EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01756 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:13040092-13041235 
TF binding sites/motifs
Number: 53             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13040690-13040700TCTCTATCCC-3.41
blmp-1MA0537.1chrI:13040694-13040704TATCCCTCTC-3.66
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:13040486-13040499ATATTAAGCCAAT-3.82
ceh-48MA0921.1chrI:13040493-13040501GCCAATAT+3.16
ces-2MA0922.1chrI:13040995-13041003TATGAAAT-3.43
ces-2MA0922.1chrI:13040879-13040887TTTGTAAT-3.45
ces-2MA0922.1chrI:13041190-13041198TATGTAAT-3.64
che-1MA0260.1chrI:13041060-13041065AAACC+3.36
daf-12MA0538.1chrI:13040789-13040803GCGCACACATTTTC-3.27
daf-12MA0538.1chrI:13040767-13040781ATACACACACATGT-3.31
daf-12MA0538.1chrI:13040765-13040779ACATACACACACAT-3.38
daf-12MA0538.1chrI:13040763-13040777ATACATACACACAC-3.78
daf-12MA0538.1chrI:13041061-13041075AACCAGTCACTCTG-3.86
efl-1MA0541.1chrI:13040784-13040798TTTTGGCGCACACA-4.18
elt-3MA0542.1chrI:13041024-13041031TTTACCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:13040128-13040135GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:13040287-13040294GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:13040318-13040325GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:13040382-13040389TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:13040362-13040369GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:13040693-13040707CTATCCCTCTCTCT-3.09
eor-1MA0543.1chrI:13040683-13040697CACCCCCTCTCTAT-3.28
eor-1MA0543.1chrI:13040662-13040676TCCTGCTTCTCTAA-3.44
eor-1MA0543.1chrI:13040540-13040554CTCGCCAACTCTCT-3.58
eor-1MA0543.1chrI:13040562-13040576CTCGCCAACTCTCT-3.58
eor-1MA0543.1chrI:13040572-13040586CTCTTCATTTCATA-3.64
eor-1MA0543.1chrI:13040695-13040709ATCCCTCTCTCTGT-3.6
eor-1MA0543.1chrI:13040550-13040564CTCTCTGCATCTCT-4.31
eor-1MA0543.1chrI:13040691-13040705CTCTATCCCTCTCT-4.77
eor-1MA0543.1chrI:13040552-13040566CTCTGCATCTCTCG-6.21
fkh-2MA0920.1chrI:13041143-13041150TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:13040369-13040376AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:13040421-13040428TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrI:13040919-13040926TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:13040939-13040946TTTTTAC-3.4
lim-4MA0923.1chrI:13040650-13040658TAATTGCA-3.51
mab-3MA0262.1chrI:13040242-13040254ATCTTGCCTATC+3.58
pha-4MA0546.1chrI:13041038-13041047GGTTGCACT-3.09
pha-4MA0546.1chrI:13040940-13040949TTTTACTTA-3.15
pha-4MA0546.1chrI:13040845-13040854GATTGCTCT-3.16
pha-4MA0546.1chrI:13040521-13040530ATACCAACA+3.38
pha-4MA0546.1chrI:13040491-13040500AAGCCAATA+3.93
skn-1MA0547.1chrI:13040409-13040423AAATGCTGAATTTG+4.31
sma-4MA0925.1chrI:13041062-13041072ACCAGTCACT-3.54
unc-62MA0918.1chrI:13040775-13040786ACATGTCTCTT+3.6
unc-86MA0926.1chrI:13040483-13040490TGCATAT-3.27
unc-86MA0926.1chrI:13040641-13040648TATGCAT+4.66
vab-7MA0927.1chrI:13040286-13040293TGATTAA+3.27
vab-7MA0927.1chrI:13040650-13040657TAATTGC+3.38
zfh-2MA0928.1chrI:13041155-13041165TTTAATTTAC+3.05
zfh-2MA0928.1chrI:13040977-13040987ATTAATTTTC+3.12
zfh-2MA0928.1chrI:13041145-13041155AAAATTAACT-3.14
zfh-2MA0928.1chrI:13040974-13040984AAAATTAATT-3.16
Enhancer Sequence
TTTTTCCAAA AAAAAAGGTT CTTAAAAATG TAACTTGATT AAAAAAAATT GTTAAATCAA 60
AATTGGTTAG CTGACATTGA AAAACACCAA AATTCGGTAA AGGCTAAACG ACAACAACGA 120
TTACAACCCT ACCTACCTAC TATACCTACA ATCTTGCCTA TCCCTAGAAC CTGGCCTCAT 180
CCTAGATGAT TTACTGATTA AAAAAACAGT TTCGACTCAG AAACTTGTTA AAAATCTTAG 240
TTTAGGTCTA GTTCAAGATT TGTGAAATTT GAAAAAAAAA ACAAAACAAT TTTTTCAAAA 300
AAAAAATTGT TCTCGAAAAA TGCTGAATTT GTTTTCTAAA ATAATTTTTT TTTTGAAAAT 360
AAATTTGCTG ATTCAAGCTT CATATACTGA CTGCATATTA AGCCAATATC CCATTTTCAA 420
AAAAAAACCA TACCAACACC CTACATCTCT CGCCAACTCT CTCTGCATCT CTCGCCAACT 480
CTCTTCATTT CATACACTAT CTCATCTCTC TGTTAGCCTC TGGACCTCTG GGGAACGAAT 540
GGGTCGGCAT ATGCATTCTA ATTGCATTCG TCCTGCTTCT CTAACCTCCC TCACCCCCTC 600
TCTATCCCTC TCTCTGTGAA GCTTCACCCA TTCTGCCATT CGGACCTCAT TTTGTTGTGC 660
TCGGCACATA CATACATACA CACACATGTC TCTTTTGGCG CACACATTTT CATGTTTGTT 720
GCACTTTTTT GGAAGCTTGA ACCGACCAGC TATGATTGCT CTAGCCTTCT TTATGTCTAC 780
CTAAATTTTT GTAATTTGTA GTCTGCTAGG CTGTATCGTT TAGGATTTTT TTATTCAGGA 840
TGTAATTTTT TTACTTATGT ACAGAAGTAC ATATTAAGTC TAAAAATTAA TTTTCTGAGA 900
TTTTATGAAA TTTGAATTTC GAATCTAAAA ATTTTACCAA TTTTTTGGTT GCACTTTTTG 960
GGAGCTTGAA ACCAGTCACT CTGAGCCTCA ATAAACTTTT GTAGTTTGTA GTCTATCAGG 1020
CTCTACCGTA TATTATTTTT TGAACGAAAT ATAAAAATTA ACTTTTAATT TACTCCAAGT 1080
TTAAAGCTTG AATCTAGATA TGTAATAATT TTTTTTGGAA AATTCGAAAA AAATTTCCTA 1140
TTT 1143