EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01432 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:10930314-10931405 
TF binding sites/motifs
Number: 64             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:10930544-10930554TATCATTCCT-3.19
blmp-1MA0537.1chrI:10931353-10931363TATCCATTTT-3.19
blmp-1MA0537.1chrI:10930690-10930700AAAGTGATAG+4.36
blmp-1MA0537.1chrI:10930378-10930388TTTCCATTTC-4.42
blmp-1MA0537.1chrI:10930371-10930381TCTCACTTTT-5.47
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:10930771-10930784TAGGTTAAATTAT+3.99
ceh-22MA0264.1chrI:10931335-10931345GCCCTTAAAA+3
ceh-48MA0921.1chrI:10930653-10930661ATCGATAT+3.65
ceh-48MA0921.1chrI:10930652-10930660TATCGATA-3.65
ces-2MA0922.1chrI:10930739-10930747TAACGTAA+3.15
ces-2MA0922.1chrI:10930727-10930735TAGGTTAT-3.17
ces-2MA0922.1chrI:10930911-10930919TACATAAT-3.39
ces-2MA0922.1chrI:10930605-10930613TTATATAA+3.3
ces-2MA0922.1chrI:10930606-10930614TATATAAA-3.3
ces-2MA0922.1chrI:10930740-10930748AACGTAAT-3.46
ces-2MA0922.1chrI:10931322-10931330TTACCTAA+3.94
daf-12MA0538.1chrI:10930447-10930461TTTGTGTGTGTGTG+3.12
daf-12MA0538.1chrI:10930627-10930641GGTTTGTGTGGGCG+3.24
daf-12MA0538.1chrI:10930625-10930639AGGGTTTGTGTGGG+3.35
daf-12MA0538.1chrI:10930623-10930637TGAGGGTTTGTGTG+3.62
daf-12MA0538.1chrI:10930449-10930463TGTGTGTGTGTGTG+4.9
daf-12MA0538.1chrI:10930455-10930469TGTGTGTGTGTTTC+7.03
daf-12MA0538.1chrI:10930453-10930467TGTGTGTGTGTGTT+7.66
daf-12MA0538.1chrI:10930451-10930465TGTGTGTGTGTGTG+8.26
dsc-1MA0919.1chrI:10931318-10931327ATAATTACC+3.44
dsc-1MA0919.1chrI:10931318-10931327ATAATTACC-3.44
efl-1MA0541.1chrI:10931217-10931231AGTTGCCGCACACT-3.68
elt-3MA0542.1chrI:10930369-10930376TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:10930804-10930811TTTATCC+3.02
elt-3MA0542.1chrI:10931007-10931014GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:10930488-10930495CTTGTCA+3.45
elt-3MA0542.1chrI:10931303-10931310TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:10931105-10931112GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:10930869-10930883TTCTGTTTTTCGTG-3.45
eor-1MA0543.1chrI:10930458-10930472GTGTGTGTTTCCCA-3.57
fkh-2MA0920.1chrI:10930602-10930609TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrI:10930802-10930809TTTTTAT-3.3
hlh-1MA0545.1chrI:10931037-10931047CCAACTGCCG-4.02
lim-4MA0923.1chrI:10931319-10931327TAATTACC-3.55
lin-14MA0261.1chrI:10930573-10930578TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrI:10930790-10930795AACAT+3.14
