI:13260162-13260172GAAAAGATAG+3.45
blmp-1MA0537.1chrI:13260359-13260369AAAATGAATG+3.56
blmp-1MA0537.1chrI:13260056-13260066TCTCATTTTC-4.86
ceh-22MA0264.1chrI:13260127-13260137TTCGAGTGTA-3.47
ceh-22MA0264.1chrI:13260089-13260099CCACTTGAGA+5.26
ceh-48MA0921.1chrI:13260430-13260438AATCGATA-3.06
ceh-48MA0921.1chrI:13260545-13260553TATTGAAC-3.13
ceh-48MA0921.1chrI:13260431-13260439ATCGATAG+4.44
che-1MA0260.1chrI:13260600-13260605AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrI:13259897-13259902GTTTC-3.36
dsc-1MA0919.1chrI:13259952-13259961ATAATTGGC+3.12
dsc-1MA0919.1chrI:13260674-13260683CTAATTGTT+3.12
dsc-1MA0919.1chrI:13259952-13259961ATAATTGGC-3.12
dsc-1MA0919.1chrI:13260674-13260683CTAATTGTT-3.12
efl-1MA0541.1chrI:13260800-13260814GTTTCCCGTCAAAA-3.67
elt-3MA0542.1chrI:13260833-13260840GATACAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:13260019-13260026GATAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:13260779-13260786GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:13260436-13260450TAGAGTGTGAGAGG+3.52
eor-1MA0543.1chrI:13260780-13260794AAAAAACATAGAAA+3.7
fkh-2MA0920.1chrI:13260746-13260753TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:13260619-13260626TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:13260679-13260686TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:13260772-13260779TAAACAT+4.05
hlh-1MA0545.1chrI:13260229-13260239TCAACTGTTG-5.11
lim-4MA0923.1chrI:13260675-13260683TAATTGTT-3.2
lim-4MA0923.1chrI:13259953-13259961TAATTGGC-3.37
lin-14MA0261.1chrI:13259853-13259858TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrI:13260403-13260408AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:13260550-13260555AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrI:13260716-13260723CAATAAC+3.24
pal-1MA0924.1chrI:13259792-13259799TCATAAA+3.29
pal-1MA0924.1chrI:13260763-13260770TTATGGC-3.32
pha-4MA0546.1chrI:13259881-13259890ATGCAAAAA+3.15
pha-4MA0546.1chrI:13260257-13260266AAGTAAAGA+3.15
pha-4MA0546.1chrI:13259970-13259979GAGCACACA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:13259957-13259966TGGCAAACA+3.4
pha-4MA0546.1chrI:13260301-13260310GAACAAATA+3.66
skn-1MA0547.1chrI:13260518-13260532AATTGTAGAAAAAT+3.64
sma-4MA0925.1chrI:13260167-13260177GATAGACATC-3.21
sma-4MA0925.1chrI:13259914-13259924ACCAGACAGC-4.33
unc-62MA0918.1chrI:13260245-13260256TGTGACAACAA-3.03
unc-62MA0918.1chrI:13259915-13259926CCAGACAGCGT-3.12
unc-62MA0918.1chrI:13260365-13260376AATGACAGGAG-3.99
unc-62MA0918.1chrI:13260234-13260245TGTTGTCACAA+3
vab-7MA0927.1chrI:13259953-13259960TAATTGG-3.03
vab-7MA0927.1chrI:13260279-13260286TCATGAG-3.29
zfh-2MA0928.1chrI:13259951-13259961AATAATTGGC+3.07
Enhancer Sequence
GTGGCTTTTT CCCGATCATA AACCAACTCT GGACGATCAA CTTCCACAAA TCTGCGAGTT 60
TTGAAAGAAT AGAAACTGTT CCATCTTGTT CGACATCGAG TTGAATGCAA AAATCACACG 120
GTTTCCAATC TCTTCACACC AGACAGCGTA GTCAGGAAAG AGGCCCTTCT CGGCAATAAT 180
TGGCAAACAT GGAGAGCACA CATGAGGTAC AAAGGTATCC TTTTCAGCGC AGAACTCAAA 240
TGGATAAGAA CGACCATCCG GATGAGCTAC ACGAATGGTT CTCATTTTCA GTGATGAGCA 300
TTTGCAAACG GTCCACTTGA GACTACGATC TTTTTGTTGA GATCCGGGAA TTCGAGTGTA 360
CGGAAGCTTG AAAGCAGAGG CAGTGGAAAA GATAGACATC GGAGAAGAAG ATCTGCTAGA 420
GGTATCCATG GTATCTGAAA TTGAACAATT TGTCAACTGT TGTCACAATG TGACAACAAT 480
AAGTAAAGAG GAGATGCAAA ATTCATGAGC CAAAAAATAA CTGTGAACAA ATAGGAGAGC 540
GAGCTAAACA ACAACTAACC TGCTCCAAGC AAACCTGCAA AAAAAATGAA TGACAGGAGA 600
GTGTATTGCA ACGTGTATGA CGTTAGAACG CTGTGCAAGG CCGTGCAGAA AGTAATCGAT 660
AGAGTGTGAG AGGTATCGGG AAGATGTGGT GACCCTAGAG GAGAGTGGCA TCTTACTGGG 720
GCAATGCAAG TAGTGTCGGC AAATTGTAGA AAAATGACGT CACAACTGTA TTGAACACTA 780
ATAGTCCCAT AAAAGAATTT AGGGTTTTAT GGATTCAAGG TAGAAGCGAC TCAAATTGAG 840
CATTTTTATG AGCTTTCCAA CAACCATGGT ACATTTATCT TGTAAGCTTG AAAATTGCTA 900
ATTGTTTTTT TTTAATCTCC TACAGCGAAC TGAAACTTAC AATAACAGCT GAAATCTTGT 960
CGGGGTTTAT AAAAATCAGG TTCAGGTTAT GGCTGTAAAC ATGAAAAAAC ATAGAAACAT 1020
CTAGTTTCCC GTCAAAAAAA TGTTTCTCCC TGAAATGATA CAAAGAA 1067