EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01765 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:13089007-13089809 
TF binding sites/motifs
Number: 56             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13089564-13089574GAAGGGATAT+3.11
blmp-1MA0537.1chrI:13089142-13089152TTTCAACCTT-3.45
blmp-1MA0537.1chrI:13089185-13089195TTTCATTTCT-3.48
blmp-1MA0537.1chrI:13089190-13089200TTTCTATTTT-3.8
blmp-1MA0537.1chrI:13089292-13089302TTTCCTTCTT-4.1
ceh-22MA0264.1chrI:13089215-13089225TTCAAGTGTC-4.66
ceh-48MA0921.1chrI:13089713-13089721ACCAATAT+3.07
ces-2MA0922.1chrI:13089685-13089693CTACACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:13089623-13089631TGTGTCAT-3.06
ces-2MA0922.1chrI:13089360-13089368TTATGAAA+3.25
ces-2MA0922.1chrI:13089649-13089657TTTCATAA+3.43
ces-2MA0922.1chrI:13089414-13089422TTACATAG+3.78
che-1MA0260.1chrI:13089394-13089399GCTTC-3.2
dsc-1MA0919.1chrI:13089236-13089245ATAATTAAA+3.05
dsc-1MA0919.1chrI:13089236-13089245ATAATTAAA-3.05
elt-3MA0542.1chrI:13089248-13089255GATAAAC-3.21
elt-3MA0542.1chrI:13089734-13089741TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrI:13089224-13089231CTTTTCA+3.31
elt-3MA0542.1chrI:13089212-13089219TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:13089476-13089483CTTATCA+4.05
eor-1MA0543.1chrI:13089291-13089305TTTTCCTTCTTTAA-3.55
eor-1MA0543.1chrI:13089009-13089023TTTTCAGTTTCTTC-3.64
fkh-2MA0920.1chrI:13089397-13089404TCAACAA+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:13089201-13089208TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:13089209-13089216TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:13089172-13089179TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:13089465-13089472TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:13089507-13089514TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrI:13089283-13089290TGTTTAC-4.05
fkh-2MA0920.1chrI:13089708-13089715TGTTTAC-4.05
hlh-1MA0545.1chrI:13089695-13089705ACCAGATGGT+3.24
lim-4MA0923.1chrI:13089057-13089065TAATTGAC-3.03
lim-4MA0923.1chrI:13089512-13089520ACAATTAG+3.06
lim-4MA0923.1chrI:13089236-13089244ATAATTAA+3.37
lim-4MA0923.1chrI:13089237-13089245TAATTAAA-3
pal-1MA0924.1chrI:13089376-13089383GAATAAA+3.15
pal-1MA0924.1chrI:13089627-13089634TCATAAC+3.4
pal-1MA0924.1chrI:13089237-13089244TAATTAA+3.54
pal-1MA0924.1chrI:13089175-13089182TTATTGC-4.12
pha-4MA0546.1chrI:13089263-13089272GTTTGCTGA-3.18
pha-4MA0546.1chrI:13089490-13089499CTTTACACT-3.22
pha-4MA0546.1chrI:13089630-13089639TAACCAACA+3.28
pha-4MA0546.1chrI:13089792-13089801TAACAAACA+3.34
pha-4MA0546.1chrI:13089709-13089718GTTTACCAA-3.42
pha-4MA0546.1chrI:13089206-13089215ATTTGTTTT-3.73
pha-4MA0546.1chrI:13089749-13089758GTTTGTACT-3.8
pha-4MA0546.1chrI:13089284-13089293GTTTACTTT-5.52
unc-62MA0918.1chrI:13089368-13089379GAAGACAGGAA-3.07
unc-62MA0918.1chrI:13089403-13089414AATTACAACTA-3.13
unc-62MA0918.1chrI:13089770-13089781GATGACAGATT-3.63
unc-86MA0926.1chrI:13089786-13089793TCTGCAT+3.18
unc-86MA0926.1chrI:13089603-13089610TATTCAT+3.68
vab-7MA0927.1chrI:13089057-13089064TAATTGA+3.15
vab-7MA0927.1chrI:13089237-13089244TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:13089235-13089245TATAATTAAA+3.29
zfh-2MA0928.1chrI:13089236-13089246ATAATTAAAA-3.64
Enhancer Sequence
CTTTTTCAGT TTCTTCCTGT GCTTTTCCTA TTTTTTCTAA ACAATCTTCA TAATTGACTC 60
CAAGTACTTT TTTAACTTCT TCCACTGCTT CTTTAACTTT TTCTAAGTAA TATTTGTAGC 120
TCAATCCGAT TGCCTTTTCA ACCTTTACTA TTGCTTCCTT AACTTTTTTT ATTGCCGATT 180
TCATTTCTAT TTTATTTTTA TTTGTTTTTT CAAGTGTCTT TTCAAATTTA TAATTAAAAC 240
TGATAAACTT TTCTATGTTT GCTGAAATAC AAGAAATGTT TACTTTTTCC TTCTTTAACA 300
TTTCAGAAGA TTTTCCATCA CTGAAAATCA AATGAGAGTC ATATCCTCTT AGATTATGAA 360
AGAAGACAGG AATAAAATTA TTTCTTCGCT TCAACAAATT ACAACTATTA CATAGAGGTC 420
CTCTGAATTC TCCGGTCCAA TGATCATGAT CCATAACTTT TTTATTTTCC TTATCAAATC 480
CCTCTTTACA CTCAGGACAT TTTTTACAAT TAGAATATTC AATCTGCTCT TCCTCAGTCA 540
ACCCACCCAT TTTCATGGAA GGGATATCCA GAACTCTTGT ACACACATCT TTAATGTATT 600
CATTGAATTT TAATATTGTG TCATAACCAA CATAACTTTT CATTTCATAA ATACTCTGTG 660
TAAAAGAATC CACCACAACT ACACAAAAAC CAGATGGTGC ATGTTTACCA ATATTCTCAC 720
TCCATGATTT ATCAGGTGAA TTGTTTGTAC TATCTAGTTT ATAGATGACA GATTCAAAAT 780
CTGCATAACA AACATATCTG TG 802