EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01767 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:13119576-13120643 
TF binding sites/motifs
Number: 51             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13119739-13119749CATCATTTCC-3.12
blmp-1MA0537.1chrI:13120618-13120628TTTCACTTAT-3.13
blmp-1MA0537.1chrI:13119727-13119737CTTCTCCCTT-3.29
blmp-1MA0537.1chrI:13120074-13120084TTTCGTTCCT-3.45
blmp-1MA0537.1chrI:13119842-13119852TCTCTCTTAT-3.4
blmp-1MA0537.1chrI:13119840-13119850CCTCTCTCTT-3.78
blmp-1MA0537.1chrI:13120101-13120111TTTCGCTCTT-4.28
blmp-1MA0537.1chrI:13119855-13119865TCTCAATTTT-4.6
ces-2MA0922.1chrI:13119969-13119977TATAAAAT-3.12
che-1MA0260.1chrI:13120537-13120542AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:13120068-13120073GCTTC-3.2
che-1MA0260.1chrI:13119769-13119774GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:13120302-13120307AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrI:13120355-13120360AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrI:13119887-13119892GCTTC-3.7
dpy-27MA0540.1chrI:13120266-13120281TTATGCCCAGTGACA-4.01
efl-1MA0541.1chrI:13119641-13119655TCTTTCCGCGCTTT-3.75
elt-3MA0542.1chrI:13120568-13120575GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:13120367-13120374TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrI:13120096-13120110GTCTTTTTCGCTCT-3.1
eor-1MA0543.1chrI:13119707-13119721TTCCGCATTTCTTG-3.31
eor-1MA0543.1chrI:13120098-13120112CTTTTTCGCTCTTC-3.63
eor-1MA0543.1chrI:13119984-13119998CTTTCTCTATCTGC-3.66
eor-1MA0543.1chrI:13120169-13120183TTTTGCTTCTCGTT-3.76
eor-1MA0543.1chrI:13119982-13119996GTCTTTCTCTATCT-3.95
eor-1MA0543.1chrI:13119980-13119994CTGTCTTTCTCTAT-4
fkh-2MA0920.1chrI:13119686-13119693TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:13120338-13120345TAAAAAC+3.13
hlh-1MA0545.1chrI:13119902-13119912ACAATTGATG-3.15
hlh-1MA0545.1chrI:13119975-13119985ATCACCTGTC+3.19
hlh-1MA0545.1chrI:13119976-13119986TCACCTGTCT-3.38
hlh-1MA0545.1chrI:13119921-13119931GACAATTGTT+3.46
hlh-1MA0545.1chrI:13119901-13119911AACAATTGAT+4.02
hlh-1MA0545.1chrI:13119922-13119932ACAATTGTTT-4.24
lin-14MA0261.1chrI:13119999-13120004CGTTC-3.36
mab-3MA0262.1chrI:13120598-13120610TGTGGCAACAAT-3.91
pal-1MA0924.1chrI:13119931-13119938TTATTAT-3.63
pha-4MA0546.1chrI:13119791-13119800CTTTGCATT-3.15
pha-4MA0546.1chrI:13120232-13120241GTTTGTTTT-3.85
pha-4MA0546.1chrI:13120388-13120397GTTTGCACT-4.96
skn-1MA0547.1chrI:13119904-13119918AATTGATGATTTAC+4.02
skn-1MA0547.1chrI:13119734-13119748CTTGTCATCATTTC-6.06
sma-4MA0925.1chrI:13119917-13119927CCCAGACAAT-4.47
unc-62MA0918.1chrI:13119733-13119744CCTTGTCATCA+3.11
unc-62MA0918.1chrI:13120274-13120285AGTGACAACAT-3.19
unc-62MA0918.1chrI:13120591-13120602TATGACATGTG-4.07
unc-62MA0918.1chrI:13119978-13119989ACCTGTCTTTC+4.1
unc-86MA0926.1chrI:13119599-13119606TATGCGT+3.18
unc-86MA0926.1chrI:13119935-13119942TATTAAT+3.32
zfh-2MA0928.1chrI:13119936-13119946ATTAATTCTT+3.12
zfh-2MA0928.1chrI:13120487-13120497CAAATTAATA-3.47
Enhancer Sequence
CCATATGTAG TACCACGTGG ACATATGCGT TTTGGGAAGA AGCTATGTAG GTTCAACTCA 60
CCTCCTCTTT CCGCGCTTTG ACGTTTGAAA ATATGCTCTC CTCGATGCGA TTTTTATTCT 120
GCTCGGTCTG TTTCCGCATT TCTTGATCAA TCTTCTCCCT TGTCATCATT TCCTTATTAT 180
CCGCATCTTT TTGGTTTCTC AATGCCTCAT CTGATCTTTG CATTGCTTCG TAATATTCTT 240
TTTGATGTGA TTTGACGAGT TCATCCTCTC TCTTATTGTT CTCAATTTTT GTCTCATGTA 300
ACTGTTTCAC GGCTTCCTGA ACTTGAACAA TTGATGATTT ACCCAGACAA TTGTTTTATT 360
ATTAATTCTT ACTGATTTTG CACATATCTT ACTTATAAAA TCACCTGTCT TTCTCTATCT 420
GCGCGTTCTT CCTCGGCTCT TCTCTGCGAT AGTTCGGAGC TTCTCAAGTC ACTCATACGC 480
TCACGATAGT ACGCTTCTTT TCGTTCCTGA GCCTCATATC GTCTTTTTCG CTCTTCATAC 540
TCCCGTTGTG CTTGTGCTTG TGCTTCCTGT TGAGCTTATG CTTCCCGTTT AGCTTTTGCT 600
TCTCGTTGAG CTTGGATCTC CCGGTTTTTT TGTATTCTCC TATCCTGAAA TAACTTGTTT 660
GTTTTGAAAA TAAAGAGGTA ATCCCATACC TTATGCCCAG TGACAACATT GACCATATCC 720
TCTAAGAAGC CCAGCATTCC GAAGCAATCT GAAACTGTAA AATAAAAACC GACATCGTGA 780
AGCCTACAAT TTTTTTCAAT TTAACAAAAC ATGTTTGCAC TACGATACTG TACGATTCCG 840
GTAGGGCCGG TAGAACTTAT AGTTTGCTAG TGGACTTCAG ATAATGCATG AAAAGTGAAC 900
TTGTGTATTT TCAAATTAAT AGTAAGTATC TATAATGCAC ACCTGAACTC AAATATATAT 960
GAAACGTTTA GGTGTTAGCA ATATACGCGT ATGAGAAAAG TTGATGCCTC TTCCTTATGA 1020
CATGTGGCAA CAATTTATAC AGTTTCACTT ATTATAAGGA ATTCACG 1067