EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01604 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:12005052-12006443 
TF binding sites/motifs
Number: 60             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:12005742-12005752TTTCGTCTTC-3.16
blmp-1MA0537.1chrI:12005726-12005736ATTCATTTCT-3.17
blmp-1MA0537.1chrI:12006236-12006246TTTCTATTTT-4.67
ceh-48MA0921.1chrI:12005605-12005613ATCGATTA+3.06
ceh-48MA0921.1chrI:12005221-12005229TATCGAGA-3.06
ceh-48MA0921.1chrI:12006090-12006098TATCGAAA-3.29
ceh-48MA0921.1chrI:12005604-12005612TATCGATT-5.22
ces-2MA0922.1chrI:12005299-12005307TTATGAAA+3.25
ces-2MA0922.1chrI:12005542-12005550TGTGTTAT-4.02
dsc-1MA0919.1chrI:12005115-12005124TTAATTATT+3.67
dsc-1MA0919.1chrI:12005115-12005124TTAATTATT-3.67
efl-1MA0541.1chrI:12005965-12005979AATTTCCGTGGATA-3.15
efl-1MA0541.1chrI:12005368-12005382ATTTTCCGTCCGAA-3.38
efl-1MA0541.1chrI:12005127-12005141GAGAACGCCAAAAT+3.47
elt-3MA0542.1chrI:12005411-12005418GATGAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:12005219-12005226TTTATCG+3.07
elt-3MA0542.1chrI:12005819-12005826GATAAAC-3.21
elt-3MA0542.1chrI:12005748-12005755CTTCTCA+3.35
elt-3MA0542.1chrI:12005915-12005922CCTATCA+3.35
elt-3MA0542.1chrI:12006088-12006095CTTATCG+3.45
elt-3MA0542.1chrI:12005563-12005570GATCAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrI:12006007-12006014GATAAGT-3.75
elt-3MA0542.1chrI:12005843-12005850GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:12005960-12005967GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:12005925-12005939ATCTCAGTCACTTC-3.35
fkh-2MA0920.1chrI:12005069-12005076TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrI:12006343-12006350TATACAT+3.12
lim-4MA0923.1chrI:12005115-12005123TTAATTAT+3.24
lim-4MA0923.1chrI:12005116-12005124TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrI:12006379-12006387ATAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrI:12005335-12005340AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:12005911-12005916TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:12006084-12006089TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:12005130-12005135AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:12005671-12005676TGTTC-3.62
lin-14MA0261.1chrI:12005944-12005949TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrI:12005116-12005123TAATTAT-3.54
pal-1MA0924.1chrI:12005596-12005603TCATTGC-3
pha-4MA0546.1chrI:12005200-12005209AAGTAAATT+3.02
pha-4MA0546.1chrI:12006147-12006156ATGTGAACA+3.04
pha-4MA0546.1chrI:12006432-12006441ATTTTCACT-3.11
pha-4MA0546.1chrI:12005866-12005875GTGGAAACA+3.25
