EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE004-01313 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_mixed 
Coordinate
chrI:10060000-10060722 
TF binding sites/motifs
Number: 55             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:10060619-10060629AGGTGGAGAA+3.24
blmp-1MA0537.1chrI:10060371-10060381GAAAGGATAA+3.37
blmp-1MA0537.1chrI:10060331-10060341AAATGGAATA+3.3
blmp-1MA0537.1chrI:10060506-10060516AAAAAGAATG+3.52
blmp-1MA0537.1chrI:10060255-10060265GGAAGGAAAA+3.54
blmp-1MA0537.1chrI:10060388-10060398GAAGAGAGAC+3.61
blmp-1MA0537.1chrI:10060266-10060276GAAGGGAAGA+3.62
blmp-1MA0537.1chrI:10060202-10060212AAATGGAAGA+3.73
blmp-1MA0537.1chrI:10060443-10060453AAAAAGAAAT+3.93
blmp-1MA0537.1chrI:10060208-10060218AAGAGGAATA+3
blmp-1MA0537.1chrI:10060261-10060271AAAAAGAAGG+4.04
blmp-1MA0537.1chrI:10060366-10060376AGATAGAAAG+4.04
blmp-1MA0537.1chrI:10060510-10060520AGAATGAAAG+4.33
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:10060684-10060697TTAGTTTATTTAC+3.06
ceh-22MA0264.1chrI:10060058-10060068GTCAAGTGGA-5.52
ceh-48MA0921.1chrI:10060524-10060532ACCGATTG+3.13
ceh-48MA0921.1chrI:10060578-10060586TATTGGCT-3.16
ces-2MA0922.1chrI:10060014-10060022TGACACAA+3.06
ces-2MA0922.1chrI:10060327-10060335TATGAAAT-3.43
che-1MA0260.1chrI:10060489-10060494AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:10060627-10060632AAGCG+3.2
daf-12MA0538.1chrI:10060102-10060116AAATCGTGTGTGTC+3.02
daf-12MA0538.1chrI:10060108-10060122TGTGTGTCGGTATT+3.4
daf-12MA0538.1chrI:10060460-10060474AGTGTGATTGCAGA+4.06
dsc-1MA0919.1chrI:10060138-10060147CCAATTAAT+3.64
dsc-1MA0919.1chrI:10060138-10060147CCAATTAAT-3.64
elt-3MA0542.1chrI:10060667-10060674GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:10060437-10060444GATAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:10060412-10060419GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:10060346-10060360GAAATAGTAAGAGA+3.32
eor-1MA0543.1chrI:10060249-10060263ACAAGAGGAAGGAA+3.44
eor-1MA0543.1chrI:10060262-10060276AAAAGAAGGGAAGA+3.44
eor-1MA0543.1chrI:10060389-10060403AAGAGAGACGAACG+3.53
eor-1MA0543.1chrI:10060363-10060377TAGAGATAGAAAGG+3.65
eor-1MA0543.1chrI:10060438-10060452ATAAGAAAAAGAAA+3.73
eor-1MA0543.1chrI:10060496-10060510ATGAGACACAAAAA+4.12
fkh-2MA0920.1chrI:10060242-10060249TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:10060415-10060422AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:10060690-10060697TATTTAC-3.21
fkh-2MA0920.1chrI:10060246-10060253TAAACAA+4.31
lim-4MA0923.1chrI:10060378-10060386TAATTGCT-3.15
lim-4MA0923.1chrI:10060138-10060146CCAATTAA+4.19
lin-14MA0261.1chrI:10060549-10060554TGTTC-3.14
pal-1MA0924.1chrI:10060124-10060131AAATAAA+3.12
pal-1MA0924.1chrI:10060593-10060600TTATTCC-3.15
pal-1MA0924.1chrI:10060560-10060567CTATTAC-3
pha-4MA0546.1chrI:10060239-10060248GAATAAATA+3.68
pha-4MA0546.1chrI:10060243-10060252AAATAAACA+3.79
sma-4MA0925.1chrI:10060283-10060293CTTTCTGGTT+3.32
unc-62MA0918.1chrI:10060054-10060065AAATGTCAAGT+3.35
unc-62MA0918.1chrI:10060691-10060702ATTTACAGCTT-3.36
vab-7MA0927.1chrI:10060408-10060415CAATGAA+3.08
vab-7MA0927.1chrI:10060139-10060146CAATTAA+3.7
zfh-2MA0928.1chrI:10060680-10060690AAAATTAGTT-3.03
zfh-2MA0928.1chrI:10060138-10060148CCAATTAATA-3.48
Enhancer Sequence
TGACTTTTAC TAAATGACAC AAAAAATATC TCGGAATATT TTTTGGCATT CACAAAATGT 60
CAAGTGGAAT TCATCTTTTT GTCCCATAAT TGTTTGAAGC AAAAATCGTG TGTGTCGGTA 120
TTAGAAATAA AACTTGAGCC AATTAATAGG GTCACTGTAG AGAAAAACTA CCAAAAAAAT 180
AAGAAAAATG CAAGGATGGA TGAAATGGAA GAGGAATAGT GAAGGATAGT GTCACTGCTG 240
AATAAATAAA CAAGAGGAAG GAAAAAGAAG GGAAGAATCA ATGCTTTCTG GTTGAATGTC 300
TCTGGACGAC CCAAAAGTGC GCACTTTTAT GAAATGGAAT ACTATTGAAA TAGTAAGAGA 360
GTTTAGAGAT AGAAAGGATA ATTGCTCAGA AGAGAGACGA ACGTCTTCCA ATGAAAAAAC 420
AAAATGTATT GGGATTGGAT AAGAAAAAGA AATGGGCCGA AGTGTGATTG CAGAAAAATA 480
ACTGATGCGA AACGAAATGA GACACAAAAA AGAATGAAAG TGGAACCGAT TGGTGAAACT 540
AAGACTATAT GTTCAGGTAT CTATTACCAG CTTAGAGGTA TTGGCTGAAA ATTTTATTCC 600
AAAACAATCA AAGCTTCAAA GGTGGAGAAG CGGCAATGGG GAAGATGATT CAAATCACCT 660
CTGTGGTGCT AAAAAAGCCC AAAATTAGTT TATTTACAGC TTCCGCCTAT CAGCATTTCG 720
AA 722