EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01423 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:10819591-10820992 
TF binding sites/motifs
Number: 54             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:10820301-10820311AAATCGAGAT+3.48
blmp-1MA0537.1chrI:10819936-10819946CTTCATTTTC-3.5
blmp-1MA0537.1chrI:10820504-10820514AAAATGAGGG+4.01
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:10819932-10819945TGGGCTTCATTTT+3.7
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:10820239-10820252AAATTGAACTAAT-4.52
ceh-22MA0264.1chrI:10820545-10820555CCACTTTTCA+3.05
ceh-48MA0921.1chrI:10820497-10820505TATCGAAA-3.07
ceh-48MA0921.1chrI:10820840-10820848ATCAATAA+3.36
ceh-48MA0921.1chrI:10820796-10820804TTCAATAA+3.49
ces-2MA0922.1chrI:10820215-10820223TTACAGAA+3.55
che-1MA0260.1chrI:10820424-10820429AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:10819728-10819733AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrI:10819935-10819940GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrI:10820876-10820890CAGCAGACACACTG-4.48
efl-1MA0541.1chrI:10820377-10820391ATTTGCCGTGTGTC-3.36
elt-3MA0542.1chrI:10819799-10819806GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:10820184-10820191GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:10820403-10820410GATAAAC-3.21
elt-3MA0542.1chrI:10820941-10820948GATAGGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:10820481-10820488TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:10820732-10820739GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:10820413-10820427TGAAAACACAGAAA+3.64
fkh-2MA0920.1chrI:10820415-10820422AAAACAC+3.08
fkh-2MA0920.1chrI:10819821-10819828TAAAAAA+3.3
hlh-1MA0545.1chrI:10820895-10820905ACATTTGTTG-3.74
hlh-1MA0545.1chrI:10820894-10820904AACATTTGTT+3
lim-4MA0923.1chrI:10819964-10819972TTAATCAA+3.03
mab-3MA0262.1chrI:10819615-10819627TTTTGCAGCATT-3.67
pal-1MA0924.1chrI:10819753-10819760CCATAAA+3.21
pal-1MA0924.1chrI:10819908-10819915TTATGGT-3.21
pal-1MA0924.1chrI:10820399-10820406TAATGAT-3.26
pal-1MA0924.1chrI:10820825-10820832TAATAAA+4.57
pha-4MA0546.1chrI:10820624-10820633GTGCAAAAA+3.05
pha-4MA0546.1chrI:10820593-10820602TTTTGCTCA-3.12
pha-4MA0546.1chrI:10820575-10820584AAACAAACA+3.85
skn-1MA0547.1chrI:10820736-10820750AAATGTAGATATCT+3.64
sma-4MA0925.1chrI:10820071-10820081ATCAGACAGA-3.02
sma-4MA0925.1chrI:10820419-10820429CACAGAAACC-3.03
sma-4MA0925.1chrI:10820862-10820872AGCAGACAGC-3.11
sma-4MA0925.1chrI:10820877-10820887AGCAGACACA-3.18
sma-4MA0925.1chrI:10820580-10820590AACAGACAAC-3.34
sma-4MA0925.1chrI:10820386-10820396GTGTCTATAG+3.36
sma-4MA0925.1chrI:10819777-10819787ATTTCTGGTA+3.38
sma-4MA0925.1chrI:10820856-10820866AGGTCTAGCA+3
sma-4MA0925.1chrI:10820075-10820085GACAGAAATT-3
unc-62MA0918.1chrI:10820831-10820842AACTGTAACAT+3.04
unc-62MA0918.1chrI:10820863-10820874GCAGACAGCAG-3.13
unc-62MA0918.1chrI:10820943-10820954TAGGACAGCTT-3.35
unc-62MA0918.1chrI:10820082-10820093ATTGACAGGAA-3.6
unc-86MA0926.1chrI:10820615-10820622TATGAAT+3.58
unc-86MA0926.1chrI:10819855-10819862TATGAAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:10820212-10820219TCATTAC+3.09
vab-7MA0927.1chrI:10820111-10820118TCATGAG-3.29
vab-7MA0927.1chrI:10820399-10820406TAATGAT-3.43
Enhancer Sequence
TCTGATTCCG TTCACAAATA GTCCTTTTGC AGCATTTTTA GTGCTGAGCT TTTAGCCTGT 60
TTTCAGTGTG CTTCTTGATT ATGAGCTCAT ATCTAAGCTA TTCCTTGACA CATTTTTTAG 120
AAAGTAGTCA GGGAATGAAG CCCACATTTT TCACTACAAG TACCATAAAC GTTGCTTGCT 180
CCAAAAATTT CTGGTATAGC CTACACGTGA GAAAAGTTTG CGATGGGTTA TAAAAAATCT 240
TGGAAATGTA CTGTGAATTG AGAATATGAA TTCCGTCAAT TGTAGGCTAT GCCAAAAATG 300
TTTGGTGCAA GCAACGTTTA TGGTACCTGT GGTGAAAAAT ATGGGCTTCA TTTTCTGACT 360
ACTTTCCAAA AGATTAATCA AGCCATAGCT TAGATATGGG ATCATAATCA AGAAGCACAC 420
TGAAAACTGG CCAAAAGCTC AGCACTAAAA ATGCTACAAA AAATACTATT TGTGAACGGA 480
ATCAGACAGA AATTGACAGG AATATTCTTG AATACGTTTT TCATGAGATA TTGTAAGCTC 540
AAGCTCATAA GTTACTTGTG AGCTTCACGT TGAGCTTCAA CGTCTAAAAA TGTGAGAAAA 600
TTGTTAAATT GAAGATTCCG ATCATTACAG AAGTTTGGAA AACAGAAAAA ATTGAACTAA 660
TAACCAGATT TAAAACAGTT TTTAATCTTA TTTTTCTGAA AATAGTCAAA AAATCGAGAT 720
TTTCAGTGAA AATTTTCGAA AATCCCAAGG GGTCCTATAG CAGTGACGCG GCCTAATTTT 780
TGAAATATTT GCCGTGTGTC TATAGTTTTA ATGATAAACT CGTGAAAACA CAGAAACCTA 840
GGGTTTTTTG ACATGCTGAA TCCGAATATC ACAAAAGTTT TTCATGGAAT TTTTTCAGTT 900
TCCCAATATC GAAAAAATGA GGGGGGTCCT ATAGCATTGA CGCGCACTGT ATAACCACTT 960
TTCAAAAAAA TATATTACCC TCTAAAACAA ACAGACAACA CTTTTTGCTC ACTTTTCGAG 1020
ACATTATGAA TGTGTGCAAA AAGAATTGTT AGTTTAAATC TTCTTTTGAC CCTTATCCAT 1080
GTTATCTCAA GTTACCACAG AAGTCATATG CTCTTGTAGA ATACAGTCCC CTGTACATTG 1140
TGAAAAAATG TAGATATCTT GATGTATCTT CCTAAGCTAC ACGATTGTTG GTTAACATTT 1200
TTCGATTCAA TAAATTTATC CTGCAGATTA AATGTAATAA AACTGTAACA TCAATAAAAA 1260
GCTTCAGGTC TAGCAGACAG CAGTTCAGCA GACACACTGA AATAACATTT GTTGTGCGAA 1320
AAAATCCCGA CTTTTTGTAG ATCAAACCGT GATAGGACAG CTTGACACCA CGTAGCATGT 1380
TTCGAAAATC TTAAACTTAA C 1401