pal-1MA0924.1chrI:10930987-10930994TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrI:10931319-10931326TAATTAC+3.33
pha-4MA0546.1chrI:10931147-10931156TTTTGCACA-3.05
pha-4MA0546.1chrI:10930367-10930376ATTTTCTCA-3.06
pha-4MA0546.1chrI:10930603-10930612ATTTATATA-3.64
pha-4MA0546.1chrI:10930963-10930972ATGCCAATA+3.97
pha-4MA0546.1chrI:10930497-10930506AAGCAAATA+4.37
skn-1MA0547.1chrI:10931047-10931061ATTATCAAGTTTTT-3.61
skn-1MA0547.1chrI:10931310-10931324AAACGGTGATAATT+4.7
unc-62MA0918.1chrI:10930506-10930517AGCGACATGTA-3.13
unc-62MA0918.1chrI:10930487-10930498TCTTGTCAGTA+3.14
unc-62MA0918.1chrI:10930510-10930521ACATGTAACTT+3.56
unc-86MA0926.1chrI:10930864-10930871TATGCTT+3.09
unc-86MA0926.1chrI:10931353-10931360TATCCAT+3.14
unc-86MA0926.1chrI:10930328-10930335TATGAAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:10931319-10931326TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrI:10931319-10931326TAATTAC+3.6
vab-7MA0927.1chrI:10930915-10930922TAATGAC+3
zfh-2MA0928.1chrI:10930985-10930995ATTAATTTCT+3.17
zfh-2MA0928.1chrI:10930849-10930859AGTAATTTGG+3.1
zfh-2MA0928.1chrI:10931378-10931388AGTAATTTGT+3.1
zfh-2MA0928.1chrI:10931317-10931327GATAATTACC+3.29
zfh-2MA0928.1chrI:10931318-10931328ATAATTACCT-3.37
Enhancer Sequence
CGTAAATCGA CACATATGAA TTTTGGAATT TTCTTGTGAT TTTCCTAGAA CCTATTTTCT 60
CACTTTTCCA TTTCAAAAAG TGACGAATCT CTATGGTAAA GGATCACTGC TGAGAATCAA 120
GGATCAATGA TGTTTTGTGT GTGTGTGTGT GTTTCCCAGG AACAAGAACG AGCTCTTGTC 180
AGTAAGCAAA TAAGCGACAT GTAACTTGAT ATATATCGTC TATATTCCAT TATCATTCCT 240
CTAACAATAG AATGTGTACT GTTCGAATTG GGAGATCACA ACACATTTTA TTTATATAAA 300
AAGGCGGTGT GAGGGTTTGT GTGGGCGATT TGATCGGATA TCGATATTTC GGAAATTTCC 360
GAAAATCTTG GCTTGGAAAG TGATAGGCTA TGATCCTTTG AACTTTTGAA CTTTAGGTTA 420
TCCACTAACG TAATTCACTA CCATCTCATT TCATACATAG GTTAAATTAT TTTTCGAACA 480
TTAGTATTTT TTTATCCGGT TTAGTTCTAA ATCCTGATTT TTTTGCCAAT TTTCTAGTAA 540
TTTGGAGCAA TATGCTTCTG TTTTTCGTGA GATCAGGACA ACTATTTTCG GCAACTCTAC 600
ATAATGACCC ATTGCACCAT GTTGCTCCAA CATTTTGCAT TAAAAAATAA TGCCAATAAA 660
TAGAAAATCG CATTAATTTC TGCTGAAACA TTTGAGAAAA TGCTCAAAAA TGGCTTGAAA 720
TTGCCAACTG CCGATTATCA AGTTTTTTGA CAATCGGTAG CTTTCCAGGC ACTTTCTCAA 780
ATTTTTCAGC TGAAAAAAAA ATTTATTCAG ATGAATCAGG TGATTTTCTA TATTTTTGCA 840
CAATGTTTTA ATGAAAACTG TTGGAAAAAC ATGGTGCAAT AAGCTATTTT TGAAGAACTT 900
CAGAGTTGCC GCACACTCCT GAAATAAGGA AAAGCAAGAG CAGTTTTTGA AGAACTTTTG 960
TGAAAAGTGT TGTATTTAGC GTCAATTTTT TTTTCAAAAC GGTGATAATT ACCTAAATTC 1020
AGCCCTTAAA ATTTTTCAAT ATCCATTTTA TTTTTCCGAG TCCGAGTAAT TTGTAGAATC 1080
TACGCATTTT T 1091