EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01350 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:10288374-10289350 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:10288925-10288935AAGATGAATG+3.08
blmp-1MA0537.1chrI:10289335-10289345AGAAGGAAGC+3.12
blmp-1MA0537.1chrI:10288535-10288545AAATAGAAGC+3.38
blmp-1MA0537.1chrI:10289149-10289159AGAGTGAATA+3.45
blmp-1MA0537.1chrI:10288570-10288580AAAGAGAATG+3.74
ceh-22MA0264.1chrI:10288659-10288669ACACTTAAAC+3.54
ceh-22MA0264.1chrI:10288741-10288751TTCAAGTGCA-4.22
ceh-48MA0921.1chrI:10288527-10288535CTCAATAA+3.11
ceh-48MA0921.1chrI:10288458-10288466TATTGGAT-3.33
ceh-48MA0921.1chrI:10289191-10289199TATTGGAT-3.33
ces-2MA0922.1chrI:10288688-10288696ATACATAA+3.43
che-1MA0260.1chrI:10288676-10288681GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:10289341-10289346AAGCC+3.7
efl-1MA0541.1chrI:10289247-10289261TTATCGCGCTTGCT-3.22
elt-3MA0542.1chrI:10288764-10288771GATAACG-3.89
elt-3MA0542.1chrI:10289137-10289144GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:10288622-10288629GATAAAA-4.31
fkh-2MA0920.1chrI:10288532-10288539TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:10289277-10289284TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:10288838-10288845TGTTTTC-3.08
fkh-2MA0920.1chrI:10289036-10289043TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrI:10288664-10288671TAAACAC+3.37
fkh-2MA0920.1chrI:10289187-10289194TGTTTAT-3.81
fkh-2MA0920.1chrI:10289283-10289290TAAACAA+4.31
lim-4MA0923.1chrI:10288398-10288406GCAATTAA+3.81
lin-14MA0261.1chrI:10288414-10288419AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:10288609-10288614AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrI:10289291-10289303ATATTGCGTTGG+3.8
pal-1MA0924.1chrI:10288484-10288491TCATTAA+3.26
pal-1MA0924.1chrI:10289162-10289169TCATAAA+3.29
pal-1MA0924.1chrI:10289244-10289251TTATTAT-3.63
pal-1MA0924.1chrI:10288984-10288991TTATGAC-3.79
pal-1MA0924.1chrI:10289116-10289123TACTAAA+3
pal-1MA0924.1chrI:10288722-10288729TTCTTAC-3
pal-1MA0924.1chrI:10288399-10288406CAATTAA+4.01
pal-1MA0924.1chrI:10289274-10289281TAATAAA+4.57
pha-4MA0546.1chrI:10289150-10289159GAGTGAATA+3.1
pha-4MA0546.1chrI:10288390-10288399GTTTGCAAG-3.4
pha-4MA0546.1chrI:10288682-10288691GTGTCAATA+3.7
pha-4MA0546.1chrI:10289280-10289289AAATAAACA+3.87
unc-62MA0918.1chrI:10289010-10289021TTTGACAGCCT-3.42
unc-62MA0918.1chrI:10289058-10289069AGCTGTAACCC+3.53
unc-86MA0926.1chrI:10288821-10288828TATGAAT+3.68
vab-7MA0927.1chrI:10288617-10288624TAATTGA+3.15
vab-7MA0927.1chrI:10288399-10288406CAATTAA+3.16
vab-7MA0927.1chrI:10288484-10288491TCATTAA+3.43
zfh-2MA0928.1chrI:10288398-10288408GCAATTAAAA-3.02
zfh-2MA0928.1chrI:10288966-10288976CAAATTATTT-3.09
Enhancer Sequence
CTGAAAACTT GAGGCTGTTT GCAAGCAATT AAAATTTTTG AACATGCTGT TGAAGCTTCA 60
TATTTTCTAA AAACACTATG TATTTATTGG ATTTTTAAAA CAGTCTAAAA TCATTAAAAG 120
TCGACAAAAA AGACTACAAA ACTTAAAAAA AAGCTCAATA AAAATAGAAG CTTCGAAAAG 180
TGCGGAGCAT ACAACAAAAG AGAATGTTTA GAAAGTTGAT ACCAGTAGAA AAAGGAACAC 240
GGATAATTGA TAAAACGAGA AAAGTGGAAT CTACAAACAA GAGAAACACT TAAACACATG 300
GGGTTTCCGT GTCAATACAT AAACTTTTTG AGGTCAGGTG ACTCCTGTTT CTTACAAAAA 360
AAAACTATTC AAGTGCATTG TTTCTTCGAT GATAACGAAT TTTTGGAAAT GCCAAGAAAA 420
TGGTGGAACG GAGCAAAAAA CTTGAAGTAT GAATAGGACA CATGTGTTTT CGAGCTGTGA 480
TGCCACGAGG CACCATATGT CTCTGGCAAA TGACGTGGCA TTGTGATTTG TTGGGTGGGT 540
AAATGGGCGA GAAGATGAAT GATATGGGAA AATTCAGGGG AAAATAAAAT TTCAAATTAT 600
TTTTGAGGTT TTATGACCAA ATTTGTAGTT TTTAAGTTTG ACAGCCTACT TTTTTAAAAT 660
TATTTTTACT AAACCTTACA GCCTAGCTGT AACCCAAAAT CAGGTAGAAA AAATAGTAGA 720
ATCTTCTGGT AGACTACAGA GGTACTAAAA TTTTTAGTCT TGTGAAAAAA GTACAAGAGT 780
GAATACTATC ATAAACCCTA AAATACCCTA AAATGTTTAT TGGATTTTTC TCGCATACTA 840
AATTTCAGAA ATACCATCAT ACCATCTCAT TTATTATCGC GCTTGCTAGT AAAACGGCCG 900
TAATAAAAAT AAACAAAATA TTGCGTTGGG CCTTTATAAC AAGATTCTTT GAAATCTCGA 960
GAGAAGGAAG CCGGAA 976