EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01468 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:11135873-11136475 
TF binding sites/motifs
Number: 33             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:11135901-11135911GAATAGATGG+3.01
blmp-1MA0537.1chrI:11136352-11136362AAAAGGAGTG+3.34
blmp-1MA0537.1chrI:11136443-11136453GAATGGAGAA+3.67
ceh-48MA0921.1chrI:11136320-11136328GCCGATAC+3.56
daf-12MA0538.1chrI:11136370-11136384ATACACATACATAT-3.16
daf-12MA0538.1chrI:11136248-11136262GAGCAAATGCTCTC-3.1
daf-12MA0538.1chrI:11136366-11136380ATACATACACATAC-3.54
dsc-1MA0919.1chrI:11136310-11136319GTAATTACC+3.44
dsc-1MA0919.1chrI:11136310-11136319GTAATTACC-3.44
eor-1MA0543.1chrI:11135950-11135964CGGAGAAAACGACA+3.51
eor-1MA0543.1chrI:11136290-11136304CTCCTCCTCTCAGG-3.54
eor-1MA0543.1chrI:11136461-11136475GAGAGGGTTAGAGA+4.21
eor-1MA0543.1chrI:11136288-11136302GTCTCCTCCTCTCA-5.12
hlh-1MA0545.1chrI:11136249-11136259AGCAAATGCT+3.39
hlh-1MA0545.1chrI:11136428-11136438GCAGGTGCTC-3.64
hlh-1MA0545.1chrI:11136427-11136437AGCAGGTGCT+3.66
lim-4MA0923.1chrI:11136454-11136462GTAATGAG+3.05
lim-4MA0923.1chrI:11136310-11136318GTAATTAC+3.22
lim-4MA0923.1chrI:11136311-11136319TAATTACC-3.33
pal-1MA0924.1chrI:11136346-11136353AAATTAA+3.07
pal-1MA0924.1chrI:11136311-11136318TAATTAC+3.85
pal-1MA0924.1chrI:11136311-11136318TAATTAC-3.85
pal-1MA0924.1chrI:11136115-11136122TAATACA+3
pha-4MA0546.1chrI:11136068-11136077GTTAGCTTT-3.19
unc-62MA0918.1chrI:11136334-11136345CAAGACAGGGG-3.19
unc-62MA0918.1chrI:11136284-11136295ACCTGTCTCCT+3.89
unc-86MA0926.1chrI:11136381-11136388TATGTAT+3.06
unc-86MA0926.1chrI:11136377-11136384TACATAT-3.06
vab-7MA0927.1chrI:11136311-11136318TAATTAC+3.54
vab-7MA0927.1chrI:11136311-11136318TAATTAC-3.54
vab-7MA0927.1chrI:11136455-11136462TAATGAG-3.54
zfh-2MA0928.1chrI:11136309-11136319CGTAATTACC+3.36
zfh-2MA0928.1chrI:11136310-11136320GTAATTACCA-3.42
Enhancer Sequence
AAGTCCATTT TTAAGGACAA AATGGGTGGA ATAGATGGCA GGGGGATGGC ATTGATGAAT 60
TGGGCTCTTA GAAGTTTCGG AGAAAACGAC AAAAAAAATT CGTCGAATTC GAAATTTGGT 120
GAGGCTCAGG GGCTACAAAC TACAAACTAC AAACTACAAA CTTTTGCACC AATCTTAAAA 180
CGAATAGTAA GTGTTGTTAG CTTTTAAAAA AACTGAAATG CTCTCGGGGC CAAAAAATCA 240
GGTAATACAA AACTTGGGAT TCCAGCAACT ATAAACTACA AACTACACAC TACACACTAC 300
AAACTACAAA CTACAAACTA CAAACTACAA ACTGTGTCAA CCTCAACCGA CTCCAAGATT 360
AGTAGACTTT TCTTGGAGCA AATGCTCTCG GAGCTAAGAA ATTCTCACCC CACCTGTCTC 420
CTCCTCTCAG GGGTACCGTA ATTACCAGCC GATACATTGT ACAAGACAGG GGGAAATTAA 480
AAAGGAGTGG CACATACATA CACATACATA TGTATGTCAA GAATGTTTTG GAGCATTCAC 540
AAAACATTGG AAAGAGCAGG TGCTCCTGGA GAATGGAGAA GGTAATGAGA GAGGGTTAGA 600
GA 602