pha-4MA0546.1chrI:12005078-12005087GTTCGCTTT-3.2
skn-1MA0547.1chrI:12005836-12005850AGATGTTGAAAAAA+4.64
sma-4MA0925.1chrI:12006059-12006069TCGTCTGGTA+3.1
unc-62MA0918.1chrI:12005444-12005455GTTGACATTTC-3.6
unc-62MA0918.1chrI:12005824-12005835ACCGACAGCTC-3.82
unc-62MA0918.1chrI:12005279-12005290AGATGTCATTC+4.49
unc-86MA0926.1chrI:12006343-12006350TATACAT+3.07
vab-7MA0927.1chrI:12005406-12005413TCATTGA+3.09
vab-7MA0927.1chrI:12006380-12006387TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrI:12006380-12006387TAATTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrI:12006427-12006434TCATTAT-3.35
vab-7MA0927.1chrI:12005116-12005123TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:12005762-12005772CAAATTATTC-3.06
zfh-2MA0928.1chrI:12006282-12006292TTTAATTTAT+3.14
zfh-2MA0928.1chrI:12006379-12006389ATAATTATAT-3.26
zfh-2MA0928.1chrI:12006378-12006388CATAATTATA+3.27
zfh-2MA0928.1chrI:12005115-12005125TTAATTATTG-3.47
zfh-2MA0928.1chrI:12005114-12005124GTTAATTATT+4.03
Enhancer Sequence
TTCGTATTTT TTTAATATGT TTTCTTGTTC GCTTTTCTTA AAAGGGTTTT TCTCTGAAAA 60
TAGTTAATTA TTGCAGAGAA CGCCAAAATG ACGAGCCAGA GCAAGCTGAT CACCGATGGA 120
GCAGCAATGG ACGAAACAAC GGAAAAAAAA GTAAATTGAA TTTAAATTTT ATCGAGATTA 180
ACTATTCTTT CAAATTTCAG GCCGAAGGAA TTTGTCGATT TGCCGGTAGA TGTCATTCAA 240
AACATTATTA TGAAAGTGGA TCCGCACGAT AGGTAGGATA CAGAACAGTA TTAAAAAAAT 300
ATTCTGATTT TTGCAGATTT TCCGTCCGAA AAGTCAATCG AAATCTTCGC CAACTCATTG 360
ATGAAATGAA CCCTGGATTT AGAACTATTT CAGTTGACAT TTCTACGAGA AACTAAGTTT 420
TTGTTCGTAT ATCAATGGAC GTTGTGGTTG TGGAACCAGT GTTGTTCACT ACAAGCAAAT 480
GGGCAACGAT TGTGTTATTT TGTATGAAGA TGATCAGAGT CATGAGCCTT CCCAAAGCAC 540
AACTTCATTG CTTATCGATT ACCATTCCAA CAAAGGATCA TATGAAAAAG GGTCGATGCG 600
AGGAAAGAGT ATTGAGCCGT GTTCAGGACA TGGTAGATAT GCTCAGCTCA TCCAAATTTC 660
CGAATGTCAA AATCATTCAT TTCTTTAAAA TTTCGTCTTC TCAAATAGCT CAAATTATTC 720
CGAGCTTCAA GGCTGGAAAT CTGGAAGAGC TACATCTCAA CACATCTGAT AAACCGACAG 780
CTCAAGATGT TGAAAAAATC TGCAATTCAG ATCAGTGGAA ACATGCAAAA GAGTTTGACG 840
GAAATTGTGA TTTTACGGAT GTTCCTATCA AACATCTCAG TCACTTCTCT CGTGTTCGTG 900
CCCCTTATGA AAAAATTTCC GTGGATACCG CTGTTGAAAT TAGAAATGTT AGTTTGATAA 960
GTCTAATTTC GCTAAATTAC ACTTTAATAT TATTTCAGGT TTTGCTGTCG TCTGGTAACA 1020
TCGAGCGTGC AATGTTCTTA TCGAAAAGTG ACTTCGGCGT CGATGTTGTT CGCGTTTTTG 1080
ATCCGGAAGC AGCCTATGTG AACAAAAATA CGATTTTCCA TGATGGTGCT GGCGTTTTCA 1140
TTCAAGTCCC TGCCGATGTG GACCGAAATA CGGATTACAA TGGTTTTCTA TTTTCGAACG 1200
ACAAAGATAC TATCAAATTC GAGAAGAAAA TTTAATTTAT AATCGGATTA CTCGATTTGT 1260
CTTGTGCTTC AGTCCCCCGA TATACTCTAA ATATACATTT CAATATTATT CCCCATCCTC 1320
CTGTGTCATA ATTATATTTC TTTAAGTTTT ATTAGATCCC GTAGAATTTC CCATTTCATT 1380
ATTTTCACTT T 1391